90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_t09173 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_t09173  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.694457  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0056  tRNA-Ser  92.94 
 
 		 88 bp  121  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0050  tRNA-Ser  92.94 
 
 		 88 bp  121  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0048  tRNA-Ser  91.76 
 
 		 88 bp  113  7.000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0065  tRNA-Ser  90.59 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.211097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0095  tRNA-Ser  90.59 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1542  tRNA-Ser  92.86 
 
 		 85 bp  99.6  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0023  tRNA-Ser  92.86 
 
 		 85 bp  99.6  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220081 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1981  tRNA-Ser  92.86 
 
 		 88 bp  99.6  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  92.86 
 
 		 88 bp  99.6  1e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1758  tRNA-Ser  92.86 
 
 		 88 bp  99.6  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0046  tRNA-Ser  86.59 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0003  tRNA-Ser  91.23 
 
 		 88 bp  73.8  0.000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6020  tRNA-Ser  95.12 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0077  tRNA-Ser  95 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.361523 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12770  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00471501  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt19  tRNA-Ser  91.49 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00413231 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0014  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0936822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0015  tRNA-Ser  84.15 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00194399  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1653  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tSer01  tRNA-Ser  91.3 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.454319  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1785  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0005  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 91 bp  58  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt15  tRNA-Ser  83.53 
 
 		 88 bp  58  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt15  tRNA-Ser  83.53 
 
 		 88 bp  58  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0028  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.208638  hitchhiker  0.00938841 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0044  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00564577 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4308  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 90 bp  54  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0054  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 90 bp  54  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0056  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 90 bp  54  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0007  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0570  tRNA-Ser  100 
 
 		 95 bp  52  0.00002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1336  tRNA-Ser  84.72 
 
 		 90 bp  50.1  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000172836  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0018  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 91 bp  50.1  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.373457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0068  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 91 bp  50.1  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000566911  normal  0.0203429 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0028  tRNA-Ser  84.06 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000693874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1335  hypothetical protein  84.72 
 
 		 126 bp  50.1  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000192923  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0105  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 91 bp  50.1  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0580188  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0094  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 91 bp  50.1  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000282706  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0097  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 91 bp  50.1  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0159037  normal  0.0335042 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0096  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 91 bp  50.1  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.127387  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0085  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 91 bp  50.1  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0945939  normal  0.0146717 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1277  tRNA-Ser  84.72 
 
 		 90 bp  50.1  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00670593  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2241  tRNA-Ser  86.11 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0013  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.694217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2328  tRNA-Ser  86.11 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0176305  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0015  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0059  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0092  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.742735  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0001  tRNA-Ser  87.23 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0140  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0059  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000260642  normal  0.0200922 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0049  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000491375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0048  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000148304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1071  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0066  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.758388  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0003  tRNA-Ser  87.23 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000308763  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0044  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.919429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0001  tRNA-Ser  87.23 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000012386 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0034  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.014999  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0033  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.210279  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0041  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.926323  normal  0.128677 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0084  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0117481  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0023  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0067  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000783692  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0118  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00112512  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.0000142144  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0039  tRNA-Ser  83.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0029  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0006  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.123019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27960  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.251504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11580  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00471501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0004  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000551383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0004  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.442962  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  86.96 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.86368  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ser-5  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0018  tRNA-Ser  83.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0054  tRNA-Ser  86.96 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0058  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0011  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0710717  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0007  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0003  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0982572  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0049  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0051  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0003  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0049  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.710241  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0051  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0067  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.978703  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>