192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_11580 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_11580  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  184  2.0000000000000003e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00471501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27960  tRNA-Ser  92.47 
 
 		 93 bp  129  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.251504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0004  tRNA-Ser  90.32 
 
 		 91 bp  107  5e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000551383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t21  tRNA-Ser  89.16 
 
 		 87 bp  89.7  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0045  tRNA-Ser  97.83 
 
 		 90 bp  83.8  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0044  tRNA-Ser  87.95 
 
 		 87 bp  81.8  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000135641  normal  0.305478 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0006  tRNA-Ser  97.67 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.123019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0007  tRNA-Ser  97.67 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4308  tRNA-Ser  95.56 
 
 		 90 bp  73.8  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0005  tRNA-Ser  95.56 
 
 		 91 bp  73.8  0.000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0056  tRNA-Ser  95.56 
 
 		 90 bp  73.8  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0054  tRNA-Ser  95.56 
 
 		 90 bp  73.8  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0004  tRNA-Ser  95.24 
 
 		 93 bp  67.9  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0658061 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0044  tRNA-Ser  95.12 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00564577 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6020  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0028  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 88 bp  65.9  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.208638  hitchhiker  0.00938841 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0037  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 91 bp  63.9  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0077  tRNA-Ser  95 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.361523 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0040  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.66072  hitchhiker  0.00010969 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0048  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 88 bp  60  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1336  tRNA-Ser  91.11 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000172836  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1335  hypothetical protein  91.11 
 
 		 126 bp  58  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000192923  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0062  tRNA-Ser  91.11 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0023  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  58  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.455185 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0055  tRNA-Ser  91.11 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.953649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0044  tRNA-Ser  91.11 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.919429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0050  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0001  tRNA-Ser  91.11 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0030  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  58  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1277  tRNA-Ser  91.11 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00670593  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0008  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 90 bp  56  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t031  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t032  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t044  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0005  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.507885  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0033  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 92 bp  54  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.374525 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0061  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0952351  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0050  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0072  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000100373  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0080  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0081  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000367206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0091  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00307776  normal  0.28235 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0080  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000011536  normal  0.292608 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0081  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000139666  normal  0.289592 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0099  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.70942  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0077  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000799433  normal  0.199277 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0078  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000673855  normal  0.197197 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0088  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00139579  hitchhiker  0.0000269185 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0059  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000119289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0060  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000594401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0044  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00391672  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0060  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0407433  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0061  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00295875  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0062  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000500445  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0040  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0094275  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0041  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00826938  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0060  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0136432  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0071  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000718864  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0082  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00228786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0081  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0080  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.247761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0072  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0140823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0070  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000322089  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0004  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 96 bp  54  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489896  normal  0.220427 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0062  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00255663  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt19  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00413231 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0014  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00196818  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0014  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0102  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256328  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0019  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000041967  decreased coverage  0.00515811 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t061  tRNA-Ser  90.48 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.011458  hitchhiker  0.000000339916 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0001  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000012386 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tSer01  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.454319  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t059  tRNA-Ser  90.48 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191448  hitchhiker  0.0000692537 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t060  tRNA-Ser  90.48 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00263589  hitchhiker  0.000000337052 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t070  tRNA-Ser  90.48 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0130156  normal  0.270394 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0089  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0065  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.211097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0075  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0265874  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0095  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0085  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0055  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.362894 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0003  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000308763  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0024  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.595817 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0001  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.110057  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0054  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000333632  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0120  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t018  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000138338  hitchhiker  0.0000000303397 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0036  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000164961  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0040  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000588297  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0045  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000150485  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0114  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000117562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0034  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0044  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.11971  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0048  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.494223  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t025  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000628867  hitchhiker  0.000000193085 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0041  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0047  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000451917  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>