298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_R0011 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_R0011  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  178  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0710717  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0021  tRNA-Ser  98.48 
 
 		 90 bp  123  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.846979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0029  tRNA-Ser  95.31 
 
 		 90 bp  103  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0695798 
 
 
-
 
NC_004311  BRAt03  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 90 bp  99.6  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.038347  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0526  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 92 bp  99.6  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0029  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 90 bp  95.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.578587  hitchhiker  0.00382784 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6557  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 90 bp  95.6  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.209709  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0051  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 90 bp  91.7  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.7492  normal  0.229095 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0061  tRNA-Ser  92.42 
 
 		 90 bp  91.7  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.388434  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0026    88.1 
 
 		 90 bp  87.7  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0760613  normal  0.460066 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0005  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 90 bp  87.7  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.507885  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0022  tRNA-Ser  88.1 
 
 		 90 bp  87.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA21  tRNA-Ser  88.1 
 
 		 90 bp  87.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213698  normal  0.11304 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0037  tRNA-Ser  88.1 
 
 		 90 bp  87.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.624734  normal  0.0421417 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0030  tRNA-Ser  88.1 
 
 		 90 bp  87.7  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.849468  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0038  tRNA-Ser  88.1 
 
 		 90 bp  87.7  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0815  tRNA-Ser  90.91 
 
 		 90 bp  83.8  0.000000000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0378889  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0043  tRNA-Ser  90.91 
 
 		 90 bp  83.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0016  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 91 bp  83.8  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0019  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 91 bp  83.8  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0016  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 91 bp  83.8  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0019  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 91 bp  83.8  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0040  tRNA-Ser  86.9 
 
 		 90 bp  79.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0006  tRNA-Ser  86.9 
 
 		 90 bp  79.8  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6020  tRNA-Ser  88.73 
 
 		 90 bp  77.8  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0094  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  75.8  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000282706  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0048  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  75.8  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000148304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0049  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  75.8  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000491375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0059  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  75.8  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000260642  normal  0.0200922 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0068  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  75.8  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000566911  normal  0.0203429 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0033  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  75.8  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.210279  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0034  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  75.8  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.014999  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0140  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  75.8  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0018  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  75.8  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.373457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0085  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  75.8  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0945939  normal  0.0146717 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0023  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  75.8  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0096  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  75.8  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.127387  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0059  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  75.8  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0067  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  75.8  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000783692  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0084  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  75.8  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0117481  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0056  tRNA-Ser  90.32 
 
 		 90 bp  75.8  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.300802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0105  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  75.8  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0580188  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0097  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  75.8  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0159037  normal  0.0335042 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0066  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  75.8  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.758388  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0092  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  75.8  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.742735  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0118  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  75.8  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00112512  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0040  tRNA-Ser  95.56 
 
 		 90 bp  73.8  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.66072  hitchhiker  0.00010969 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0072  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000100373  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0081  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147278  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t031  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t032  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t044  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0082  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00228786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0029  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 90 bp  71.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0055  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 90 bp  71.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.983952 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0062  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000500445  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0059  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000119289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0060  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0136432  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0026  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 90 bp  71.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0080  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.247761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0072  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0140823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0060  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0407433  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0044  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00391672  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0062  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00255663  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0071  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000718864  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0061  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00295875  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0058  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 90 bp  71.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0040  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0094275  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0041  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00826938  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0080  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0081  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000367206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0091  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00307776  normal  0.28235 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0080  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000011536  normal  0.292608 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0081  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000139666  normal  0.289592 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0099  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.70942  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0060  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000594401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0046  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 90 bp  71.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557666 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0070  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000322089  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0088  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00139579  hitchhiker  0.0000269185 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0077  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000799433  normal  0.199277 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0078  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000673855  normal  0.197197 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t061  tRNA-Ser  93.62 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.011458  hitchhiker  0.000000339916 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t070  tRNA-Ser  93.62 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0130156  normal  0.270394 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t060  tRNA-Ser  93.62 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00263589  hitchhiker  0.000000337052 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0042  tRNA-Ser  97.44 
 
 		 88 bp  69.9  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t059  tRNA-Ser  93.62 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191448  hitchhiker  0.0000692537 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0030  tRNA-Ser  84.88 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.993805 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0038  tRNA-Ser  93.48 
 
 		 88 bp  67.9  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0043  tRNA-Ser  97.37 
 
 		 88 bp  67.9  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0965121  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0034  tRNA-Ser  95.24 
 
 		 88 bp  67.9  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000648564  hitchhiker  0.0000599111 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0009  tRNA-Ser  88.71 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0033  tRNA-Ser  84.44 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0031  tRNA-Ser  86.49 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0058  tRNA-Ser  93.48 
 
 		 88 bp  67.9  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.345279  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0007  tRNA-Ser  97.37 
 
 		 88 bp  67.9  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0043  tRNA-Ser  93.48 
 
 		 88 bp  67.9  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0049  tRNA-Ser  93.48 
 
 		 88 bp  67.9  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0012  tRNA-Ser  86.49 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0056  tRNA-Ser  93.48 
 
 		 88 bp  67.9  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000159077  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0024  tRNA-Ser  86.49 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.771773  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>