77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_R0007 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_R0007  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12770  tRNA-Ser  92.59 
 
 		 88 bp  113  7.000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00471501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0003  tRNA-Ser  86.36 
 
 		 86 bp  73.8  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000000261436  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0033  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.341382  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_003295  RS01508  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.162951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0037  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.182504  normal  0.716043 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0044  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0059  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.98639 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0008  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0001  tRNA-Ser  97.06 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000012386 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0001  tRNA-Ser  97.06 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0004  tRNA-Ser  97.06 
 
 		 96 bp  60  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489896  normal  0.220427 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0003  tRNA-Ser  97.06 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000308763  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0822  tRNA-Ser  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0005  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 86 bp  58  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.87296e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0058  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 86 bp  58  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.337917  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t40  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA47  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.276282 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0066  tRNA-Ser  87.27 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.332689 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t09173  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.694457  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.232156  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0014  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00196818  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60250  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0044  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00564577 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0058  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.345279  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0057  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.813738  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0055  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0709169  normal  0.617884 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0056  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000159077  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0033  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0049  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0043  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0057  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.570603  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0038  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0047  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.047697  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0056  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0038  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0085  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0062  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2408  normal  0.378741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0055  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.362894 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0020  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0294133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0017  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0065  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27960  tRNA-Ser  86.27 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.251504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0004  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0015  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0005  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0038  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0031  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0040  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0038  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0957945 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0012  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0006  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291328  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0015  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNASerVIMSS1309285  tRNA-Ser  100 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0006  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0008  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.109766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0060  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0024  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.771773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0008  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0016  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266045  normal  0.745909 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0055  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.983952 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0072  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.789725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0014  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.359735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0078  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.412983 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0008  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.86368  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0054  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0055  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.953649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0040  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.66072  hitchhiker  0.00010969 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0040  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0721486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0045  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.331692  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0023  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220081 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0050  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0056  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0026  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000000712114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>