297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_R0067 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_R0067  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  178  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.978703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0031  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 90 bp  91.7  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0012  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 90 bp  91.7  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0008  tRNA-Ser  87.78 
 
 		 90 bp  91.7  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.109766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0072  tRNA-Ser  88.51 
 
 		 92 bp  87.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0637954 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0065  tRNA-Ser  88.51 
 
 		 92 bp  87.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0044  tRNA-Ser  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000135641  normal  0.305478 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0033  tRNA-Ser  86.67 
 
 		 90 bp  83.8  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t21  tRNA-Ser  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0029  tRNA-Ser  87.78 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0051  tRNA-Ser  85.56 
 
 		 90 bp  75.8  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.7492  normal  0.229095 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1336  tRNA-Ser  85.56 
 
 		 90 bp  75.8  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000172836  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1335  hypothetical protein  85.56 
 
 		 126 bp  75.8  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000192923  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1277  tRNA-Ser  85.56 
 
 		 90 bp  75.8  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00670593  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0020  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 90 bp  71.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0294133 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0039  tRNA-Ser  89.06 
 
 		 90 bp  71.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.801401  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt19  tRNA-Ser  95.35 
 
 		 88 bp  69.9  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00413231 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0014  tRNA-Ser  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0936822 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0037  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 90 bp  69.9  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6020  tRNA-Ser  95.35 
 
 		 90 bp  69.9  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0028  tRNA-Ser  95.35 
 
 		 88 bp  69.9  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.208638  hitchhiker  0.00938841 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0063  tRNA-Ser  86.67 
 
 		 88 bp  67.9  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.874124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4308  tRNA-Ser  84.44 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0046  tRNA-Ser  88.71 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0020  tRNA-Ser  84.44 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.79696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0054  tRNA-Ser  84.44 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0056  tRNA-Ser  84.44 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.300802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0056  tRNA-Ser  84.44 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0047  tRNA-Ser  84.44 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.740816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0053  tRNA-Ser  84.44 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.163245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0055  tRNA-Ser  87.88 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.953649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6026  tRNA-Ser  84.27 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.045296 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0055  tRNA-Ser  84.71 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.983952 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0019  tRNA-Ser  88.52 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0059  tRNA-Ser  93.18 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0039  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0077  tRNA-Ser  95 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.361523 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0026  tRNA-Ser  93.18 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23198  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0038  tRNA-Ser  86.11 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt15  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt15  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0468  tRNA-Ser  83.91 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0046  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000102929  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0005  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0042  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  60  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.713884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0024  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.771773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0037  tRNA-Ser  87.1 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.624734  normal  0.0421417 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0030  tRNA-Ser  87.1 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.849468  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0031  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.110532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0044  tRNA-Ser  85.56 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.919429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0046  tRNA-Ser  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0004  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.442962  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26140  tRNA-Ser  84.42 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0062  tRNA-Ser  83.53 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2408  normal  0.378741 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0008    100 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0798492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0006  tRNA-Ser  91.11 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.123019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1783  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  58  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.762858  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0060  tRNA-Ser  83.53 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0002  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0003  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0003  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0065  tRNA-Ser  83.53 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0016  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0009  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.4364  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0061  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.318482  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0015  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00194399  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA5  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0419374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0007  tRNA-Ser  91.11 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0003  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.642958  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0085  tRNA-Ser  83.53 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0072  tRNA-Ser  83.53 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.789725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0023  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220081 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0058  tRNA-Ser  83.91 
 
 		 92 bp  56  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0004  tRNA-Ser  90.91 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0004  tRNA-Ser  90.91 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0006  tRNA-Ser  90.91 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0906398  normal  0.0288361 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0031  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 95 bp  56  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0583145  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0038  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0052  tRNA-Ser  90.91 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0032  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 92 bp  56  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0576643  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0033  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 92 bp  56  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000268817  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0006  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 94 bp  54  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.71316e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0009  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.39796e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0016  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0056  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.129701  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0055  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.265922  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0006  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0776  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0954361  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0051  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000000406758  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0051  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0025  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.325911  normal  0.0387574 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0023  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000401861 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0034  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0048  tRNA-Ser  83.33 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0031  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0145328  normal  0.103161 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0056  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.124384  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0671  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0021  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00559548  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0035  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 89 bp  54  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0387862 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0068  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 94 bp  54  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>