60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_R0030 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_R0030  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  186  6e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  97.22 
 
 		 92 bp  63.9  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.110057  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1169  tRNA-Ser  97.22 
 
 		 92 bp  63.9  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000109978  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0038  tRNA-Ser  97.22 
 
 		 92 bp  63.9  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0004  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000551383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11580  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  58  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00471501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27960  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  58  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.251504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0023  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  56  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.455185 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0050  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  56  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0045  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0075  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  50.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0265874  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  50.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256328  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0089  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  50.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0085  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  50.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0102  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  50.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0055  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.362894 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t084  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0056  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000134198  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0041  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614795  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t025  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000628867  hitchhiker  0.000000193085 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t018  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000138338  hitchhiker  0.0000000303397 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0120  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0114  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000117562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0057  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000281026  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0054  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000333632  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0048  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000880643  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0111  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000122567  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0105  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000566393  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0096  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000162455  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t090  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0014  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0019  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000041967  decreased coverage  0.00515811 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0036  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000164961  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0040  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000588297  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0045  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000150485  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0042  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000792728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0048  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000959117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0043  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000142522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0049  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000282544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0044  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.11971  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0048  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.494223  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0041  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0047  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000451917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0090  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00126509  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0031  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000309112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0026  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000318313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0102  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000140281  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0096  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000137453  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0043  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 94 bp  48.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0044  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000325542  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0038  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000174054  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0046  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0037  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0055  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0044  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00564577 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0008  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0909337  hitchhiker  0.00840657 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60240  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268246  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0042  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0035  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.168355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>