137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_R0007 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_R0007  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000441599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0044  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  60  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.919429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0028  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  60  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.208638  hitchhiker  0.00938841 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.110057  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1169  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000109978  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0058  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0045  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000150485  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0046  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000102929  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0055  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.362894 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0031  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.110532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0065  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0004  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.442962  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0051  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0038  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0042  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.713884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0029  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0055  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.953649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0067  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.978703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0039  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0072  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0637954 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0001  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt013  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0080367  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0008    96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0798492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0085  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0405  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0004  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0002  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0003  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0003  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0016  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0009  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.4364  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0048  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0004  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0061  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.318482  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0102  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA5  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0419374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1783  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.762858  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0089  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0075  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0265874  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0026  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23198  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0003  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.642958  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R25  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0006  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256328  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0059  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0037  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0038  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00055942 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0045  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0909337  hitchhiker  0.00840657 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0046  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0001  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000514478  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.44549  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0043  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0613926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0047  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.018693  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0006  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.71316e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0009  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.39796e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0016  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t17  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0017  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0033  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0002  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000138039  hitchhiker  0.00000107328 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0055  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.265922  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0024  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0025  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000078606  normal  0.16194 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0032  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0034  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0006  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 96 bp  44.1  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0031  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0145328  normal  0.103161 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0032  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000491895  normal  0.21046 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0050  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0033  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.985807  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0021  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00559548  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0062  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0815  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0378889  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0006  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0057  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0018  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0009  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0526  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0037  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0675311 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0043  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0038  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0061  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.388434  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0044  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0814997  hitchhiker  0.00838863 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0023  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000401861 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0776  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0954361  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1335  hypothetical protein  96.15 
 
 		 126 bp  44.1  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000192923  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1336  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000172836  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0111  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44922  hitchhiker  0.0000655456 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0116  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0194907  hitchhiker  0.0000623575 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0035  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0387862 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0006  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0068  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504463 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0054  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000000329774  hitchhiker  1.7085e-24 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0038  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0046  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00798672  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0005  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.179049 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0038  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.231561  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0032  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0576643  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0033  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000268817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>