78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_R0002 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_R0002  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  182  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0043  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 94 bp  97.6  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0041  tRNA-Ser  86.96 
 
 		 91 bp  79.8  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614795  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0056  tRNA-Ser  86.96 
 
 		 91 bp  79.8  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000134198  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  88.24 
 
 		 88 bp  71.9  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0091  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 93 bp  63.9  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0043  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 93 bp  63.9  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000118785  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0084  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 93 bp  63.9  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.242329  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0055  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 93 bp  63.9  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0010  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.999563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0022  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0569  tRNA-Ser  85 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5657  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000573989  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0054  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000333632  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0048  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000880643  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0057  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000281026  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0119  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0043  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000240957  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0111  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000122567  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0105  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000566393  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0096  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000162455  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0090  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00126509  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0015  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0031  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000309112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0114  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000117562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0120  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0043  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0123  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.873208  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0292  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000690244  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5014  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0231487  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t018  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000138338  hitchhiker  0.0000000303397 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t025  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000628867  hitchhiker  0.000000193085 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5664  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000954474  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5799  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0081474  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0232  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00209644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5052  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000183863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0270  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4983  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 94 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310916  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0044  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.134546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0026  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000318313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0036  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000164961  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0019  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000041967  decreased coverage  0.00515811 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0039  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151181 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ser-6  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.104263  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473356  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4302  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0357702  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0040  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000588297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 94 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000756645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ser-7  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 94 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 94 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000833602  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ser-7  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 94 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000210978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 94 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0135574  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t090  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t084  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5712  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.449499  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1914  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0102  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000140281  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0096  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000137453  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0009  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.509163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0044  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000325542  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0038  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000174054  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0008  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.201006 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0047  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000451917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0041  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0048  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.494223  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0044  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.11971  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0049  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000282544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0043  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000142522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0048  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000959117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0042  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000792728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0026  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.548362  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0010  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.600875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0096  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.976218 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0657  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.96086  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0010  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.710813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0020  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000608606  hitchhiker  0.0000000136932 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>