59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_R0043 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_R0043  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000118785  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0055  tRNA-Ser  98.92 
 
 		 93 bp  176  6e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0091  tRNA-Ser  94.62 
 
 		 93 bp  145  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0084  tRNA-Ser  94.62 
 
 		 93 bp  145  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.242329  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0041  tRNA-Ser  95.74 
 
 		 91 bp  77.8  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614795  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0056  tRNA-Ser  95.74 
 
 		 91 bp  77.8  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000134198  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0043  tRNA-Ser  86.17 
 
 		 94 bp  75.8  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0002  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 92 bp  63.9  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  90.2 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0039  tRNA-Ser  90.2 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0569  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 88 bp  56  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0657  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.96086  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0026  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.548362  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0009  tRNA-Ser  90.48 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000178185  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0040  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 94 bp  50.1  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0005  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 95 bp  50.1  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0042  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00852582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA23  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 94 bp  50.1  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0658425  normal  0.252168 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0023  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 94 bp  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.309507  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0039  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 94 bp  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0368673  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0042  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 94 bp  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0039    93.94 
 
 		 94 bp  50.1  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0038  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 94 bp  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0537085  normal  0.0209317 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0054  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 95 bp  50.1  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.6985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0063  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 93 bp  48.1  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.80963  normal  0.240218 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0038  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 93 bp  48.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t15  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0530  tRNA-Ser  87.23 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.159007  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0018  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 94 bp  44.1  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0346344 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5664  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000954474  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0042  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.810595  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5799  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0081474  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0232  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00209644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5052  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000183863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0270  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0018  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0238889  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0023  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0008  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.802652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4983  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ser-6  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.104263  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5657  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000573989  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5712  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.449499  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0135574  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ser-7  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000210978  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000833602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ser-7  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000756645  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473356  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5014  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0231487  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0833  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0020  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0017  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0020  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.505104  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0043  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0123  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.873208  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0030  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 94 bp  44.1  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0292  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000690244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>