297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_R0005 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 
95 bp  188  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0054  tRNA-Ser  92.63 
 
 
95 bp  133  7.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.6985  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0042  tRNA-Ser  91.58 
 
 
93 bp  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00852582  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0042  tRNA-Ser  91.58 
 
 
94 bp  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245676  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0039  tRNA-Ser  91.58 
 
 
94 bp  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0368673  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0023  tRNA-Ser  91.58 
 
 
94 bp  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.309507  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0038  tRNA-Ser  91.58 
 
 
94 bp  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0537085  normal  0.0209317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA23  tRNA-Ser  91.58 
 
 
94 bp  117  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0658425  normal  0.252168 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0030  tRNA-Ser  90.53 
 
 
94 bp  109  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0018  tRNA-Ser  90.53 
 
 
94 bp  109  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0346344 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0039    91.01 
 
 
94 bp  105  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0040  tRNA-Ser  91.01 
 
 
94 bp  105  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0038  tRNA-Ser  100 
 
 
93 bp  89.7  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125413  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0833  tRNA-Ser  97.92 
 
 
90 bp  87.7  4e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0657  tRNA-Ser  87.37 
 
 
93 bp  87.7  4e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.96086  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0063  tRNA-Ser  97.78 
 
 
93 bp  81.8  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.80963  normal  0.240218 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0026  tRNA-Ser  95.83 
 
 
91 bp  79.8  0.0000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.548362  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  97.67 
 
 
91 bp  77.8  0.0000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.505104  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0042  tRNA-Ser  95.65 
 
 
93 bp  75.8  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.810595  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t15  tRNA-Ser  95.45 
 
 
90 bp  71.9  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0016  tRNA-Ser  95.35 
 
 
93 bp  69.9  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0068  tRNA-Ser  85.26 
 
 
94 bp  69.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.504463 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0001  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  67.9  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0032  tRNA-Ser  91.84 
 
 
94 bp  65.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0075389 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0041  tRNA-Ser  91.84 
 
 
91 bp  65.9  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.416329 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0001  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  63.9  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0020  tRNA-Ser  91.67 
 
 
91 bp  63.9  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000608606  hitchhiker  0.0000000136932 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0036  tRNA-Ser  93.02 
 
 
90 bp  61.9  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.325342  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0052  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  61.9  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  61.9  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0906398  normal  0.0288361 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0036  tRNA-Ser  93.02 
 
 
93 bp  61.9  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0004  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  61.9  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0031  tRNA-Ser  93.02 
 
 
93 bp  61.9  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.981637  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0004  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  61.9  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0060  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  61.9  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.943942 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0054  tRNA-Ser  93.02 
 
 
94 bp  61.9  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_003295  RS03460  tRNA-Ser  97.06 
 
 
91 bp  60  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0003  tRNA-Ser  97.06 
 
 
90 bp  60  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.642958  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  97.06 
 
 
90 bp  60  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0034  tRNA-Ser  97.06 
 
 
91 bp  60  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0008    97.06 
 
 
90 bp  60  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0798492  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1941  tRNA-Ser  97.06 
 
 
90 bp  60  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2014  tRNA-Ser  97.06 
 
 
90 bp  60  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0295784  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0002  tRNA-Ser  97.06 
 
 
90 bp  60  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0003  tRNA-Ser  97.06 
 
 
90 bp  60  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4609  tRNA-Ser  100 
 
 
93 bp  60  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0003  tRNA-Ser  97.06 
 
 
90 bp  60  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0016  tRNA-Ser  97.06 
 
 
90 bp  60  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0009  tRNA-Ser  97.06 
 
 
90 bp  60  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.4364  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0088  tRNA-Ser  97.06 
 
 
91 bp  60  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna38  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  60  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0033  tRNA-Ser  97.06 
 
 
91 bp  60  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.597346 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0029  tRNA-Ser  97.06 
 
 
91 bp  60  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.467256 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0062  tRNA-Ser  97.06 
 
 
91 bp  60  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0060  tRNA-Ser  97.06 
 
 
91 bp  60  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0030  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  60  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2051  tRNA-Ser  97.06 
 
 
90 bp  60  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244521  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0024  tRNA-Ser  97.06 
 
 
91 bp  60  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220366  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0062  tRNA-Ser  97.06 
 
 
91 bp  60  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA5  tRNA-Ser  97.06 
 
 
90 bp  60  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0419374  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0785  tRNA-Ser  97.06 
 
 
90 bp  60  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0533  tRNA-Ser  97.06 
 
 
90 bp  60  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0062  tRNA-Ser  97.06 
 
 
91 bp  60  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0631  tRNA-Ser  97.06 
 
 
90 bp  60  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.985518  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1078  tRNA-Ser  97.06 
 
 
90 bp  60  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0381421  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0030  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  58  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.596087  normal  0.116932 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0051  tRNA-Ser  100 
 
 
88 bp  58  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0052  tRNA-Ser  100 
 
 
88 bp  58  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.360325 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0031  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  58  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0145328  normal  0.103161 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00022  tRNA-Ser  96.88 
 
 
88 bp  56  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.183053  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00024  tRNA-Ser  96.88 
 
 
88 bp  56  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0051  tRNA-Ser  96.88 
 
 
88 bp  56  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000257936  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0053  tRNA-Ser  96.88 
 
 
88 bp  56  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000297179  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0064  tRNA-Ser  96.88 
 
 
88 bp  56  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.138222 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4662  tRNA-Ser  96.88 
 
 
90 bp  56  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0024856  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1049  tRNA-Ser  96.88 
 
 
90 bp  56  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0942593  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1064  tRNA-Ser  96.88 
 
 
90 bp  56  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2774  tRNA-Ser  96.88 
 
 
90 bp  56  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.12292  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0066  tRNA-Ser  96.88 
 
 
88 bp  56  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.355843  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1410  tRNA-Ser  96.88 
 
 
90 bp  56  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.183111 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1244  tRNA-Ser  96.88 
 
 
90 bp  56  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.423353 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0061  tRNA-Ser  96.88 
 
 
90 bp  56  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.318482  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1045  tRNA-Ser  96.88 
 
 
90 bp  56  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00618881  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2776  tRNA-Ser  96.88 
 
 
90 bp  56  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00819778  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5025  tRNA-Ser  96.88 
 
 
88 bp  56  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000128113  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1199  tRNA-Ser  96.88 
 
 
90 bp  56  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.754865 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4664  tRNA-Ser  96.88 
 
 
90 bp  56  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.016683  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5027  tRNA-Ser  96.88 
 
 
88 bp  56  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0955  tRNA-Ser  96.88 
 
 
90 bp  56  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.220816  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2101  tRNA-Ser  96.88 
 
 
90 bp  56  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.995337 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2238  tRNA-Ser  96.88 
 
 
90 bp  56  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0983  tRNA-Ser  96.88 
 
 
90 bp  56  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.55277  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2057  tRNA-Ser  96.88 
 
 
90 bp  56  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.411321  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1229  tRNA-Ser  96.88 
 
 
90 bp  56  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1015  tRNA-Ser  96.88 
 
 
90 bp  56  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2240  tRNA-Ser  96.88 
 
 
90 bp  56  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.247872 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0059  tRNA-Ser  96.77 
 
 
90 bp  54  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0070  tRNA-Ser  96.77 
 
 
88 bp  54  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.399314  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0062  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  54  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1783  tRNA-Ser  96.77 
 
 
92 bp  54  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.762858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>