72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_R0004 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_R0004  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  180  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.020254  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0007  tRNA-Ser  92 
 
 		 94 bp  67.9  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000625255  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0004  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000198819  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0007  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 95 bp  65.9  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.025626  hitchhiker  0.00000743472 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0007  tRNA-Ser  92.86 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0052  tRNA-Ser  83.52 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0001  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0042  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0046  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 91 bp  56  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000000399504  normal  0.588063 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0046  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00112591  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.323881 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0054  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00119077  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0005  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 96 bp  50.1  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0053  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 94 bp  50.1  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00121332  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0039  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0075  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781608  hitchhiker  0.00063206 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0034  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0006  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000860706  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1542  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1758  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1785  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1981  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNASerVIMSS1309347  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233561 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2353  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.448422  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0020  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000608606  hitchhiker  0.0000000136932 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0039  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000237052  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0041  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000391887  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0017  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00474021  normal  0.100605 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0004  tRNA-Ser  88.24 
 
 		 95 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000366814 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0035  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.168355  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2352  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.488752  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0024  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.107228  normal  0.17939 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNASerVIMSS1309074  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNASerVIMSS1309125  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0011  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0058  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0011  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNASerVIMSS1309192  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNASerVIMSS1309256  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.123875 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNASerVIMSS1309150  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2705  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.296774  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt18  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0057  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 97 bp  44.1  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000328562  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt19  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna043  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna117  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0035  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135088  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0024  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna009  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna016  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000103361  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4577  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0019  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0025  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.112044  normal  0.1826 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0468  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3157t  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03029  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05459  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06826  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0056  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00413677  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0040  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0037  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0675311 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2548  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.221952  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1628  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100437  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0044  tRNA-Ser  86.96 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3159t  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1106t  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1109t  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.060013  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1111t  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.797073  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1123t  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00325  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0308  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>