219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0308 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0308  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  178  1e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1783  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 92 bp  139  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.762858  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t35  tRNA-Ser  94.25 
 
 		 87 bp  133  7.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0001  tRNA-Ser  92.22 
 
 		 90 bp  123  8e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0003  tRNA-Ser  91.11 
 
 		 90 bp  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.642958  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0038  tRNA-Ser  91.11 
 
 		 90 bp  115  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA5  tRNA-Ser  91.11 
 
 		 90 bp  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0419374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0008    90 
 
 		 90 bp  107  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0798492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0002  tRNA-Ser  90 
 
 		 90 bp  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0003  tRNA-Ser  90 
 
 		 90 bp  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0003  tRNA-Ser  90 
 
 		 90 bp  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0016  tRNA-Ser  90 
 
 		 90 bp  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0009  tRNA-Ser  90 
 
 		 90 bp  107  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.4364  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0061  tRNA-Ser  90 
 
 		 90 bp  107  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.318482  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4577  tRNA-Ser  90 
 
 		 90 bp  107  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0059  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 90 bp  99.6  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0026  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 90 bp  99.6  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23198  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0001  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 90 bp  99.6  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0052  tRNA-Ser  87.78 
 
 		 90 bp  91.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0005  tRNA-Ser  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.087026  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0021  tRNA-Ser  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.146581  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNASerVIMSS1309091  tRNA-Ser  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNASerVIMSS1309205  tRNA-Ser  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.98258  normal  0.324955 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0006  tRNA-Ser  86.67 
 
 		 90 bp  83.8  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0906398  normal  0.0288361 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0016  tRNA-Ser  86.67 
 
 		 90 bp  83.8  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.25212  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0004  tRNA-Ser  86.67 
 
 		 90 bp  83.8  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0004  tRNA-Ser  86.67 
 
 		 90 bp  83.8  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0014  tRNA-Ser  86.21 
 
 		 90 bp  77.8  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0037  tRNA-Ser  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.489158 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNASerVIMSS1309375  tRNA-Ser  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.748623  hitchhiker  0.000994808 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNASerVIMSS1309106  tRNA-Ser  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNASerVIMSS1309260  tRNA-Ser  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0053  tRNA-Ser  85.56 
 
 		 90 bp  75.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0055  tRNA-Ser  85.56 
 
 		 90 bp  75.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.267129  decreased coverage  0.00667761 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0018  tRNA-Ser  95.56 
 
 		 90 bp  73.8  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00032  tRNA-Ser  95.45 
 
 		 90 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000331013  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0043  tRNA-Ser  95.45 
 
 		 90 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0020807  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2165  tRNA-Ser  95.45 
 
 		 92 bp  71.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00542927  normal  0.154256 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0057  tRNA-Ser  95.45 
 
 		 90 bp  71.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0041  tRNA-Ser  95.45 
 
 		 90 bp  71.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2065  tRNA-Ser  95.45 
 
 		 92 bp  71.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000178932  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2218  tRNA-Ser  95.45 
 
 		 92 bp  71.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00379666  normal  0.543792 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2161  tRNA-Ser  95.45 
 
 		 92 bp  71.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000713726  normal  0.978327 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0048  tRNA-Ser  95.45 
 
 		 90 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00171886  normal  0.292826 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0066  tRNA-Ser  95.45 
 
 		 90 bp  71.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75993  normal  0.681656 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5040  tRNA-Ser  95.45 
 
 		 90 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4672  tRNA-Ser  95.45 
 
 		 92 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000507057  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0023  tRNA-Ser  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNASerVIMSS1309165  tRNA-Ser  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0043  tRNA-Ser  95 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.86437  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0048  tRNA-Ser  93.18 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0798542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0047  tRNA-Ser  93.18 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0060  tRNA-Ser  91.49 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.943942 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna043  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna009  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1149  tRNA-Ser  92.86 
 
 		 92 bp  60  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000101348  hitchhiker  0.0000000000000214207 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0969  tRNA-Ser  92.86 
 
 		 92 bp  60  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000352025  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06826  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna016  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000103361  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0044  tRNA-Ser  83.33 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0032  tRNA-Ser  83.33 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna117  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2818  tRNA-Ser  92.86 
 
 		 92 bp  60  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000985587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03029  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00325  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05459  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1628  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100437  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2548  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.221952  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0004  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000198819  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0020  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.417129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0001  tRNA-Ser  82.76 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0011  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0001  tRNA-Ser  82.76 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0002  tRNA-Ser  82.76 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0010  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 92 bp  54  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000388656  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0068  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 96 bp  54  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0011  tRNA-Ser  100 
 
 		 96 bp  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000117466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 96 bp  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000013912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0002  tRNA-Ser  100 
 
 		 95 bp  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS03460  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0062  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0033  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56325  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0033  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.597346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0040  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.140248 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0034  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1941  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0024  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0062  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2014  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0295784  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0088  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0060  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0785  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0058  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1078  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0381421  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0057  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0631  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.985518  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0533  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2051  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244521  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0048  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>