149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0468 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0468  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  182  1e-44  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0001  tRNA-Ser  90.28 
 
 		 91 bp  87.7  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0042  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 91 bp  79.8  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0008  tRNA-Ser  86.21 
 
 		 90 bp  77.8  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.109766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0051  tRNA-Ser  85.06 
 
 		 90 bp  69.9  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.7492  normal  0.229095 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0038  tRNA-Ser  86.67 
 
 		 90 bp  69.9  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1277  tRNA-Ser  93.48 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00670593  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0005  tRNA-Ser  93.48 
 
 		 91 bp  67.9  0.0000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1335  hypothetical protein  93.48 
 
 		 126 bp  67.9  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000192923  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1336  tRNA-Ser  93.48 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000172836  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0037  tRNA-Ser  85.53 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.624734  normal  0.0421417 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0030  tRNA-Ser  85.53 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.849468  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0055  tRNA-Ser  85.53 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.983952 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0056  tRNA-Ser  88.14 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.300802  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t031  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t032  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t044  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4308  tRNA-Ser  85.33 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t21  tRNA-Ser  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0031  tRNA-Ser  84.34 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0005  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.507885  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0012  tRNA-Ser  84.34 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0080  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0081  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000367206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0091  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00307776  normal  0.28235 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0080  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000011536  normal  0.292608 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0081  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000139666  normal  0.289592 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0099  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.70942  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0077  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000799433  normal  0.199277 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0078  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000673855  normal  0.197197 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0088  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00139579  hitchhiker  0.0000269185 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0059  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000119289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0060  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000594401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0056  tRNA-Ser  85.33 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0044  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00391672  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0060  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0407433  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0061  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00295875  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0062  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000500445  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0054  tRNA-Ser  85.33 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0040  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0094275  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0041  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00826938  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0060  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0136432  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0067  tRNA-Ser  83.91 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.978703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0062  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00255663  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0070  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000322089  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0071  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000718864  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0072  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000100373  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0072  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0140823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0080  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.247761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0081  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0082  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00228786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0029  tRNA-Ser  92.86 
 
 		 90 bp  60  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0026  tRNA-Ser  92.86 
 
 		 90 bp  60  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30420  tRNA-Ser  85.14 
 
 		 87 bp  60  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t070  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 91 bp  60  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0130156  normal  0.270394 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t061  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 91 bp  60  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.011458  hitchhiker  0.000000339916 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0015  tRNA-Ser  85.14 
 
 		 90 bp  60  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.369834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t060  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 91 bp  60  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00263589  hitchhiker  0.000000337052 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2605  tRNA-Ser  85.14 
 
 		 92 bp  60  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164026  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6020  tRNA-Ser  91.3 
 
 		 90 bp  60  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t059  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 91 bp  60  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191448  hitchhiker  0.0000692537 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0024  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 90 bp  60  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.771773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0029  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0040  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.66072  hitchhiker  0.00010969 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0059  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0044  tRNA-Ser  89.36 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000135641  normal  0.305478 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0077  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.361523 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0007  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0063  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.874124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1368  tRNA-Ser  90 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0019  tRNA-Ser  86.44 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282273 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0006  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.123019  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t60  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0110134 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0045  tRNA-Ser  83.78 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R47  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00483032  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0011  tRNA-Ser  83.78 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0710717  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0064  tRNA-Ser  83.78 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0046  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52557  normal  0.0292878 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0049  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123385 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0091  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000323323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0048  tRNA-Ser  89.13 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0051  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.794594  normal  0.436423 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0074  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.982484  normal  0.493947 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0005  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.87296e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0022  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.587921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0004  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000551383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0046  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4245  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123139  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27960  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.251504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11580  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00471501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0073  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000673451  normal  0.952088 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1445  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000299602  normal  0.74415 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0068  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.639898  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0058  tRNA-Ser  90 
 
 		 86 bp  48.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.337917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0058  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0014  tRNA-Ser  88.64 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00196818  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0822  tRNA-Ser  82.89 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0055  tRNA-Ser  83.82 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.953649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0006  tRNA-Ser  82.89 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0046  tRNA-Ser  82.89 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557666 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>