145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2352 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2352  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  180  4e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.488752  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2353  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  180  4e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.448422  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2705  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  180  4e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.296774  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0096  tRNA-Ser  92.05 
 
 		 91 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.127387  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0097  tRNA-Ser  92.05 
 
 		 91 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0159037  normal  0.0335042 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0059  tRNA-Ser  91.86 
 
 		 91 bp  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0067  tRNA-Ser  91.86 
 
 		 91 bp  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000783692  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0084  tRNA-Ser  91.86 
 
 		 91 bp  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0117481  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0018  tRNA-Ser  90.91 
 
 		 91 bp  111  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.373457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0068  tRNA-Ser  90.91 
 
 		 91 bp  111  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000566911  normal  0.0203429 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0085  tRNA-Ser  90.91 
 
 		 91 bp  111  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0945939  normal  0.0146717 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0094  tRNA-Ser  90.91 
 
 		 91 bp  111  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000282706  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0105  tRNA-Ser  90.91 
 
 		 91 bp  111  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0580188  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0023  tRNA-Ser  89.53 
 
 		 91 bp  99.6  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0033  tRNA-Ser  89.53 
 
 		 91 bp  99.6  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.210279  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0034  tRNA-Ser  89.53 
 
 		 91 bp  99.6  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.014999  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0048  tRNA-Ser  89.53 
 
 		 91 bp  99.6  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000148304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0049  tRNA-Ser  89.53 
 
 		 91 bp  99.6  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000491375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0059  tRNA-Ser  89.53 
 
 		 91 bp  99.6  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000260642  normal  0.0200922 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0140  tRNA-Ser  89.53 
 
 		 91 bp  99.6  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1123t  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 88 bp  89.7  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1109t  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 88 bp  89.7  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.060013  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1106t  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 88 bp  89.7  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3159t  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 88 bp  89.7  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1111t  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 88 bp  89.7  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.797073  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3157t  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 88 bp  89.7  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1628  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 91 bp  87.7  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100437  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2548  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 91 bp  87.7  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.221952  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna009  tRNA-Ser  86.36 
 
 		 91 bp  79.8  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna043  tRNA-Ser  86.36 
 
 		 91 bp  79.8  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna117  tRNA-Ser  86.36 
 
 		 91 bp  79.8  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna016  tRNA-Ser  86.36 
 
 		 91 bp  79.8  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000103361  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0032  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 91 bp  79.8  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000241794  hitchhiker  0.000000080319 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0033  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 91 bp  79.8  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323834  hitchhiker  0.00000000664377 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00325  tRNA-Ser  97.67 
 
 		 88 bp  77.8  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03029  tRNA-Ser  97.67 
 
 		 88 bp  77.8  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05459  tRNA-Ser  97.67 
 
 		 88 bp  77.8  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06826  tRNA-Ser  97.67 
 
 		 88 bp  77.8  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0066  tRNA-Ser  87.21 
 
 		 90 bp  75.8  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.758388  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0092  tRNA-Ser  87.21 
 
 		 90 bp  75.8  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.742735  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0118  tRNA-Ser  87.21 
 
 		 90 bp  75.8  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00112512  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0042  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 91 bp  71.9  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000190684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0044  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 91 bp  71.9  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.11052  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  95 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1542  tRNA-Ser  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1785  tRNA-Ser  95 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1758  tRNA-Ser  95 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1981  tRNA-Ser  95 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0022  tRNA-Ser  91.3 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000743808  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0011  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0710717  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t070  tRNA-Ser  85.51 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0130156  normal  0.270394 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0002  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 89 bp  58  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000425968  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t061  tRNA-Ser  85.51 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.011458  hitchhiker  0.000000339916 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tSer03  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 93 bp  58  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000286931  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0044  tRNA-Ser  85.51 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00391672  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0060  tRNA-Ser  85.51 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0407433  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0061  tRNA-Ser  85.51 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00295875  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t060  tRNA-Ser  85.51 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00263589  hitchhiker  0.000000337052 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0062  tRNA-Ser  85.51 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00255663  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0070  tRNA-Ser  85.51 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000322089  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0071  tRNA-Ser  85.51 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000718864  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0072  tRNA-Ser  85.51 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0140823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0080  tRNA-Ser  85.51 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.247761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0081  tRNA-Ser  85.51 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147278  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.813738  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0007  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0028  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000693874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0044  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.919429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2241  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 92 bp  56  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0043  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0965121  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2328  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 92 bp  56  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0176305  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0042  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0040  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.66072  hitchhiker  0.00010969 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1653  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0055  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.953649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0038  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0957945 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0049  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0047  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.047697  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0038  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0058  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.345279  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0056  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000159077  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0043  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0029  tRNA-Ser  90.48 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124844  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t031  tRNA-Ser  86.79 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t044  tRNA-Ser  86.79 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0080  tRNA-Ser  86.79 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0081  tRNA-Ser  86.79 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000367206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0080  tRNA-Ser  86.79 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000011536  normal  0.292608 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0081  tRNA-Ser  86.79 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000139666  normal  0.289592 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0077  tRNA-Ser  86.79 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000799433  normal  0.199277 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0078  tRNA-Ser  86.79 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000673855  normal  0.197197 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0088  tRNA-Ser  86.79 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00139579  hitchhiker  0.0000269185 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0059  tRNA-Ser  86.79 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000119289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0060  tRNA-Ser  86.79 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000594401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0062  tRNA-Ser  86.79 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000500445  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0040  tRNA-Ser  86.79 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0094275  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0041  tRNA-Ser  86.79 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00826938  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0060  tRNA-Ser  86.79 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0136432  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0082  tRNA-Ser  86.79 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00228786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t059  tRNA-Ser  86.79 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191448  hitchhiker  0.0000692537 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>