167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_R0026 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_R0026  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  178  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.215798  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0047  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 90 bp  87.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.519672  normal  0.91876 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27190  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000521392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2302  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 92 bp  79.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000177345  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0012  tRNA-Ser  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60240  tRNA-Ser  87.67 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268246  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0057  tRNA-Ser  87.01 
 
 		 90 bp  73.8  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tSer01  tRNA-Ser  87.14 
 
 		 93 bp  67.9  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0568907  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt11  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644598  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0033  tRNA-Ser  86.3 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0067  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0033  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56325  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0911  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.531015  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1009  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 92 bp  65.9  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0025  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00148437  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0027  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.5818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0004  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000198819  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0040  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.140248 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0032  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 93 bp  61.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0034  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 93 bp  61.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.355586  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna37  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 93 bp  61.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0033  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 93 bp  61.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07713  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0007  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0166763  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0006  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 91 bp  56  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.22052e-25 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0055  tRNA-Ser  83.75 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0002  tRNA-Ser  85.23 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.320544  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0044  tRNA-Ser  83.75 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0006  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 91 bp  56  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0059  tRNA-Ser  83.75 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00206074  hitchhiker  0.00144451 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0051  tRNA-Ser  83.75 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00319398  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0040  tRNA-Ser  83.75 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0046  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0134  tRNA-Ser  85.06 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.756856  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0021  tRNA-Ser  88.61 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.146581  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0317  tRNA-Ser  84 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNASerVIMSS1309091  tRNA-Ser  88.61 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0060  tRNA-Ser  84 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000793536  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0001  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tSer03  tRNA-Ser  82.56 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.666732 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0001  tRNA-Ser  87.21 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNASerVIMSS1309260  tRNA-Ser  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0042  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.121503  normal  0.0171671 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0001  tRNA-Ser  87.21 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNASerVIMSS1309375  tRNA-Ser  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.748623  hitchhiker  0.000994808 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00022  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.183053  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00024  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0051  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000257936  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0053  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000297179  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1199  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.754865 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1410  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.183111 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1229  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2057  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.411321  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0955  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.220816  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1049  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0942593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1015  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1045  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00618881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0983  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.55277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0048  tRNA-Ser  83.12 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0798542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0047  tRNA-Ser  83.12 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0023  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  50.1  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0167  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  50.1  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1831  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  50.1  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.399609  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2240  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.247872 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0043  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.027845  normal  0.0982553 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0044  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0279967  normal  0.0982553 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2776  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00819778  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2774  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.12292  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1064  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1244  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.423353 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0004  tRNA-Ser  83.56 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.888303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4662  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0024856  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4664  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.016683  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5025  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000128113  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5027  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0064  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.138222 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0066  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.355843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2101  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.995337 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2238  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0014  tRNA-Ser  83.33 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.359735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0051  tRNA-Ser  82.5 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.656743  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0048  tRNA-Ser  82.5 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0043  tRNA-Ser  82.5 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00175988  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0045  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000150485  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0034  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0031  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0145328  normal  0.103161 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0002  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00130042  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0057  tRNA-Ser  82.5 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159641  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1765  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.393275  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0006  tRNA-Ser  90 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0056  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607701  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0038  tRNA-Ser  82.14 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0010  tRNA-Ser  82.14 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.999563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2089  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.835616  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4233  tRNA-Ser  82.5 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0051  tRNA-Ser  82.14 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000000406758  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0001  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000971993  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0022  tRNA-Ser  82.5 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.058085  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0055  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ser-7  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 94 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000210978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>