179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0317 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007984  BCI_0317  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  178  1e-43  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t28  tRNA-Ser  86.08 
 
 		 90 bp  69.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0189168  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA35  tRNA-Ser  86.08 
 
 		 90 bp  69.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189455  normal  0.46537 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0003  tRNA-Ser  97.3 
 
 		 92 bp  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0044  tRNA-Ser  83.91 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0040  tRNA-Ser  83.91 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0055  tRNA-Ser  83.91 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27190  tRNA-Ser  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000521392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0051  tRNA-Ser  83.91 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00319398  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0057  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2302  tRNA-Ser  83.91 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000177345  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  56  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0897  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 95 bp  56  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000417881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0203  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 93 bp  56  0.000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.829329  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tSer02  tRNA-Ser  100 
 
 		 97 bp  56  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0054  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 93 bp  56  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000000379646  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4271  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 95 bp  56  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  9.700030000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0060  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000793536  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_004311  BRAt11  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644598  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0041  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R29  tRNA-Ser  84 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1096  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0067  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tSer01  tRNA-Ser  82.76 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0568907  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0911  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.531015  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0026  tRNA-Ser  84 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.215798  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1009  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 92 bp  54  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0027  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.5818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0025  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00148437  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.179799  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t038  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt13  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt13  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0023  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0026  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.548362  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0057  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.328322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0021  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.146581  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0040  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.140248 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2453  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0048  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000235294  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0657  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.96086  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0033  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56325  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t084  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0175155  normal  0.0606382 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0086  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0257958  normal  0.0951833 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0086  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0207844  normal  0.661089 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0002  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00386906  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0059  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00759198  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0083  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0290175  normal  0.180812 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0058  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.325073  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0057  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154466  normal  0.0269773 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNASerVIMSS1309091  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNASerVIMSS1309106  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0041  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.142753  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0040  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.469236  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNASerVIMSS1309165  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0043  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.027845  normal  0.0982553 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0044  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0279967  normal  0.0982553 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0048  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.17387  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0078  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000727042  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0004  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000327404  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna105  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000135439  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0049  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000614407  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4234  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.460251  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.087026  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0035  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135088  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0032  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  50.1  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0075389 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0008  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.183333  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNASerVIMSS1309205  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.98258  normal  0.324955 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0041  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.416329 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0007  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 94 bp  50.1  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.12584  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0008  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0060  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0004  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.888303  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  82.89 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.250098  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0886  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  48.1  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000841076  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  48.1  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.505104  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt18  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt19  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0046  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0025  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  48.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0015  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  48.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0019  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0058  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0656  tRNA-Ser  100 
 
 		 95 bp  48.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0057  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0027  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 93 bp  48.1  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0000624593  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0008  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1071  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0022  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  48.1  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.155688  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0020  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  48.1  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000716898  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0041  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.592847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0021  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 93 bp  48.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.724963  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0015  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  48.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0041  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0253572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0072  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 93 bp  48.1  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00236568  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0993  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000644963  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0014  tRNA-Ser  100 
 
 		 96 bp  48.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000019033  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0025  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 93 bp  48.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00144133  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0058  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0471  tRNA-Ser  83.58 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>