9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_R0047 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_R0047  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  178  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.519672  normal  0.91876 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0026  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 90 bp  87.7  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.215798  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0012  tRNA-Ser  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0043  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  54  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0613926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tSer03  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.666732 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tSer01  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0568907  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0448  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.359663  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0033  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0041  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.592847  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>