33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_R0004 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_R0004  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.558819  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0004  tRNA-Ser  90.91 
 
 		 91 bp  111  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.231832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0054  tRNA-Ser  87.78 
 
 		 93 bp  75.8  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0731881 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0014  tRNA-Ser  87.88 
 
 		 91 bp  67.9  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0013  tRNA-Ser  87.88 
 
 		 91 bp  67.9  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03630  tRNA-Ser  86.96 
 
 		 88 bp  65.9  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187343  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  89.36 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.44549  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_513  tRNA-Ser  89.36 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0009  tRNA-Ser  89.36 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0004  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1368  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0046  tRNA-Ser  86.76 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0051  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0333469  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.232156  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0005  tRNA-Ser  86.27 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07010  tRNA-Ser  83.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5672  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000146838  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ser-6  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 95 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000600892  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 95 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00887784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ser-7  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 95 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000630306  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.87296e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0039  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0101  tRNA-Ser  86.96 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.174048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000655937  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0601  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000039109  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0001  tRNA-Ser  86.96 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00401168  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0006  tRNA-Ser  86.96 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.121639  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0116  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561727  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0075  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0078  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000549409  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0525  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.48136e-28 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4776  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000022881  hitchhiker  0.0000000000000230511 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5707  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000958315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>