199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_R0045 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_R0045  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0007  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 87 bp  95.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0006  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 87 bp  95.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.123019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11580  tRNA-Ser  97.83 
 
 		 93 bp  83.8  0.000000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00471501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27960  tRNA-Ser  97.83 
 
 		 93 bp  83.8  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.251504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0004  tRNA-Ser  97.83 
 
 		 91 bp  83.8  0.000000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000551383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0004  tRNA-Ser  97.73 
 
 		 93 bp  79.8  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0658061 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0048  tRNA-Ser  97.37 
 
 		 88 bp  67.9  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4308  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0044  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000135641  normal  0.305478 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t21  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1336  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000172836  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1277  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00670593  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0062  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1335  hypothetical protein  93.33 
 
 		 126 bp  65.9  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000192923  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0001  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0005  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 91 bp  65.9  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0056  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0054  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0033  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.374525 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0095  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0065  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.211097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tSer01  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.454319  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6020  tRNA-Ser  91.11 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0003  tRNA-Ser  91.11 
 
 		 86 bp  58  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000000261436  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0028  tRNA-Ser  91.11 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.208638  hitchhiker  0.00938841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0050  tRNA-Ser  91.11 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0044  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00564577 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0077  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.361523 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0029  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0060  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100748  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0040  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.66072  hitchhiker  0.00010969 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0022  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000743808  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.110057  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.232156  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0003  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt15  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt15  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0909337  hitchhiker  0.00840657 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0037  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1169  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000109978  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0045  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000150485  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0030  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0023  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0038  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0042  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000190684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0034  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000648564  hitchhiker  0.0000599111 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0004  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0044  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.11052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0044  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.919429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0001  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00401168  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0032  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000241794  hitchhiker  0.000000080319 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0033  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323834  hitchhiker  0.00000000664377 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0101  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.174048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0058  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0032  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0063  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.874124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0001  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t031  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t032  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t044  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0020  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.565194  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0018  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0081  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0004  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0554564  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0010  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.216172  normal  0.054895 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0061  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0952351  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0050  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0080  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.247761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0026  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0080  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0081  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000367206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0091  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00307776  normal  0.28235 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0080  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000011536  normal  0.292608 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0081  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000139666  normal  0.289592 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0099  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.70942  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0072  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0140823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0077  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000799433  normal  0.199277 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0078  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000673855  normal  0.197197 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0088  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00139579  hitchhiker  0.0000269185 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0072  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000100373  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0007  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000441599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0059  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000119289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0060  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000594401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0082  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00228786  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0011  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000337805  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0015  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0047  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.548242 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNASerVIMSS1309189  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0044  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00391672  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0060  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0407433  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0061  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00295875  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0062  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000500445  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0001  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0040  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0094275  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0041  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00826938  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0060  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0136432  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0070  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000322089  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0005  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.507885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>