142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_R0061 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_R0061  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  180  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0952351  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t031  tRNA-Ser  90.11 
 
 		 91 bp  109  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t032  tRNA-Ser  90.11 
 
 		 91 bp  109  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t044  tRNA-Ser  90.11 
 
 		 91 bp  109  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0060  tRNA-Ser  91.21 
 
 		 90 bp  109  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100748  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0080  tRNA-Ser  90.11 
 
 		 91 bp  109  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0081  tRNA-Ser  90.11 
 
 		 91 bp  109  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000367206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0091  tRNA-Ser  90.11 
 
 		 91 bp  109  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00307776  normal  0.28235 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0080  tRNA-Ser  90.11 
 
 		 91 bp  109  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000011536  normal  0.292608 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0081  tRNA-Ser  90.11 
 
 		 91 bp  109  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000139666  normal  0.289592 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0099  tRNA-Ser  90.11 
 
 		 91 bp  109  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.70942  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0077  tRNA-Ser  90.11 
 
 		 91 bp  109  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000799433  normal  0.199277 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0078  tRNA-Ser  90.11 
 
 		 91 bp  109  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000673855  normal  0.197197 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0088  tRNA-Ser  90.11 
 
 		 91 bp  109  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00139579  hitchhiker  0.0000269185 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0059  tRNA-Ser  90.11 
 
 		 91 bp  109  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000119289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0060  tRNA-Ser  90.11 
 
 		 91 bp  109  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000594401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0062  tRNA-Ser  90.11 
 
 		 91 bp  109  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000500445  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0040  tRNA-Ser  90.11 
 
 		 91 bp  109  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0094275  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0041  tRNA-Ser  90.11 
 
 		 91 bp  109  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00826938  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0060  tRNA-Ser  90.11 
 
 		 91 bp  109  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0136432  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0072  tRNA-Ser  90.11 
 
 		 91 bp  109  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000100373  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0082  tRNA-Ser  90.11 
 
 		 91 bp  109  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00228786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t059  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  107  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191448  hitchhiker  0.0000692537 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0033  tRNA-Ser  89.01 
 
 		 91 bp  101  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.210279  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0034  tRNA-Ser  89.01 
 
 		 91 bp  101  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.014999  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0048  tRNA-Ser  89.01 
 
 		 91 bp  101  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000148304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0049  tRNA-Ser  89.01 
 
 		 91 bp  101  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000491375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0059  tRNA-Ser  89.01 
 
 		 91 bp  101  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000260642  normal  0.0200922 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0140  tRNA-Ser  89.01 
 
 		 91 bp  101  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0044  tRNA-Ser  89.87 
 
 		 91 bp  93.7  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00391672  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0060  tRNA-Ser  89.87 
 
 		 91 bp  93.7  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0407433  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0061  tRNA-Ser  89.87 
 
 		 91 bp  93.7  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00295875  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0062  tRNA-Ser  89.87 
 
 		 91 bp  93.7  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00255663  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0070  tRNA-Ser  89.87 
 
 		 91 bp  93.7  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000322089  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0071  tRNA-Ser  89.87 
 
 		 91 bp  93.7  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000718864  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0072  tRNA-Ser  89.87 
 
 		 91 bp  93.7  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0140823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0080  tRNA-Ser  89.87 
 
 		 91 bp  93.7  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.247761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0081  tRNA-Ser  89.87 
 
 		 91 bp  93.7  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t070  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 91 bp  91.7  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0130156  normal  0.270394 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t061  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 91 bp  91.7  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.011458  hitchhiker  0.000000339916 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t060  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 91 bp  91.7  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00263589  hitchhiker  0.000000337052 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0059  tRNA-Ser  86.81 
 
 		 91 bp  85.7  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0067  tRNA-Ser  86.81 
 
 		 91 bp  85.7  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000783692  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0084  tRNA-Ser  86.81 
 
 		 91 bp  85.7  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0117481  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0023  tRNA-Ser  86.81 
 
 		 91 bp  85.7  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0094  tRNA-Ser  86.81 
 
 		 91 bp  85.7  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000282706  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0105  tRNA-Ser  86.81 
 
 		 91 bp  85.7  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0580188  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0096  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 91 bp  77.8  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.127387  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0097  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 91 bp  77.8  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0159037  normal  0.0335042 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna009  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0022  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 90 bp  69.9  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000743808  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0018  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.373457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0068  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000566911  normal  0.0203429 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna016  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000103361  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna043  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0085  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0945939  normal  0.0146717 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna117  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0066  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.758388  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0092  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.742735  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0118  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00112512  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0040  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.66072  hitchhiker  0.00010969 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4308  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0034  tRNA-Ser  84.52 
 
 		 91 bp  63.9  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.248772  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0056  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0054  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00325  tRNA-Ser  84.09 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03029  tRNA-Ser  84.09 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05459  tRNA-Ser  84.09 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06826  tRNA-Ser  84.09 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0005  tRNA-Ser  91.49 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.507885  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1628  tRNA-Ser  83.52 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100437  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2548  tRNA-Ser  83.52 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.221952  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0034  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000648564  hitchhiker  0.0000599111 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0044  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000135641  normal  0.305478 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t21  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0011  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0710717  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0020  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.79696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0018  tRNA-Ser  86.11 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6026  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.045296 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0046  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00798672  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0029  tRNA-Ser  85.92 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0026  tRNA-Ser  85.92 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27960  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.251504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0021  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0004  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000551383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11580  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00471501  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt15  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt15  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6020  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0038  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0038  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1109t  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.060013  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0030  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00350968  decreased coverage  0.0000118989 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0025  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.217878  normal  0.142788 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0100  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 96 bp  50.1  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.170842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1106t  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1111t  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.797073  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6042  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0035  tRNA-Ser  84.72 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0387862 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0059  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000963378  hitchhiker  0.00000000000285313 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>