More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1473 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1796  L-idonate regulatory protein  99.09 
 
 		 330 aa  674    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.248054 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1578  LacI family transcription regulator  99.39 
 
 		 330 aa  676    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1473  L-idonate regulatory protein  100 
 
 		 330 aa  680    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3289  LacI family transcription regulator  70 
 
 		 327 aa  492  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4829  HTH-type transcriptional regulator IdnR  50.3 
 
 		 332 aa  349  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.284296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4736  HTH-type transcriptional regulator IdnR  50 
 
 		 332 aa  348  7e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.125842 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4885  HTH-type transcriptional regulator IdnR  50 
 
 		 332 aa  348  8e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4766  HTH-type transcriptional regulator IdnR  50 
 
 		 332 aa  348  8e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0280559  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4866  HTH-type transcriptional regulator IdnR  50 
 
 		 332 aa  347  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0303981  normal  0.118687 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0224  transcriptional regulator, LacI family  52.11 
 
 		 332 aa  345  5e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04130  DNA-binding transcriptional repressor, 5-gluconate-binding  49.1 
 
 		 332 aa  341  1e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.845114  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3733  transcriptional regulator, LacI family  49.1 
 
 		 332 aa  341  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4520  transcriptional regulator IdnR  49.1 
 
 		 332 aa  340  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000192749  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4745  transcriptional regulator IdnR  48.8 
 
 		 332 aa  339  4e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.21306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4022  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  45.02 
 
 		 331 aa  303  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2770  transcriptional regulator, LacI family  45.92 
 
 		 331 aa  301  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4104  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  45.02 
 
 		 331 aa  300  3e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0277  transcriptional regulator, LacI family  45.02 
 
 		 331 aa  290  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4754  transcriptional regulator GntR  45.02 
 
 		 331 aa  290  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.939154  normal  0.56413 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0275  LacI family transcription regulator  45.02 
 
 		 331 aa  290  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3637  transcriptional regulator GntR  45.02 
 
 		 331 aa  290  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.4011  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3721  transcriptional regulator GntR  45.02 
 
 		 331 aa  290  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3846  LacI family transcription regulator  45.02 
 
 		 331 aa  290  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.58256 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3732  transcriptional regulator GntR  45.02 
 
 		 331 aa  289  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3852  transcriptional regulator GntR  45.02 
 
 		 353 aa  289  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3810  transcriptional regulator GntR  45.02 
 
 		 353 aa  289  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3912  transcriptional regulator GntR  45.02 
 
 		 353 aa  289  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.39666 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3743  transcriptional regulator GntR  45.02 
 
 		 353 aa  289  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0298  gluconate utilization operon repressor  44.55 
 
 		 333 aa  288  9e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03289  DNA-binding transcriptional repressor  44.71 
 
 		 331 aa  287  2e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.58674  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03242  hypothetical protein  44.71 
 
 		 331 aa  287  2e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766873  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3916  transcriptional regulator GntR  44.71 
 
 		 331 aa  287  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4652  LacI family transcription regulator  43.5 
 
 		 343 aa  286  5e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.478263 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4176  LacI family transcription regulator  43.94 
 
 		 332 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3980  transcriptional regulator, LacI family  43.94 
 
 		 332 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4089  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  43.94 
 
 		 332 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3887  transcriptional regulator GntR  44.71 
 
 		 331 aa  285  7e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.917032  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0694  regulatory protein LacI  42.3 
 
 		 350 aa  281  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0134  LacI family transcription regulator  44.23 
 
 		 312 aa  281  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0668  HTH-type transcriptional regulator GntR (gluconate utilization system Gnt-I transcriptional repressor)  42.12 
 
 		 337 aa  280  2e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.275701  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4058  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  43.33 
 
 		 332 aa  278  7e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00507  transcriptional regulator  42.12 
 
 		 335 aa  276  4e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001964  gluconate utilization system Gnt-I transcriptional repressor  41.82 
 
 		 335 aa  275  6e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.515021  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3944  transcriptional regulator, LacI family  41.46 
 
 		 332 aa  266  4e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2667  gluconate utilization system gnt-I transcriptional repressor  40.61 
 
 		 332 aa  265  5.999999999999999e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2929  transcriptional regulator, periplasmic binding protein of LacI family protein  42.12 
 
 		 336 aa  265  8e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.226433  normal  0.301245 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0215  transcriptional regulator, LacI family  39.76 
 
 		 332 aa  260  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0265  transcriptional regulator, LacI family  40.96 
 
 		 331 aa  259  4e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.01376  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3552  LacI family transcription regulator  34.56 
 
 		 356 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0957  LacI family transcription regulator  36 
 
 		 344 aa  202  7e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155572  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0927  LacI family transcription regulator  35.16 
 
 		 335 aa  201  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0082  transcriptional regulator, LacI family  34.06 
 
 		 364 aa  199  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3336  LacI transcriptional regulator  34.16 
 
 		 338 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00746988 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0905  LacI family transcription regulator  34.75 
 
 		 335 aa  193  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000824566 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3563  gluconate utilization system GNT-I transcriptional repressor  33.54 
 
 		 338 aa  188  9e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059587  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5547  LacI family transcription regulator  34.26 
 
 		 342 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3760  LacI family transcription regulator  32.82 
 
 		 364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0180539  normal  0.0106045 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4337  LacI family transcription regulator  35.08 
 
 		 343 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34660  transcriptional regulator GntR  35.06 
 
 		 343 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.829628  normal  0.0739701 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2940  transcriptional regulator GntR  34.74 
 
 		 354 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3415  LacI family transcription regulator  33 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1236  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.91 
 
 		 364 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2347  LacI family transcriptional regulator  33 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2525  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 339 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418226  normal  0.0803967 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27300  Transcriptional regulator, LacI family  34.56 
 
 		 343 aa  176  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4651  transcriptional regulator, LacI family  34.15 
 
 		 349 aa  175  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2798  LacI family transcription regulator  31.61 
 
 		 346 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614982 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2784  LacI family transcription regulator  32.72 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6141  transcriptional regulator, LacI family  33.13 
 
 		 343 aa  169  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3341  transcriptional regulator, LacI family  33.44 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.680161  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3216  LacI family transcription regulator  31.6 
 
 		 348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1877  transcriptional regulator, LacI family  30.84 
 
 		 341 aa  166  4e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.369325  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2054  LacI family transcription regulator  30.84 
 
 		 341 aa  166  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal  0.343605 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1029  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.99 
 
 		 355 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0872  transcriptional regulator, LacI family  29.63 
 
 		 341 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2566  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.23 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.257344  hitchhiker  0.000000000070204 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1136  LacI family transcription regulator  33.94 
 
 		 335 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0764  transcriptional regulator, LacI family  30.49 
 
 		 345 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2627  LacI family transcription regulator  33.03 
 
 		 349 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0047  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.26 
 
 		 356 aa  159  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.108972 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0968  LacI family transcription regulator  31.6 
 
 		 357 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.026334  normal  0.828614 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0063  transcriptional regulator, LacI family  30.33 
 
 		 343 aa  159  9e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3695  LacI family transcription regulator  29.97 
 
 		 375 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2058  transcriptional regulator of LacI family protein  29.23 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.241657 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2582  alanine racemase  30.21 
 
 		 345 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000528226 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0778  LacI family transcription regulator  30.32 
 
 		 349 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  hitchhiker  0.00400248 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1663  LacI family transcription regulator  30.41 
 
 		 345 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0296  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.41 
 
 		 345 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3070  LacI family transcription regulator  30.55 
 
 		 338 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6297  LacI family transcription regulator  30.29 
 
 		 345 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1216  LacI family transcription regulator  30.55 
 
 		 338 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129549  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0651  LacI family transcription regulator  30.55 
 
 		 338 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1413  LacI family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 341 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.492871  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1420  LacI family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 338 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0502  LacI family transcription regulator  30.55 
 
 		 338 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1209  LacI family transcription regulator  29.94 
 
 		 341 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4322  regulatory protein LacI  32.62 
 
 		 334 aa  153  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0754  LacI family transcription regulator  29.94 
 
 		 341 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1235  LacI family transcription regulator  29.94 
 
 		 341 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2073  LacI family transcription regulator  30.25 
 
 		 341 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>