More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3005 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3005  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 453 aa  863    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3468  GntR family transcriptional regulator  75.45 
 
 		 441 aa  613  9.999999999999999e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00974022  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7670  putative transcriptional regulator, GntR family  40.38 
 
 		 496 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1257  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.19 
 
 		 494 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.285893  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0648  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.98 
 
 		 453 aa  234  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1604  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.26 
 
 		 494 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5851  transcriptional regulator  37.95 
 
 		 520 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09150  transcriptional regulator, GntR family  40.89 
 
 		 454 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.87157 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  29.83 
 
 		 470 aa  221  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1143  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 480 aa  218  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130039  normal  0.465175 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4541  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.71 
 
 		 457 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6988  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3492  GntR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 473 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249903  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1082  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  37.61 
 
 		 457 aa  209  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.029023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5145  transcriptional regulator  38.05 
 
 		 516 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2795  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.11 
 
 		 500 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77384  normal  0.599586 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.37 
 
 		 465 aa  206  7e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4617  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 516 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4833  GntR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 485 aa  204  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3060  putative transcriptional regulator, GntR family  32.53 
 
 		 464 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5991  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.76 
 
 		 456 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2075  transcriptional regulator, GntR family  29.82 
 
 		 471 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  35.23 
 
 		 489 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5015  transcriptional regulator  40.62 
 
 		 502 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.301985  normal  0.695664 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3230  transcriptional regulator, GntR family  30.67 
 
 		 471 aa  199  7e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 475 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.75 
 
 		 472 aa  199  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4874  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.77 
 
 		 470 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.661213 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 473 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000129974 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3109  GntR family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 502 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5258  GntR family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 502 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.11 
 
 		 485 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  34.75 
 
 		 509 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0395  GntR family transcriptional regulator  38 
 
 		 497 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 475 aa  196  6e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3456  transcriptional regulator  39.79 
 
 		 501 aa  196  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0246  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 507 aa  196  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0760  GntR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 490 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996679  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 509 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 494 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4441  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.03 
 
 		 490 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.944559 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0346  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 476 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 509 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0801  regulatory protein GntR, HTH  32.78 
 
 		 508 aa  194  4e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0129569  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 494 aa  194  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.12 
 
 		 485 aa  193  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0090  aminotransferase, MocR-like  28.27 
 
 		 463 aa  192  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8887  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.19 
 
 		 476 aa  192  8e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  34.61 
 
 		 494 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  35.76 
 
 		 495 aa  192  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  33.87 
 
 		 508 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2167  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 465 aa  192  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1064  transcriptional regulator  32.99 
 
 		 477 aa  192  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6846  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  37.69 
 
 		 476 aa  192  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1567  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 473 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0205  transcriptional regulator, GntR family  32.04 
 
 		 463 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146418 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.84 
 
 		 497 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 492 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 494 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 496 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 494 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0495  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 466 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0638  transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 466 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 504 aa  189  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 501 aa  189  8e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0493  GntR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 466 aa  189  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.393759  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2985  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 444 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.12333 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1658  regulatory protein GntR HTH  35.35 
 
 		 498 aa  188  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71680  GntR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 491 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2327  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.48 
 
 		 474 aa  188  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4657  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.48 
 
 		 481 aa  188  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0379669  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2919  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.18 
 
 		 444 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2950  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.18 
 
 		 444 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130328  normal  0.0175968 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0551  GntR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 466 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3002  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 444 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227723 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0582  GntR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 466 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.915495  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8727  putative transcriptional regulator, GntR family  40.69 
 
 		 473 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 490 aa  187  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0222  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.63 
 
 		 464 aa  187  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3915  transcriptional regulator, GntR family  32.56 
 
 		 444 aa  187  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0753496 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3108  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 444 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.552212  normal  0.675979 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4721  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 492 aa  187  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1558  GntR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 499 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494992  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0708  transcriptional regulator, GntR family  28.94 
 
 		 466 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1297  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 480 aa  186  5e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1424  GntR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 513 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0515  GntR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 513 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.783839  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5625  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 467 aa  186  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0638  GntR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 513 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.126771  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6219  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 491 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1456  GntR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 513 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8097  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  37.02 
 
 		 471 aa  186  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  32.27 
 
 		 476 aa  186  7e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2116  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 466 aa  186  8e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 504 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1229  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 513 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.892193  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  34.32 
 
 		 509 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3061  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 513 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.908638  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1181  GntR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 474 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.969384 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2184  transcriptional regulator, GntR family  30.26 
 
 		 466 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0348  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 495 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>