More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5991 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5991  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 456 aa  862    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09150  transcriptional regulator, GntR family  66.45 
 
 		 454 aa  506  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.87157 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0648  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  57.08 
 
 		 453 aa  403  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4541  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  56.19 
 
 		 457 aa  380  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6988  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7670  putative transcriptional regulator, GntR family  44.35 
 
 		 496 aa  355  6.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1257  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  49.57 
 
 		 494 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.285893  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1604  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.63 
 
 		 494 aa  326  5e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3468  GntR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 441 aa  238  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00974022  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 494 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 494 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 494 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 494 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3005  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.25 
 
 		 453 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  29.39 
 
 		 470 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1658  regulatory protein GntR HTH  38.03 
 
 		 498 aa  214  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 504 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 475 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.82 
 
 		 488 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2795  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.04 
 
 		 500 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77384  normal  0.599586 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.96 
 
 		 488 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 491 aa  209  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 494 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  34.75 
 
 		 509 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2233  GntR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 488 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.420665  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 501 aa  207  4e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.73 
 
 		 472 aa  207  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 501 aa  207  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3492  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 473 aa  206  8e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249903  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0760  GntR family transcriptional regulator  33.4 
 
 		 490 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.41 
 
 		 485 aa  205  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 473 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000129974 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  32.41 
 
 		 501 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 492 aa  204  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  34.13 
 
 		 495 aa  204  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  34.19 
 
 		 485 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2167  GntR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 465 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0346  GntR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 476 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  35.17 
 
 		 508 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1143  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 480 aa  199  9e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130039  normal  0.465175 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8097  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  35.73 
 
 		 471 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1082  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  35.53 
 
 		 457 aa  196  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.029023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6107  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.98 
 
 		 479 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0577831  normal  0.070905 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 509 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1682  transcriptional regulator  36.14 
 
 		 493 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4441  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.08 
 
 		 490 aa  193  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.944559 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000463  transcriptional regulator  30.67 
 
 		 467 aa  193  7e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.566945  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 504 aa  193  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 501 aa  193  7e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8887  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.64 
 
 		 476 aa  192  8e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 509 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  31.65 
 
 		 497 aa  192  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3202  GntR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 478 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416739 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0246  GntR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 507 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4833  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 485 aa  190  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0192  GntR family regulatory protein  36.14 
 
 		 570 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 492 aa  190  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1600  GntR family regulatory protein  36.14 
 
 		 493 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  30.28 
 
 		 488 aa  190  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 509 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0047  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.75 
 
 		 482 aa  189  8e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.493151  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1208  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 574 aa  189  8e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 496 aa  189  9e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5145  transcriptional regulator  35.33 
 
 		 516 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 490 aa  189  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4617  GntR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 516 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 489 aa  188  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  33.11 
 
 		 476 aa  187  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  29.18 
 
 		 499 aa  187  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3858  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.32 
 
 		 491 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5851  transcriptional regulator  33.76 
 
 		 520 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.22 
 
 		 497 aa  187  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0801  regulatory protein GntR, HTH  31.42 
 
 		 508 aa  187  5e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0129569  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0222  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.58 
 
 		 464 aa  186  6e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7128  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.17 
 
 		 507 aa  186  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4112  transcriptional regulator  34.21 
 
 		 495 aa  186  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0059  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.66 
 
 		 487 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.869186  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0200  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.04 
 
 		 470 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1434  GntR family transcriptional regulator  36.34 
 
 		 480 aa  185  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.515471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8727  putative transcriptional regulator, GntR family  39.06 
 
 		 473 aa  183  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0881  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 478 aa  183  6e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.426216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0395  GntR family transcriptional regulator  36.34 
 
 		 497 aa  183  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  33.4 
 
 		 507 aa  183  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0043  GntR family transcriptional regulator  39.95 
 
 		 492 aa  183  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5625  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 467 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5048  transcriptional regulator  31.91 
 
 		 502 aa  182  8.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.528927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3666  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.05 
 
 		 467 aa  182  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4874  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.15 
 
 		 470 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.661213 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.96 
 
 		 501 aa  182  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1071  GntR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 511 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.030835  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5015  transcriptional regulator  35.89 
 
 		 502 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.301985  normal  0.695664 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.13 
 
 		 503 aa  182  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3109  GntR family transcriptional regulator  36.34 
 
 		 502 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5258  GntR family transcriptional regulator  36.34 
 
 		 502 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0988  transcriptional regulator  36.46 
 
 		 502 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5644  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.55 
 
 		 481 aa  180  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  32.78 
 
 		 507 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1064  transcriptional regulator  31.48 
 
 		 477 aa  179  7e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 507 aa  179  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3003  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 487 aa  179  8e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0133  GntR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 502 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>