43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2511 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2511  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  677    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2491  hypothetical protein  57.85 
 
 		 342 aa  351  1e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1953  hypothetical protein  47.49 
 
 		 344 aa  219  7e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.446756  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1085  hypothetical protein  39.34 
 
 		 339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.548207  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3793  hypothetical protein  30.23 
 
 		 343 aa  89.4  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0501  hypothetical protein  33.09 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0217  hypothetical protein  30.74 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.465524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1322  putative lipoprotein  33.02 
 
 		 300 aa  53.5  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  28.65 
 
 		 421 aa  53.5  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2871  hypothetical protein  34.44 
 
 		 391 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33770  hypothetical protein  33.33 
 
 		 391 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127582  hitchhiker  0.00383681 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1241  RND family efflux transporter MFP subunit  35.71 
 
 		 417 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.975545 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1182  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.71 
 
 		 421 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272919 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1403  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.71 
 
 		 417 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424837  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6610  RND family efflux transporter MFP subunit  27.49 
 
 		 394 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.260284  normal  0.566522 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1868  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.51 
 
 		 474 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.85 
 
 		 442 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3483  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.8 
 
 		 598 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.807091  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1352  organic solvent efflux pump precursor (periplasmic linker protein component)  25.69 
 
 		 359 aa  47.8  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.896212  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  27.47 
 
 		 354 aa  46.6  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3461  secretion protein HlyD  33.33 
 
 		 384 aa  46.2  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  26.37 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0293  secretion protein HlyD  29.51 
 
 		 514 aa  45.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287992  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2871  RND family efflux transporter MFP subunit  23.64 
 
 		 357 aa  44.3  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3559  RND family efflux transporter MFP subunit  23.96 
 
 		 396 aa  44.3  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0492868  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3297  secretion protein HlyD  38.57 
 
 		 418 aa  43.9  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.07 
 
 		 390 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.337788  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5088  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.63 
 
 		 361 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.857117  normal  0.0828727 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  26.8 
 
 		 354 aa  43.5  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3304  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.26 
 
 		 414 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1715  acriflavin resistance periplasmic protein  37.8 
 
 		 357 aa  43.1  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000921401  normal  0.0591325 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  26.88 
 
 		 358 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1925  HlyD family secretion protein  27.27 
 
 		 354 aa  43.1  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  28.28 
 
 		 390 aa  43.1  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0668  RND family efflux transporter MFP subunit  25.76 
 
 		 360 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  26.37 
 
 		 354 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.37 
 
 		 354 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2521  RND family efflux transporter MFP subunit  26.37 
 
 		 354 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199325  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.14 
 
 		 350 aa  42.7  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000250075  normal  0.807389 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10570  hypothetical protein  29.59 
 
 		 305 aa  42.7  0.009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  26.88 
 
 		 358 aa  42.7  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4105  secretion protein HlyD  34.38 
 
 		 527 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0495  secretion protein HlyD  33.33 
 
 		 323 aa  42.7  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>