23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2491 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2491  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  653    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2511  hypothetical protein  59.82 
 
 		 352 aa  364  1e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1953  hypothetical protein  46.8 
 
 		 344 aa  218  8.999999999999998e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.446756  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1085  hypothetical protein  43.32 
 
 		 339 aa  203  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.548207  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3793  hypothetical protein  33 
 
 		 343 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0501  hypothetical protein  30.61 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1322  putative lipoprotein  39.13 
 
 		 300 aa  55.8  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0217  hypothetical protein  28.1 
 
 		 292 aa  54.7  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.465524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  40.28 
 
 		 421 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1144  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.71 
 
 		 368 aa  47  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000422764  normal  0.160912 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2611  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.94 
 
 		 549 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  25.4 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  26.06 
 
 		 354 aa  45.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2871  hypothetical protein  33.33 
 
 		 391 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1762  RND family efflux transporter MFP subunit  36.67 
 
 		 421 aa  44.3  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0464275  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1216  RND family efflux transporter MFP subunit  39.73 
 
 		 379 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.152303  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  24 
 
 		 381 aa  43.9  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1925  HlyD family secretion protein  24.87 
 
 		 354 aa  43.5  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3412  secretion protein HlyD  44.26 
 
 		 443 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0866166  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3561  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.62 
 
 		 420 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.306068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33770  hypothetical protein  32.18 
 
 		 391 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127582  hitchhiker  0.00383681 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  25.88 
 
 		 383 aa  42.7  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3686  RND family efflux transporter MFP subunit  36.11 
 
 		 440 aa  42.7  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98045  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>