21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0217 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0217  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  575  1.0000000000000001e-163  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.465524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1322  putative lipoprotein  29.96 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1085  hypothetical protein  32.88 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.548207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  28.49 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2511  hypothetical protein  30.74 
 
 		 352 aa  56.2  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3793  hypothetical protein  24.61 
 
 		 343 aa  52.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1007  secretion protein HlyD  28.96 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163323  normal  0.0478945 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2617  secretion protein HlyD  38.16 
 
 		 385 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000106145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0895  secretion protein HlyD  27.73 
 
 		 322 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2491  hypothetical protein  37.33 
 
 		 342 aa  46.2  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3274  putative multidrug efflux system transmembrane protein  28.67 
 
 		 225 aa  46.2  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.668414  normal  0.104011 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1295  efflux protein  45 
 
 		 405 aa  45.8  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0886  secretion protein HlyD  31 
 
 		 306 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.795308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1953  hypothetical protein  34.04 
 
 		 344 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.446756  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1419  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.77 
 
 		 387 aa  43.1  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.267588  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0212  secretion protein HlyD family protein  32 
 
 		 536 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0198  RND family efflux transporter MFP subunit  32.14 
 
 		 521 aa  43.1  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0501  hypothetical protein  37.21 
 
 		 251 aa  42.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0740  hypothetical protein  37.11 
 
 		 309 aa  42.7  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000338455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0177  secretion protein HlyD family protein  38.71 
 
 		 514 aa  42.7  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.624945  normal  0.250507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4357  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  37.1 
 
 		 514 aa  42.4  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155847  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>