41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1085 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1085  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  644    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.548207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1953  hypothetical protein  49.57 
 
 		 344 aa  249  4e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.446756  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2491  hypothetical protein  41.52 
 
 		 342 aa  189  5.999999999999999e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2511  hypothetical protein  38.7 
 
 		 352 aa  179  4e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3793  hypothetical protein  31.25 
 
 		 343 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0217  hypothetical protein  32.19 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.465524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0501  hypothetical protein  28.92 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  21.41 
 
 		 354 aa  53.9  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1322  putative lipoprotein  37.23 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2381  RND family efflux transporter MFP subunit  21.07 
 
 		 357 aa  52.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1628  RND family efflux transporter MFP subunit  26.39 
 
 		 326 aa  49.7  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2871  hypothetical protein  35.71 
 
 		 391 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0674  periplasmic linker protein  29.21 
 
 		 358 aa  49.3  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  32.65 
 
 		 376 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33770  hypothetical protein  34.52 
 
 		 391 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127582  hitchhiker  0.00383681 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2192  secretion protein HlyD  21.62 
 
 		 352 aa  47.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30 
 
 		 360 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.92 
 
 		 377 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1613  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.65 
 
 		 469 aa  46.2  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  36.54 
 
 		 405 aa  46.2  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2186  macrolide efflux protein MacA  29.01 
 
 		 428 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1169  membrane-fusion protein  23.28 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0146013  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4256  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.35 
 
 		 526 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0836  macrolide efflux protein MacA  29.01 
 
 		 435 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0404665  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2452  RND family efflux transporter MFP subunit  32.94 
 
 		 428 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01875  hypothetical protein  31.63 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  29 
 
 		 417 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0927  macrolide efflux protein MacA  29.63 
 
 		 399 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0950  secretion protein HlyD  27.01 
 
 		 384 aa  44.3  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.57805  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3271  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.1 
 
 		 380 aa  43.9  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.525557  normal  0.197401 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1715  putative cation efflux system transmembrane protein  22.29 
 
 		 500 aa  43.9  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0232855  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0041  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.25 
 
 		 378 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89791  normal  0.261432 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2611  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.15 
 
 		 549 aa  43.9  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.56 
 
 		 568 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1295  efflux protein  38.03 
 
 		 405 aa  43.5  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1440  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.14 
 
 		 374 aa  43.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0942  acriflavine resistance protein E  27.12 
 
 		 374 aa  43.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  34.34 
 
 		 455 aa  43.5  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003046  membrane-fusion protein  22.16 
 
 		 377 aa  43.1  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10570  hypothetical protein  30.11 
 
 		 305 aa  42.7  0.01  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3483  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.43 
 
 		 598 aa  42.7  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.807091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>