13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1322 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1322  putative lipoprotein  100 
 
 		 300 aa  600  1.0000000000000001e-171  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0217  hypothetical protein  29.96 
 
 		 292 aa  85.5  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.465524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2511  hypothetical protein  33.02 
 
 		 352 aa  53.5  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2491  hypothetical protein  43.48 
 
 		 342 aa  53.5  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1953  hypothetical protein  29.5 
 
 		 344 aa  53.1  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.446756  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1085  hypothetical protein  37.23 
 
 		 339 aa  52  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.548207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4231  hypothetical protein  35.14 
 
 		 514 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442876 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0177  secretion protein HlyD family protein  38.36 
 
 		 514 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.624945  normal  0.250507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4357  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  36.49 
 
 		 514 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  31.91 
 
 		 405 aa  46.2  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.35 
 
 		 397 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.49 
 
 		 381 aa  44.3  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0460  hypothetical protein  35.21 
 
 		 513 aa  43.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>