32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1953 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1953  hypothetical protein  100 
 
 		 344 aa  646    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.446756  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1085  hypothetical protein  50.45 
 
 		 339 aa  252  6e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.548207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2511  hypothetical protein  47.49 
 
 		 352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2491  hypothetical protein  45.64 
 
 		 342 aa  224  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3793  hypothetical protein  33.54 
 
 		 343 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0501  hypothetical protein  36.05 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3604  secretion protein HlyD  27.03 
 
 		 422 aa  56.2  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105186  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2871  hypothetical protein  37.35 
 
 		 391 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1322  putative lipoprotein  38.75 
 
 		 300 aa  52.8  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33770  hypothetical protein  36.14 
 
 		 391 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127582  hitchhiker  0.00383681 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0740  hypothetical protein  28.06 
 
 		 309 aa  47  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000338455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0739  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.08 
 
 		 362 aa  47  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.941037  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2466  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.67 
 
 		 396 aa  46.6  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3936  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  30.97 
 
 		 491 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0217  hypothetical protein  42.86 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.465524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0609  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.36 
 
 		 353 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.593708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0621  RND family efflux transporter MFP subunit  24.55 
 
 		 311 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000387759  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.75 
 
 		 390 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.337788  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10570  hypothetical protein  33.33 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2229  RND family efflux transporter MFP subunit  20.5 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35 
 
 		 504 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1295  efflux protein  40.28 
 
 		 405 aa  43.9  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03141  putative resistance transmembrane protein  31.46 
 
 		 449 aa  43.9  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1715  acriflavin resistance periplasmic protein  34.15 
 
 		 357 aa  43.5  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000921401  normal  0.0591325 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0142  RND family efflux transporter MFP subunit  34.55 
 
 		 389 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1721  RND family efflux transporter MFP subunit  36.71 
 
 		 431 aa  43.1  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1169  membrane-fusion protein  35.37 
 
 		 377 aa  42.7  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0146013  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3379  RND family efflux transporter MFP subunit  40.51 
 
 		 409 aa  42.7  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1501  component of copper transport system  26.76 
 
 		 404 aa  42.7  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000252405  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3721  putative membrane-fusion protein  28.57 
 
 		 569 aa  42.7  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.45383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3185  secretion protein HlyD  35.11 
 
 		 446 aa  42.7  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1102  secretion protein HlyD  34.48 
 
 		 470 aa  42.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.680161 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>