More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1464 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1464  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 
486 aa  893    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0248  putative signal transduction histidine kinase  40.4 
 
 
470 aa  219  6e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  40.95 
 
 
624 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.39 
 
 
417 aa  116  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 
586 aa  114  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0531  histidine kinase  44.98 
 
 
429 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.005431  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0329  signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 
435 aa  110  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.982298  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0811  histidine kinase  39.13 
 
 
580 aa  109  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3934  histidine kinase  41.44 
 
 
442 aa  109  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.28 
 
 
405 aa  108  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.130128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4456  histidine kinase  52.86 
 
 
410 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.6 
 
 
621 aa  108  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0319  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.2 
 
 
382 aa  107  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.099987 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4660  histidine kinase  40.49 
 
 
402 aa  106  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6138  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.1 
 
 
403 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2540  putative signal transduction histidine kinase  42.4 
 
 
570 aa  103  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35880  signal transduction histidine kinase  46.31 
 
 
454 aa  103  9e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.63 
 
 
466 aa  103  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2249  histidine kinase  47.83 
 
 
420 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2340  histidine kinase  38.86 
 
 
388 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1360  histidine kinase  40.48 
 
 
476 aa  101  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3200  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.85 
 
 
395 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2525  histidine kinase  41.47 
 
 
434 aa  100  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0362104  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3763  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 
375 aa  100  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200679  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0609  histidine kinase  45.59 
 
 
442 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0085  putative signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 
587 aa  98.2  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4415  Signal transduction histidine kinase-like protein  47.58 
 
 
386 aa  97.8  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  46.94 
 
 
429 aa  95.9  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0949  histidine kinase  41.87 
 
 
416 aa  96.3  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0199  histidine kinase  44.12 
 
 
452 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2433  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 
461 aa  95.5  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189775  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2298  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.98 
 
 
432 aa  95.1  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.783172 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.5 
 
 
398 aa  94.7  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149067  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 
386 aa  95.1  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1744  putative signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 
723 aa  94.4  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0103404 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09220  signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 
492 aa  93.2  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.253701 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5647  histidine kinase  42.65 
 
 
433 aa  92.8  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.559873  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0354  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.67 
 
 
438 aa  92.4  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2301  Histidine kinase  40.38 
 
 
412 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4050  Histidine kinase  41.31 
 
 
374 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313821  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  38.14 
 
 
463 aa  90.9  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0424  histidine kinase  44.76 
 
 
438 aa  90.9  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680525  hitchhiker  0.00719111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2507  Signal transduction histidine kinase-like protein  46.46 
 
 
405 aa  90.9  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1961  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 
444 aa  90.5  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000367534  hitchhiker  0.000000631341 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 
359 aa  90.5  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
433 aa  90.5  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3546  histidine kinase  43.17 
 
 
489 aa  89.4  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.871685 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  31.56 
 
 
772 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3908  putative signal transduction histidine kinase  43.84 
 
 
435 aa  87  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.84 
 
 
435 aa  87  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.335335  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3923  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.84 
 
 
435 aa  87  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534106  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 
565 aa  86.7  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0199075  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
408 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.849709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  37.62 
 
 
373 aa  86.7  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6198  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.65 
 
 
415 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129005  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2927  histidine kinase  42.65 
 
 
383 aa  86.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000936268  hitchhiker  0.0000101948 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2700  histidine kinase  41.73 
 
 
429 aa  85.5  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000394923  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 
775 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  30.74 
 
 
466 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
725 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249392  normal  0.37167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1652  Histidine kinase  51.16 
 
 
439 aa  85.9  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 
408 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155683  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0921  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 
446 aa  84.3  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9331  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.09 
 
 
508 aa  83.6  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.95 
 
 
445 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67096  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  39.87 
 
 
380 aa  82.4  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.37 
 
 
428 aa  82.4  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0204  histidine kinase  44 
 
 
446 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8723  Histidine kinase  37.5 
 
 
365 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0262  putative signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
465 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.186103 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2641  histidine kinase  35.07 
 
 
453 aa  81.6  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0175588  hitchhiker  0.00721729 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  37.5 
 
 
380 aa  81.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12660  signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 
444 aa  81.3  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224023  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4385  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
445 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.18 
 
 
469 aa  81.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0559  sensory box histidine kinase  35.71 
 
 
671 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4898  ATPase domain-containing protein  35.07 
 
 
491 aa  80.9  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246184  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0635  histidine kinase  38.97 
 
 
430 aa  80.5  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0766  histidine kinase  33.6 
 
 
464 aa  80.5  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.701174  normal  0.667801 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
417 aa  80.1  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  35.71 
 
 
422 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 
594 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  31.1 
 
 
783 aa  79.7  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1935  Histidine kinase  32.59 
 
 
364 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  33.73 
 
 
373 aa  79.3  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  30.38 
 
 
575 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1236  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 
692 aa  79  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 
662 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.86 
 
 
418 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
468 aa  79  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  30.38 
 
 
575 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  30.38 
 
 
575 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  34.35 
 
 
662 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0880  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 
446 aa  78.6  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.427062 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4619  PAS  34.42 
 
 
670 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  31.37 
 
 
489 aa  77.8  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  33.19 
 
 
640 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  30.67 
 
 
683 aa  77.4  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  24.51 
 
 
351 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.46 
 
 
463 aa  77.4  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>