132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4644 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4644  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  100 
 
 
203 aa  415  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.106976  normal  0.107264 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0477  cytochrome C oxidase assembly protein  47.4 
 
 
201 aa  202  4e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.372099  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0471  cytochrome C oxidase assembly protein  48.62 
 
 
201 aa  201  6e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.312234  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0585  cytochrome C oxidase assembly protein  46.56 
 
 
203 aa  195  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0102907  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0522  cytochrome C oxidase assembly protein  45.96 
 
 
198 aa  189  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.443491  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0832  cytochrome C oxidase assembly protein  48.96 
 
 
216 aa  186  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal  0.277813 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3879  cytochrome C oxidase assembly protein  50.8 
 
 
192 aa  184  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.217294  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4791  cytochrome C oxidase assembly protein  51.96 
 
 
206 aa  184  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0227  cytochrome C oxidase assembly protein  51.46 
 
 
213 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0765  cytochrome C oxidase assembly protein  51.46 
 
 
213 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35129  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0606  cytochrome C oxidase assembly protein  46.15 
 
 
202 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0818  cytochrome C oxidase assembly protein  49.71 
 
 
206 aa  181  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2230  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  49.14 
 
 
188 aa  180  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0596282  hitchhiker  0.0054778 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0726  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  51.27 
 
 
208 aa  180  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0871467 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4584  cytochrome C oxidase assembly protein  48.04 
 
 
208 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0646  cytochrome C oxidase assembly protein  44.51 
 
 
202 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.18748 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0745  cytochrome C oxidase assembly protein  46.11 
 
 
202 aa  178  5.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101336  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4502  cytochrome C oxidase assembly protein  45.13 
 
 
229 aa  177  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550907  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0259  cytochrome C oxidase assembly protein  48.54 
 
 
216 aa  176  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3459  cytochrome C oxidase assembly protein  48.54 
 
 
216 aa  176  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.788459  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0651  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  48.59 
 
 
308 aa  175  5e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0917  cytochrome C oxidase assembly protein  49.42 
 
 
209 aa  173  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0526885  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1044  cytochrome C oxidase assembly protein  43.43 
 
 
205 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0903  cytochrome C oxidase assembly protein  48.52 
 
 
208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169536  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2345  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  43.59 
 
 
206 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.608732 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_7271  cox 11/CtaG family of cytochrome oxidase assembly protein-like protein  46.2 
 
 
219 aa  167  7e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.044375  normal  0.225015 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2333  cytochrome C oxidase assembly protein  47.59 
 
 
195 aa  167  8e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.866958  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0617  cytochrome C oxidase assembly protein  47.27 
 
 
192 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184092  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1828  cytochrome C oxidase assembly protein  44.13 
 
 
191 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1241  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  45.74 
 
 
201 aa  166  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.72167 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0264  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  42.56 
 
 
203 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0477  cytochrome C oxidase assembly protein  44.13 
 
 
191 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3455  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  43.68 
 
 
202 aa  165  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.919622  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1402  cytochrome C oxidase assembly protein  48.19 
 
 
186 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.510495  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0029  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  45.9 
 
 
203 aa  160  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.310353  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3583  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  41.88 
 
 
202 aa  159  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3259  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  41.58 
 
 
202 aa  159  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4318  cytochrome C oxidase assembly protein  41.04 
 
 
195 aa  155  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0420878  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16147  predicted protein  43.33 
 
 
200 aa  152  4e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.448823  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0949  cytochrome C oxidase assembly protein  44.72 
 
 
178 aa  151  7e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1143  cytochrome C oxidase assembly protein  39.13 
 
 
203 aa  150  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3152  cytochrome C oxidase assembly protein  44.85 
 
 
191 aa  148  4e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0848  cytochrome C oxidase assembly protein  45 
 
 
174 aa  147  7e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1884  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  44.63 
 
 
216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0172285  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06297  cytochrome c oxidase assembly protein Cox11, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12260)  39.89 
 
 
250 aa  145  4.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1055  cytochrome C oxidase assembly protein  45.86 
 
 
175 aa  142  3e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.22643  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04840  aerobic respiration-related protein, putative  37.25 
 
 
296 aa  140  9.999999999999999e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0258  cytochrome C oxidase assembly protein  39.41 
 
 
181 aa  137  7.999999999999999e-32  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.623764  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82827  Cytochrome oxidase assembly factor COX11  39.18 
 
 
246 aa  129  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.143485  normal  0.307671 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0064  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  36.96 
 
 
198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0316  cytochrome C oxidase assembly protein  38.59 
 
 
204 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.677222  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3045  cytochrome C oxidase assembly protein  35.61 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0263  cytochrome C oxidase assembly protein  38.5 
 
 
198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3008  cytochrome c oxidase assembly protein  36.41 
 
 
182 aa  112  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.732509  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0547  cytochrome C oxidase assembly protein  41.07 
 
 
212 aa  111  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4169  cytochrome C oxidase assembly protein  41.04 
 
 
204 aa  111  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.985179 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0196  cytochrome C oxidase assembly protein  36.42 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0221  cytochrome C oxidase assembly protein  39.53 
 
 
202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.761807 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1247  cytochrome C oxidase assembly protein  35.75 
 
 
202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.403228  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3534  cytochrome C oxidase assembly protein  36.51 
 
 
206 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.713357  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2857  cytochrome C oxidase assembly protein  36.51 
 
 
206 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.459013  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0256  cytochrome C oxidase assembly protein  34.48 
 
 
187 aa  109  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0365  cytochrome C oxidase assembly protein  38.25 
 
 
202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0234  cytochrome C oxidase assembly protein  34.74 
 
 
189 aa  108  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0240  cytochrome C oxidase assembly protein  37.7 
 
 
202 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0144291 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0328  cytochrome C oxidase assembly protein  37.89 
 
 
182 aa  108  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.378424  normal  0.0110245 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3179  cytochrome C oxidase assembly protein  35.32 
 
 
210 aa  108  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000976115  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0880  cytochrome C oxidase assembly protein  36.22 
 
 
192 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0185  cytochrome C oxidase assembly protein  33.71 
 
 
185 aa  106  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0279  cytochrome C oxidase assembly protein  41.4 
 
 
203 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4001  cytochrome C oxidase assembly protein  33.52 
 
 
191 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4389  cytochrome C oxidase assembly protein  37.04 
 
 
208 aa  105  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3485  cytochrome C oxidase assembly protein  33.51 
 
 
188 aa  106  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.117347 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1677  cytochrome C oxidase assembly protein  38.92 
 
 
197 aa  106  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1682  cytochrome C oxidase assembly protein  39.78 
 
 
190 aa  105  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.912645  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3519  cytochrome C oxidase assembly protein  35.9 
 
 
187 aa  105  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1040  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  37.82 
 
 
175 aa  105  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1382  cytochrome C oxidase assembly protein  37.36 
 
 
224 aa  104  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167497  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0459  cytochrome C oxidase assembly protein  37.88 
 
 
203 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.51439  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0295  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  33.72 
 
 
180 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3993  cytochrome C oxidase assembly protein  34.12 
 
 
193 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3905  cytochrome C oxidase assembly protein  36.32 
 
 
205 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3821  cytochrome C oxidase assembly protein  41.1 
 
 
214 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.171251 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06270  cytochrome C oxidase assembly protein  35.26 
 
 
196 aa  103  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0882  cytochrome C oxidase assembly protein  31.82 
 
 
182 aa  102  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001447  cytochrome oxidase biogenesis protein Cox11-CtaG copper delivery to Cox1  33.9 
 
 
179 aa  102  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0123  cytochrome C oxidase assembly protein  34.84 
 
 
189 aa  102  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0176  cytochrome C oxidase assembly protein  34.84 
 
 
187 aa  102  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1468  cytochrome C oxidase assembly protein  34.38 
 
 
203 aa  101  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.867504  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4182  cytochrome C oxidase assembly protein  33.73 
 
 
193 aa  101  9e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4114  cytochrome C oxidase assembly protein  33.73 
 
 
193 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0152  cytochrome C oxidase assembly protein  33.73 
 
 
193 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4313  cytochrome C oxidase assembly protein  33.73 
 
 
193 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0675  cytochrome C oxidase assembly protein  38.29 
 
 
201 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.155472  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3793  cytochrome C oxidase assembly protein  33.14 
 
 
193 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3866  cytochrome C oxidase assembly protein  33.14 
 
 
193 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1425  cytochrome C oxidase assembly protein  38.29 
 
 
201 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0492  cytochrome C oxidase assembly protein  38.29 
 
 
201 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0510  cytochrome C oxidase assembly protein  38.29 
 
 
201 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2852  cytochrome C oxidase assembly protein  38.29 
 
 
201 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>