132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_82827 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_82827  Cytochrome oxidase assembly factor COX11  100 
 
 		 246 aa  511  1e-144  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.143485  normal  0.307671 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06297  cytochrome c oxidase assembly protein Cox11, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12260)  57.98 
 
 		 250 aa  227  1e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04840  aerobic respiration-related protein, putative  51.47 
 
 		 296 aa  216  4e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_7271  cox 11/CtaG family of cytochrome oxidase assembly protein-like protein  46.63 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.044375  normal  0.225015 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16147  predicted protein  45 
 
 		 200 aa  160  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.448823  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0471  cytochrome C oxidase assembly protein  39.23 
 
 		 201 aa  150  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.312234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0477  cytochrome C oxidase assembly protein  40.33 
 
 		 201 aa  150  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.372099  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0917  cytochrome C oxidase assembly protein  39.88 
 
 		 209 aa  147  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0526885  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0585  cytochrome C oxidase assembly protein  36.9 
 
 		 203 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0102907  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3879  cytochrome C oxidase assembly protein  37.5 
 
 		 192 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.217294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0848  cytochrome C oxidase assembly protein  40.23 
 
 		 174 aa  137  2e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0726  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  40.96 
 
 		 208 aa  135  7.000000000000001e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0871467 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1828  cytochrome C oxidase assembly protein  39.64 
 
 		 191 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0477  cytochrome C oxidase assembly protein  39.64 
 
 		 191 aa  135  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0522  cytochrome C oxidase assembly protein  37.1 
 
 		 198 aa  135  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.443491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2230  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  37.71 
 
 		 188 aa  134  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0596282  hitchhiker  0.0054778 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0617  cytochrome C oxidase assembly protein  42.11 
 
 		 192 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0651  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  41.33 
 
 		 308 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0903  cytochrome C oxidase assembly protein  40.31 
 
 		 208 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169536  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0745  cytochrome C oxidase assembly protein  39.88 
 
 		 202 aa  132  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101336  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4318  cytochrome C oxidase assembly protein  40.85 
 
 		 195 aa  132  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0420878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1055  cytochrome C oxidase assembly protein  41.77 
 
 		 175 aa  132  6e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.22643  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0949  cytochrome C oxidase assembly protein  40.11 
 
 		 178 aa  131  1.0000000000000001e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1884  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  39.11 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0172285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2333  cytochrome C oxidase assembly protein  39.26 
 
 		 195 aa  128  7.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.866958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4644  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  38.75 
 
 		 203 aa  128  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.106976  normal  0.107264 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0646  cytochrome C oxidase assembly protein  39.5 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.18748 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4791  cytochrome C oxidase assembly protein  36.16 
 
 		 206 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0258  cytochrome C oxidase assembly protein  41.86 
 
 		 181 aa  124  9e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.623764  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0606  cytochrome C oxidase assembly protein  40.38 
 
 		 202 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1143  cytochrome C oxidase assembly protein  40.99 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0818  cytochrome C oxidase assembly protein  39.62 
 
 		 206 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1402  cytochrome C oxidase assembly protein  37.93 
 
 		 186 aa  123  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.510495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4584  cytochrome C oxidase assembly protein  38.1 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3455  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  34.41 
 
 		 202 aa  122  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.919622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3152  cytochrome C oxidase assembly protein  37.99 
 
 		 191 aa  121  9e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4502  cytochrome C oxidase assembly protein  33.33 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550907  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3045  cytochrome C oxidase assembly protein  34.38 
 
 		 210 aa  120  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3259  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  34.43 
 
 		 202 aa  119  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1044  cytochrome C oxidase assembly protein  37.43 
 
 		 205 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3583  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  33.88 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1241  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  34.88 
 
 		 201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.72167 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0029  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  34.5 
 
 		 203 aa  115  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.310353  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2345  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  35.12 
 
 		 206 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.608732 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0234  cytochrome C oxidase assembly protein  36.25 
 
 		 189 aa  115  8.999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0196  cytochrome C oxidase assembly protein  31.21 
 
 		 189 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0259  cytochrome C oxidase assembly protein  38.33 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3459  cytochrome C oxidase assembly protein  38.33 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.788459  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0264  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  34.46 
 
 		 203 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3784  cytochrome C oxidase assembly protein  33.13 
 
 		 188 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0123  cytochrome C oxidase assembly protein  32.32 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0176  cytochrome C oxidase assembly protein  31.06 
 
 		 187 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0832  cytochrome C oxidase assembly protein  35 
 
 		 216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal  0.277813 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4608  cytochrome C oxidase assembly protein  31.87 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0880  cytochrome C oxidase assembly protein  34.36 
 
 		 192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4001  cytochrome C oxidase assembly protein  32.4 
 
 		 191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1247  cytochrome C oxidase assembly protein  31.28 
 
 		 202 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.403228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0256  cytochrome C oxidase assembly protein  32.93 
 
 		 187 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3793  cytochrome C oxidase assembly protein  31.65 
 
 		 193 aa  109  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3866  cytochrome C oxidase assembly protein  31.65 
 
 		 193 aa  109  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0227  cytochrome C oxidase assembly protein  37.13 
 
 		 213 aa  108  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0765  cytochrome C oxidase assembly protein  37.13 
 
 		 213 aa  108  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4389  cytochrome C oxidase assembly protein  33.68 
 
 		 208 aa  108  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3519  cytochrome C oxidase assembly protein  32.5 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3993  cytochrome C oxidase assembly protein  30.63 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1682  cytochrome C oxidase assembly protein  32.04 
 
 		 190 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.912645  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0152  cytochrome C oxidase assembly protein  29.51 
 
 		 193 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06270  cytochrome C oxidase assembly protein  32.97 
 
 		 196 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4313  cytochrome C oxidase assembly protein  29.51 
 
 		 193 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4114  cytochrome C oxidase assembly protein  29.51 
 
 		 193 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0328  cytochrome C oxidase assembly protein  35.98 
 
 		 182 aa  106  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.378424  normal  0.0110245 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0279  cytochrome C oxidase assembly protein  34.68 
 
 		 203 aa  105  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0295  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  35.85 
 
 		 180 aa  105  8e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1468  cytochrome C oxidase assembly protein  36.02 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.867504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0064  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  29.85 
 
 		 198 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3179  cytochrome C oxidase assembly protein  27.7 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000976115  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4182  cytochrome C oxidase assembly protein  28.96 
 
 		 193 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0313  cytochrome C oxidase assembly protein  36.17 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0575051 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4169  cytochrome C oxidase assembly protein  35.58 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.985179 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0547  cytochrome C oxidase assembly protein  34.05 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0316  cytochrome C oxidase assembly protein  34.44 
 
 		 204 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.677222  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0675  cytochrome C oxidase assembly protein  32.49 
 
 		 201 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.155472  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0167  cytochrome C oxidase assembly protein  32.49 
 
 		 201 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1425  cytochrome C oxidase assembly protein  32.49 
 
 		 201 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0492  cytochrome C oxidase assembly protein  32.49 
 
 		 201 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0510  cytochrome C oxidase assembly protein  32.49 
 
 		 201 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2852  cytochrome C oxidase assembly protein  32.49 
 
 		 201 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0263  cytochrome C oxidase assembly protein  31.58 
 
 		 198 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001447  cytochrome oxidase biogenesis protein Cox11-CtaG copper delivery to Cox1  31.74 
 
 		 179 aa  102  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3195  cytochrome C oxidase assembly protein  34.41 
 
 		 186 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3821  cytochrome C oxidase assembly protein  33.14 
 
 		 214 aa  101  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.171251 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3485  cytochrome C oxidase assembly protein  29.45 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.117347 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04022  cytochrome C oxidase assembly protein  33.94 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0459  cytochrome C oxidase assembly protein  31.79 
 
 		 203 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.51439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0428  cytochrome C oxidase assembly protein  34.57 
 
 		 201 aa  99.8  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2857  cytochrome C oxidase assembly protein  30.3 
 
 		 206 aa  99.4  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.459013  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3534  cytochrome C oxidase assembly protein  30.3 
 
 		 206 aa  99.4  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.713357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1382  cytochrome C oxidase assembly protein  31.18 
 
 		 224 aa  99.4  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4244  cytochrome C oxidase assembly protein  30.54 
 
 		 200 aa  99  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.770426  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04011  cytochrome C oxidase assembly protein  30 
 
 		 195 aa  98.6  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>