132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0259 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0259  cytochrome C oxidase assembly protein  100 
 
 
216 aa  440  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3459  cytochrome C oxidase assembly protein  100 
 
 
216 aa  440  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.788459  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0227  cytochrome C oxidase assembly protein  79.17 
 
 
213 aa  342  2.9999999999999997e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0765  cytochrome C oxidase assembly protein  79.17 
 
 
213 aa  342  2.9999999999999997e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35129  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0818  cytochrome C oxidase assembly protein  72.5 
 
 
206 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4584  cytochrome C oxidase assembly protein  76.56 
 
 
208 aa  304  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0832  cytochrome C oxidase assembly protein  69.3 
 
 
216 aa  303  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal  0.277813 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0903  cytochrome C oxidase assembly protein  71.88 
 
 
208 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169536  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4791  cytochrome C oxidase assembly protein  68.93 
 
 
206 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0522  cytochrome C oxidase assembly protein  53.22 
 
 
198 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.443491  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0726  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  55.81 
 
 
208 aa  187  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0871467 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1828  cytochrome C oxidase assembly protein  56.69 
 
 
191 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0477  cytochrome C oxidase assembly protein  48.88 
 
 
201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.372099  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0477  cytochrome C oxidase assembly protein  56.69 
 
 
191 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0471  cytochrome C oxidase assembly protein  48.31 
 
 
201 aa  178  5.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.312234  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4502  cytochrome C oxidase assembly protein  49.17 
 
 
229 aa  176  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550907  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2230  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  51.48 
 
 
188 aa  175  4e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0596282  hitchhiker  0.0054778 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0585  cytochrome C oxidase assembly protein  47.8 
 
 
203 aa  173  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0102907  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0617  cytochrome C oxidase assembly protein  52.44 
 
 
192 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184092  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4644  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  46.77 
 
 
203 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.106976  normal  0.107264 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0646  cytochrome C oxidase assembly protein  46.19 
 
 
202 aa  170  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.18748 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1044  cytochrome C oxidase assembly protein  45.16 
 
 
205 aa  168  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0606  cytochrome C oxidase assembly protein  42.4 
 
 
202 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1241  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  48.04 
 
 
201 aa  166  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.72167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3879  cytochrome C oxidase assembly protein  43.81 
 
 
192 aa  166  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.217294  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0651  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  46.24 
 
 
308 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4318  cytochrome C oxidase assembly protein  45.95 
 
 
195 aa  164  9e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0420878  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0029  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  43.78 
 
 
203 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.310353  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0745  cytochrome C oxidase assembly protein  48.07 
 
 
202 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101336  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0264  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  45.16 
 
 
203 aa  162  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1143  cytochrome C oxidase assembly protein  45.35 
 
 
203 aa  161  6e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2333  cytochrome C oxidase assembly protein  49.03 
 
 
195 aa  160  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.866958  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2345  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  44.39 
 
 
206 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.608732 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3583  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  42.79 
 
 
202 aa  159  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3259  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  46.55 
 
 
202 aa  158  6e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0917  cytochrome C oxidase assembly protein  45.98 
 
 
209 aa  157  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0526885  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1402  cytochrome C oxidase assembly protein  47.09 
 
 
186 aa  157  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.510495  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3455  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  41.87 
 
 
202 aa  154  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.919622  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1884  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  43.72 
 
 
216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0172285  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16147  predicted protein  45.86 
 
 
200 aa  152  5e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.448823  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_7271  cox 11/CtaG family of cytochrome oxidase assembly protein-like protein  43.6 
 
 
219 aa  150  1e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.044375  normal  0.225015 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3152  cytochrome C oxidase assembly protein  43.18 
 
 
191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0848  cytochrome C oxidase assembly protein  42.44 
 
 
174 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1055  cytochrome C oxidase assembly protein  42.68 
 
 
175 aa  143  2e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.22643  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0949  cytochrome C oxidase assembly protein  41.88 
 
 
178 aa  140  1.9999999999999998e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06297  cytochrome c oxidase assembly protein Cox11, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12260)  37.32 
 
 
250 aa  138  6e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3045  cytochrome C oxidase assembly protein  40.54 
 
 
210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0279  cytochrome C oxidase assembly protein  42.68 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0234  cytochrome C oxidase assembly protein  40.36 
 
 
189 aa  125  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4169  cytochrome C oxidase assembly protein  41.82 
 
 
204 aa  124  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.985179 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0365  cytochrome C oxidase assembly protein  37.32 
 
 
202 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0258  cytochrome C oxidase assembly protein  36.71 
 
 
181 aa  124  1e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.623764  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0221  cytochrome C oxidase assembly protein  35.27 
 
 
202 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.761807 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0547  cytochrome C oxidase assembly protein  41.82 
 
 
212 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6174  cytochrome C oxidase assembly protein  40.7 
 
 
202 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1247  cytochrome C oxidase assembly protein  37.63 
 
 
202 aa  123  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.403228  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04840  aerobic respiration-related protein, putative  37.65 
 
 
296 aa  122  3e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0459  cytochrome C oxidase assembly protein  40.24 
 
 
203 aa  122  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.51439  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2855  cytochrome C oxidase assembly protein  39.77 
 
 
202 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.237501  normal  0.641869 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2230  cytochrome C oxidase assembly protein  39.77 
 
 
202 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2844  cytochrome C oxidase assembly protein  39.77 
 
 
202 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.252567  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0675  cytochrome C oxidase assembly protein  41.42 
 
 
201 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.155472  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0185  cytochrome C oxidase assembly protein  37.27 
 
 
185 aa  122  6e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0167  cytochrome C oxidase assembly protein  41.42 
 
 
201 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1425  cytochrome C oxidase assembly protein  41.42 
 
 
201 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0492  cytochrome C oxidase assembly protein  41.42 
 
 
201 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0510  cytochrome C oxidase assembly protein  41.42 
 
 
201 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2852  cytochrome C oxidase assembly protein  41.42 
 
 
201 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0240  cytochrome C oxidase assembly protein  34.63 
 
 
202 aa  121  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0144291 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3195  cytochrome C oxidase assembly protein  41.42 
 
 
186 aa  121  7e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2900  cytochrome C oxidase assembly protein  39.66 
 
 
202 aa  121  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3179  cytochrome C oxidase assembly protein  37.8 
 
 
210 aa  121  7e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000976115  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2761  cytochrome C oxidase assembly protein  39.66 
 
 
202 aa  121  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29395  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82827  Cytochrome oxidase assembly factor COX11  38.33 
 
 
246 aa  120  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.143485  normal  0.307671 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001447  cytochrome oxidase biogenesis protein Cox11-CtaG copper delivery to Cox1  37.35 
 
 
179 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1468  cytochrome C oxidase assembly protein  38.46 
 
 
203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.867504  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0428  cytochrome C oxidase assembly protein  38.3 
 
 
201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0880  cytochrome C oxidase assembly protein  37.5 
 
 
192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0263  cytochrome C oxidase assembly protein  41.21 
 
 
198 aa  119  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06270  cytochrome C oxidase assembly protein  35.52 
 
 
196 aa  118  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3008  cytochrome c oxidase assembly protein  37.08 
 
 
182 aa  117  9e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.732509  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0328  cytochrome C oxidase assembly protein  39.63 
 
 
182 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.378424  normal  0.0110245 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3821  cytochrome C oxidase assembly protein  35.75 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.171251 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0316  cytochrome C oxidase assembly protein  35.12 
 
 
204 aa  116  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.677222  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0295  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  39.63 
 
 
180 aa  116  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1682  cytochrome C oxidase assembly protein  40.83 
 
 
190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.912645  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0256  cytochrome C oxidase assembly protein  36.48 
 
 
187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4001  cytochrome C oxidase assembly protein  34.12 
 
 
191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1677  cytochrome C oxidase assembly protein  37.24 
 
 
197 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3993  cytochrome C oxidase assembly protein  35.22 
 
 
193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4608  cytochrome C oxidase assembly protein  33.15 
 
 
193 aa  112  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4389  cytochrome C oxidase assembly protein  36.18 
 
 
208 aa  112  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3534  cytochrome C oxidase assembly protein  34.17 
 
 
206 aa  112  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.713357  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2857  cytochrome C oxidase assembly protein  34.17 
 
 
206 aa  112  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.459013  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4114  cytochrome C oxidase assembly protein  35.22 
 
 
193 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0152  cytochrome C oxidase assembly protein  35.22 
 
 
193 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1938  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  38.37 
 
 
193 aa  111  7.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.233238  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4313  cytochrome C oxidase assembly protein  35.22 
 
 
193 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3793  cytochrome C oxidase assembly protein  34.59 
 
 
193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3866  cytochrome C oxidase assembly protein  34.59 
 
 
193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>