132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3259 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3259  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  100 
 
 		 202 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3583  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  98.51 
 
 		 202 aa  410  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3455  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  90.59 
 
 		 202 aa  376  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.919622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0264  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  60.54 
 
 		 203 aa  234  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2345  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  59.04 
 
 		 206 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.608732 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0029  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  55.9 
 
 		 203 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.310353  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0227  cytochrome C oxidase assembly protein  48.24 
 
 		 213 aa  161  8.000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0765  cytochrome C oxidase assembly protein  48.24 
 
 		 213 aa  161  8.000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3879  cytochrome C oxidase assembly protein  45 
 
 		 192 aa  159  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.217294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4502  cytochrome C oxidase assembly protein  43.37 
 
 		 229 aa  157  8e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550907  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0832  cytochrome C oxidase assembly protein  45.51 
 
 		 216 aa  155  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal  0.277813 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0818  cytochrome C oxidase assembly protein  47.93 
 
 		 206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1241  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  42.86 
 
 		 201 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.72167 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0477  cytochrome C oxidase assembly protein  38.81 
 
 		 201 aa  154  9e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.372099  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0726  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  41.85 
 
 		 208 aa  154  9e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0871467 
 
 
-
 
NC_004310  BR0471  cytochrome C oxidase assembly protein  38.81 
 
 		 201 aa  154  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.312234  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0259  cytochrome C oxidase assembly protein  46.55 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3459  cytochrome C oxidase assembly protein  46.55 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.788459  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4791  cytochrome C oxidase assembly protein  45.56 
 
 		 206 aa  151  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0522  cytochrome C oxidase assembly protein  43.27 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.443491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4644  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  45.03 
 
 		 203 aa  150  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.106976  normal  0.107264 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0651  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  48.54 
 
 		 308 aa  149  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4318  cytochrome C oxidase assembly protein  42.02 
 
 		 195 aa  149  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0420878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4584  cytochrome C oxidase assembly protein  45.56 
 
 		 208 aa  148  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1044  cytochrome C oxidase assembly protein  39.9 
 
 		 205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0585  cytochrome C oxidase assembly protein  39.25 
 
 		 203 aa  146  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0102907  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0903  cytochrome C oxidase assembly protein  42.22 
 
 		 208 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169536  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2230  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  42.05 
 
 		 188 aa  144  9e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0596282  hitchhiker  0.0054778 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0646  cytochrome C oxidase assembly protein  40.76 
 
 		 202 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.18748 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0606  cytochrome C oxidase assembly protein  40.22 
 
 		 202 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0848  cytochrome C oxidase assembly protein  37.65 
 
 		 174 aa  142  3e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1884  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  41.28 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0172285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1402  cytochrome C oxidase assembly protein  45.24 
 
 		 186 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.510495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_7271  cox 11/CtaG family of cytochrome oxidase assembly protein-like protein  35.84 
 
 		 219 aa  138  4.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.044375  normal  0.225015 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06297  cytochrome c oxidase assembly protein Cox11, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12260)  37.43 
 
 		 250 aa  137  7.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0917  cytochrome C oxidase assembly protein  39.41 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0526885  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3152  cytochrome C oxidase assembly protein  40 
 
 		 191 aa  137  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16147  predicted protein  39.15 
 
 		 200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.448823  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1143  cytochrome C oxidase assembly protein  37.11 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0949  cytochrome C oxidase assembly protein  39.52 
 
 		 178 aa  132  3.9999999999999996e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0745  cytochrome C oxidase assembly protein  34.74 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101336  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0477  cytochrome C oxidase assembly protein  40 
 
 		 191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04840  aerobic respiration-related protein, putative  31.94 
 
 		 296 aa  129  3e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1828  cytochrome C oxidase assembly protein  40 
 
 		 191 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1055  cytochrome C oxidase assembly protein  37.65 
 
 		 175 aa  125  3e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.22643  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2333  cytochrome C oxidase assembly protein  40.26 
 
 		 195 aa  125  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.866958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0617  cytochrome C oxidase assembly protein  40.49 
 
 		 192 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0258  cytochrome C oxidase assembly protein  38.24 
 
 		 181 aa  121  5e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.623764  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82827  Cytochrome oxidase assembly factor COX11  34.43 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.143485  normal  0.307671 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3045  cytochrome C oxidase assembly protein  36.05 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0064  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  36 
 
 		 198 aa  107  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4244  cytochrome C oxidase assembly protein  34.91 
 
 		 200 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.770426  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0196  cytochrome C oxidase assembly protein  33.71 
 
 		 189 aa  102  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0176  cytochrome C oxidase assembly protein  33.71 
 
 		 187 aa  102  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4001  cytochrome C oxidase assembly protein  32.29 
 
 		 191 aa  101  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0234  cytochrome C oxidase assembly protein  36.75 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0316  cytochrome C oxidase assembly protein  32.46 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.677222  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3534  cytochrome C oxidase assembly protein  31.75 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.713357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2857  cytochrome C oxidase assembly protein  31.75 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.459013  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3179  cytochrome C oxidase assembly protein  33.51 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000976115  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0152  cytochrome C oxidase assembly protein  32.02 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4313  cytochrome C oxidase assembly protein  32.02 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4114  cytochrome C oxidase assembly protein  32.02 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1247  cytochrome C oxidase assembly protein  32.2 
 
 		 202 aa  99  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.403228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2715  cytochrome C oxidase assembly protein  36.54 
 
 		 172 aa  99  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.253936 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3784  cytochrome C oxidase assembly protein  33.33 
 
 		 188 aa  98.6  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04011  cytochrome C oxidase assembly protein  34.55 
 
 		 195 aa  98.6  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1682  cytochrome C oxidase assembly protein  33.14 
 
 		 190 aa  98.6  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.912645  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4182  cytochrome C oxidase assembly protein  32.02 
 
 		 193 aa  98.2  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4608  cytochrome C oxidase assembly protein  32.77 
 
 		 193 aa  98.2  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3793  cytochrome C oxidase assembly protein  33.94 
 
 		 193 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3866  cytochrome C oxidase assembly protein  33.94 
 
 		 193 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0123  cytochrome C oxidase assembly protein  33.15 
 
 		 189 aa  97.8  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3993  cytochrome C oxidase assembly protein  33.33 
 
 		 193 aa  96.3  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04022  cytochrome C oxidase assembly protein  38.15 
 
 		 198 aa  96.3  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0880  cytochrome C oxidase assembly protein  32.57 
 
 		 192 aa  96.3  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4389  cytochrome C oxidase assembly protein  31.22 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3821  cytochrome C oxidase assembly protein  32.11 
 
 		 214 aa  95.5  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.171251 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3905  cytochrome C oxidase assembly protein  31.94 
 
 		 205 aa  95.5  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1677  cytochrome C oxidase assembly protein  31.32 
 
 		 197 aa  94.7  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0256  cytochrome C oxidase assembly protein  31.03 
 
 		 187 aa  94.7  9e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0279  cytochrome C oxidase assembly protein  34.97 
 
 		 203 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0882  cytochrome C oxidase assembly protein  31.64 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3008  cytochrome c oxidase assembly protein  33.7 
 
 		 182 aa  94.4  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.732509  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0328  cytochrome C oxidase assembly protein  33.52 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.378424  normal  0.0110245 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3519  cytochrome C oxidase assembly protein  32.73 
 
 		 187 aa  92.8  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0077  cytochrome C oxidase assembly protein  33.33 
 
 		 183 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0263  cytochrome C oxidase assembly protein  30.57 
 
 		 198 aa  91.7  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1468  cytochrome C oxidase assembly protein  33.96 
 
 		 203 aa  91.3  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.867504  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0365  cytochrome C oxidase assembly protein  31.91 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1040  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  36.14 
 
 		 175 aa  90.1  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001447  cytochrome oxidase biogenesis protein Cox11-CtaG copper delivery to Cox1  31.65 
 
 		 179 aa  90.1  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0547  cytochrome C oxidase assembly protein  32.96 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2761  cytochrome C oxidase assembly protein  31.41 
 
 		 202 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2855  cytochrome C oxidase assembly protein  30.81 
 
 		 202 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.237501  normal  0.641869 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2230  cytochrome C oxidase assembly protein  30.81 
 
 		 202 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2844  cytochrome C oxidase assembly protein  30.81 
 
 		 202 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.252567  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0185  cytochrome C oxidase assembly protein  29.75 
 
 		 185 aa  89.4  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1382  cytochrome C oxidase assembly protein  29.82 
 
 		 224 aa  89.4  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0675  cytochrome C oxidase assembly protein  33.33 
 
 		 201 aa  89  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.155472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>