132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0258 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0258  cytochrome C oxidase assembly protein  100 
 
 
181 aa  369  1e-101  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.623764  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0848  cytochrome C oxidase assembly protein  54.12 
 
 
174 aa  184  5e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1055  cytochrome C oxidase assembly protein  57.32 
 
 
175 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.22643  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0949  cytochrome C oxidase assembly protein  50 
 
 
178 aa  167  1e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0726  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  45.29 
 
 
208 aa  156  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0871467 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_7271  cox 11/CtaG family of cytochrome oxidase assembly protein-like protein  44.51 
 
 
219 aa  153  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.044375  normal  0.225015 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4318  cytochrome C oxidase assembly protein  43.75 
 
 
195 aa  148  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0420878  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2230  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  39.41 
 
 
188 aa  139  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0596282  hitchhiker  0.0054778 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3152  cytochrome C oxidase assembly protein  40.85 
 
 
191 aa  138  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1143  cytochrome C oxidase assembly protein  39.76 
 
 
203 aa  138  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2333  cytochrome C oxidase assembly protein  42.21 
 
 
195 aa  137  7.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.866958  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0917  cytochrome C oxidase assembly protein  40.12 
 
 
209 aa  134  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0526885  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4644  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  41.83 
 
 
203 aa  134  8e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.106976  normal  0.107264 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0585  cytochrome C oxidase assembly protein  43.87 
 
 
203 aa  133  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0102907  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1241  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  40.52 
 
 
201 aa  132  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.72167 
 
 
-
 
NC_004310  BR0471  cytochrome C oxidase assembly protein  42.58 
 
 
201 aa  131  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.312234  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1828  cytochrome C oxidase assembly protein  41.1 
 
 
191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0477  cytochrome C oxidase assembly protein  41.1 
 
 
191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0477  cytochrome C oxidase assembly protein  41.94 
 
 
201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.372099  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0522  cytochrome C oxidase assembly protein  41.94 
 
 
198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.443491  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06297  cytochrome c oxidase assembly protein Cox11, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12260)  42.6 
 
 
250 aa  128  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1402  cytochrome C oxidase assembly protein  40.12 
 
 
186 aa  129  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.510495  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16147  predicted protein  41.52 
 
 
200 aa  128  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.448823  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0651  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  40.59 
 
 
308 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0745  cytochrome C oxidase assembly protein  42.26 
 
 
202 aa  128  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101336  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0832  cytochrome C oxidase assembly protein  38.71 
 
 
216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal  0.277813 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82827  Cytochrome oxidase assembly factor COX11  41.86 
 
 
246 aa  124  5e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.143485  normal  0.307671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3879  cytochrome C oxidase assembly protein  38.92 
 
 
192 aa  124  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.217294  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0617  cytochrome C oxidase assembly protein  42 
 
 
192 aa  124  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184092  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0227  cytochrome C oxidase assembly protein  36.08 
 
 
213 aa  123  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0765  cytochrome C oxidase assembly protein  36.08 
 
 
213 aa  123  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35129  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3583  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  38.24 
 
 
202 aa  122  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04840  aerobic respiration-related protein, putative  39.33 
 
 
296 aa  122  4e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2345  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  37.28 
 
 
206 aa  122  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.608732 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3259  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  38.24 
 
 
202 aa  121  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0029  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  37.95 
 
 
203 aa  121  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.310353  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0264  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  37.28 
 
 
203 aa  121  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0259  cytochrome C oxidase assembly protein  36.71 
 
 
216 aa  120  8e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3459  cytochrome C oxidase assembly protein  36.71 
 
 
216 aa  120  8e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.788459  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1044  cytochrome C oxidase assembly protein  39.22 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0606  cytochrome C oxidase assembly protein  40.24 
 
 
202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3455  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  36.69 
 
 
202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.919622  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0646  cytochrome C oxidase assembly protein  40.24 
 
 
202 aa  117  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.18748 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4502  cytochrome C oxidase assembly protein  38.56 
 
 
229 aa  115  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550907  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1884  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  40.48 
 
 
216 aa  114  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0172285  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4584  cytochrome C oxidase assembly protein  36.71 
 
 
208 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0818  cytochrome C oxidase assembly protein  36.77 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4791  cytochrome C oxidase assembly protein  36.02 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0882  cytochrome C oxidase assembly protein  36.9 
 
 
182 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2715  cytochrome C oxidase assembly protein  38.37 
 
 
172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.253936 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1040  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  36.05 
 
 
175 aa  108  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0124  cytochrome C oxidase assembly protein  36.53 
 
 
188 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0077  cytochrome C oxidase assembly protein  36.53 
 
 
183 aa  105  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0903  cytochrome C oxidase assembly protein  34.81 
 
 
208 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169536  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0328  cytochrome C oxidase assembly protein  38.69 
 
 
182 aa  104  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.378424  normal  0.0110245 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01310  cytochrome C oxidase assembly protein  35.12 
 
 
184 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.782313  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0182  cytochrome C oxidase assembly protein  34.52 
 
 
184 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06270  cytochrome C oxidase assembly protein  34.07 
 
 
196 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0119  cytochrome C oxidase assembly protein  35.33 
 
 
188 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553473  normal  0.0134076 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0105  cytochrome C oxidase assembly protein  35.33 
 
 
188 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257574  normal  0.281788 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4608  cytochrome C oxidase assembly protein  32.56 
 
 
193 aa  102  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4244  cytochrome C oxidase assembly protein  35.39 
 
 
200 aa  102  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.770426  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0121  cytochrome C oxidase assembly protein  35.33 
 
 
188 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01000  cytochrome C oxidase assembly protein  33.33 
 
 
184 aa  99  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4001  cytochrome C oxidase assembly protein  31.79 
 
 
191 aa  99.4  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0279  cytochrome C oxidase assembly protein  34.55 
 
 
203 aa  98.2  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3793  cytochrome C oxidase assembly protein  32.14 
 
 
193 aa  97.8  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3866  cytochrome C oxidase assembly protein  32.14 
 
 
193 aa  97.8  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0285  cytochrome C oxidase assembly protein  37.72 
 
 
163 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0263  cytochrome C oxidase assembly protein  37.85 
 
 
198 aa  96.7  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001447  cytochrome oxidase biogenesis protein Cox11-CtaG copper delivery to Cox1  33.71 
 
 
179 aa  96.7  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3784  cytochrome C oxidase assembly protein  33.33 
 
 
188 aa  96.3  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0234  cytochrome C oxidase assembly protein  33.71 
 
 
189 aa  95.5  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1682  cytochrome C oxidase assembly protein  34.71 
 
 
190 aa  95.9  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.912645  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3993  cytochrome C oxidase assembly protein  31.55 
 
 
193 aa  95.5  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3008  cytochrome c oxidase assembly protein  31.07 
 
 
182 aa  95.9  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.732509  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4169  cytochrome C oxidase assembly protein  33.53 
 
 
204 aa  95.5  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.985179 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0547  cytochrome C oxidase assembly protein  32.18 
 
 
212 aa  95.5  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0152  cytochrome C oxidase assembly protein  30.95 
 
 
193 aa  94.7  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4114  cytochrome C oxidase assembly protein  30.95 
 
 
193 aa  94.7  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4313  cytochrome C oxidase assembly protein  30.95 
 
 
193 aa  94.7  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0295  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  33.54 
 
 
180 aa  94.7  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0185  cytochrome C oxidase assembly protein  32.93 
 
 
185 aa  94  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0176  cytochrome C oxidase assembly protein  30.81 
 
 
187 aa  93.6  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4182  cytochrome C oxidase assembly protein  30.95 
 
 
193 aa  93.6  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0316  cytochrome C oxidase assembly protein  35.26 
 
 
204 aa  93.2  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.677222  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6174  cytochrome C oxidase assembly protein  33.33 
 
 
202 aa  92.8  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04011  cytochrome C oxidase assembly protein  31.98 
 
 
195 aa  93.2  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0144  cytochrome C oxidase assembly protein  33.33 
 
 
182 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2855  cytochrome C oxidase assembly protein  33.33 
 
 
202 aa  92.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.237501  normal  0.641869 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2230  cytochrome C oxidase assembly protein  33.33 
 
 
202 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2844  cytochrome C oxidase assembly protein  33.33 
 
 
202 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.252567  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0196  cytochrome C oxidase assembly protein  30.11 
 
 
189 aa  92.4  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0459  cytochrome C oxidase assembly protein  32.93 
 
 
203 aa  92.4  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.51439  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0313  cytochrome C oxidase assembly protein  34.15 
 
 
196 aa  92  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0575051 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3045  cytochrome C oxidase assembly protein  34.68 
 
 
210 aa  92  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3485  cytochrome C oxidase assembly protein  32.75 
 
 
188 aa  91.7  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.117347 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0256  cytochrome C oxidase assembly protein  29.17 
 
 
187 aa  91.3  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3179  cytochrome C oxidase assembly protein  33.33 
 
 
210 aa  90.9  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000976115  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2900  cytochrome C oxidase assembly protein  33.14 
 
 
202 aa  90.9  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>