132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0227 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0227  cytochrome C oxidase assembly protein  100 
 
 		 213 aa  437  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0765  cytochrome C oxidase assembly protein  100 
 
 		 213 aa  437  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0259  cytochrome C oxidase assembly protein  79.63 
 
 		 216 aa  343  1e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3459  cytochrome C oxidase assembly protein  79.63 
 
 		 216 aa  343  1e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.788459  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0818  cytochrome C oxidase assembly protein  70.5 
 
 		 206 aa  298  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0832  cytochrome C oxidase assembly protein  67.48 
 
 		 216 aa  290  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal  0.277813 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4584  cytochrome C oxidase assembly protein  67.71 
 
 		 208 aa  275  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4791  cytochrome C oxidase assembly protein  68.75 
 
 		 206 aa  274  8e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0903  cytochrome C oxidase assembly protein  68.23 
 
 		 208 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169536  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0522  cytochrome C oxidase assembly protein  51.45 
 
 		 198 aa  179  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.443491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4644  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  52.56 
 
 		 203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.106976  normal  0.107264 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0477  cytochrome C oxidase assembly protein  54.27 
 
 		 191 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0471  cytochrome C oxidase assembly protein  48.28 
 
 		 201 aa  171  5.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.312234  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2230  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  51.18 
 
 		 188 aa  171  7.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0596282  hitchhiker  0.0054778 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0726  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  51.14 
 
 		 208 aa  171  9e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0871467 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1828  cytochrome C oxidase assembly protein  53.66 
 
 		 191 aa  170  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0617  cytochrome C oxidase assembly protein  56.76 
 
 		 192 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0477  cytochrome C oxidase assembly protein  47.7 
 
 		 201 aa  170  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.372099  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3879  cytochrome C oxidase assembly protein  46.5 
 
 		 192 aa  169  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.217294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0264  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  50.6 
 
 		 203 aa  169  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0585  cytochrome C oxidase assembly protein  46.7 
 
 		 203 aa  169  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0102907  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2345  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  46.84 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.608732 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1044  cytochrome C oxidase assembly protein  44.62 
 
 		 205 aa  166  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4502  cytochrome C oxidase assembly protein  45.86 
 
 		 229 aa  165  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550907  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3583  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  48.24 
 
 		 202 aa  161  9e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3455  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  45.27 
 
 		 202 aa  160  9e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.919622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1241  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  48.39 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.72167 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2333  cytochrome C oxidase assembly protein  49.68 
 
 		 195 aa  160  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.866958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3259  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  48.24 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4318  cytochrome C oxidase assembly protein  45.71 
 
 		 195 aa  159  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0420878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1402  cytochrome C oxidase assembly protein  47.09 
 
 		 186 aa  157  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.510495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0646  cytochrome C oxidase assembly protein  42.71 
 
 		 202 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.18748 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0917  cytochrome C oxidase assembly protein  47.4 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0526885  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0029  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  41 
 
 		 203 aa  155  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.310353  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0651  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  46.24 
 
 		 308 aa  156  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0606  cytochrome C oxidase assembly protein  42.55 
 
 		 202 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1143  cytochrome C oxidase assembly protein  44.77 
 
 		 203 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0745  cytochrome C oxidase assembly protein  45.3 
 
 		 202 aa  152  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101336  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3152  cytochrome C oxidase assembly protein  43.18 
 
 		 191 aa  143  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_7271  cox 11/CtaG family of cytochrome oxidase assembly protein-like protein  42.26 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.044375  normal  0.225015 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16147  predicted protein  43.02 
 
 		 200 aa  136  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.448823  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1884  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  41.01 
 
 		 216 aa  135  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0172285  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0949  cytochrome C oxidase assembly protein  40 
 
 		 178 aa  134  9.999999999999999e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0848  cytochrome C oxidase assembly protein  41.14 
 
 		 174 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1055  cytochrome C oxidase assembly protein  42.31 
 
 		 175 aa  132  3e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.22643  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06297  cytochrome c oxidase assembly protein Cox11, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12260)  39.89 
 
 		 250 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0234  cytochrome C oxidase assembly protein  41.36 
 
 		 189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0279  cytochrome C oxidase assembly protein  43.2 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0459  cytochrome C oxidase assembly protein  42.07 
 
 		 203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.51439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0185  cytochrome C oxidase assembly protein  38.37 
 
 		 185 aa  125  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0547  cytochrome C oxidase assembly protein  39.88 
 
 		 212 aa  125  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2900  cytochrome C oxidase assembly protein  39.46 
 
 		 202 aa  124  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2761  cytochrome C oxidase assembly protein  39.46 
 
 		 202 aa  124  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1247  cytochrome C oxidase assembly protein  37.77 
 
 		 202 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.403228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3045  cytochrome C oxidase assembly protein  39.46 
 
 		 210 aa  122  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0258  cytochrome C oxidase assembly protein  36.08 
 
 		 181 aa  122  3e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.623764  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4169  cytochrome C oxidase assembly protein  40.74 
 
 		 204 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.985179 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6174  cytochrome C oxidase assembly protein  39.88 
 
 		 202 aa  122  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0263  cytochrome C oxidase assembly protein  43.64 
 
 		 198 aa  121  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2855  cytochrome C oxidase assembly protein  39.53 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.237501  normal  0.641869 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0428  cytochrome C oxidase assembly protein  40.83 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2230  cytochrome C oxidase assembly protein  39.53 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2844  cytochrome C oxidase assembly protein  39.53 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.252567  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0675  cytochrome C oxidase assembly protein  40.24 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.155472  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0167  cytochrome C oxidase assembly protein  40.24 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1425  cytochrome C oxidase assembly protein  40.24 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0492  cytochrome C oxidase assembly protein  40.24 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0510  cytochrome C oxidase assembly protein  40.24 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2852  cytochrome C oxidase assembly protein  40.24 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0365  cytochrome C oxidase assembly protein  38.89 
 
 		 202 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3195  cytochrome C oxidase assembly protein  40.24 
 
 		 186 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0880  cytochrome C oxidase assembly protein  37.5 
 
 		 192 aa  118  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3008  cytochrome c oxidase assembly protein  38.2 
 
 		 182 aa  118  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.732509  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0221  cytochrome C oxidase assembly protein  36.36 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.761807 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4608  cytochrome C oxidase assembly protein  35.52 
 
 		 193 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04840  aerobic respiration-related protein, putative  36.81 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0240  cytochrome C oxidase assembly protein  35.89 
 
 		 202 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0144291 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001447  cytochrome oxidase biogenesis protein Cox11-CtaG copper delivery to Cox1  36.9 
 
 		 179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0328  cytochrome C oxidase assembly protein  39.24 
 
 		 182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.378424  normal  0.0110245 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0256  cytochrome C oxidase assembly protein  38.36 
 
 		 187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3179  cytochrome C oxidase assembly protein  37.88 
 
 		 210 aa  115  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000976115  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0295  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  39.51 
 
 		 180 aa  115  6e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3821  cytochrome C oxidase assembly protein  37.78 
 
 		 214 aa  115  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.171251 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3993  cytochrome C oxidase assembly protein  35.39 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0316  cytochrome C oxidase assembly protein  37.02 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.677222  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4001  cytochrome C oxidase assembly protein  35.29 
 
 		 191 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3793  cytochrome C oxidase assembly protein  34.83 
 
 		 193 aa  112  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3866  cytochrome C oxidase assembly protein  34.83 
 
 		 193 aa  112  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0152  cytochrome C oxidase assembly protein  37.11 
 
 		 193 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4114  cytochrome C oxidase assembly protein  37.11 
 
 		 193 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4313  cytochrome C oxidase assembly protein  37.11 
 
 		 193 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1677  cytochrome C oxidase assembly protein  37.24 
 
 		 197 aa  111  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1382  cytochrome C oxidase assembly protein  36.17 
 
 		 224 aa  111  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04011  cytochrome C oxidase assembly protein  36.11 
 
 		 195 aa  111  9e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1682  cytochrome C oxidase assembly protein  38.86 
 
 		 190 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.912645  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4389  cytochrome C oxidase assembly protein  37.19 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06270  cytochrome C oxidase assembly protein  32.98 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1938  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  38.92 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.233238  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4244  cytochrome C oxidase assembly protein  34.01 
 
 		 200 aa  109  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.770426  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3905  cytochrome C oxidase assembly protein  37.36 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>