132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4318 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4318  cytochrome C oxidase assembly protein  100 
 
 		 195 aa  404  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0420878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0477  cytochrome C oxidase assembly protein  60.43 
 
 		 191 aa  229  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1828  cytochrome C oxidase assembly protein  59.89 
 
 		 191 aa  228  4e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2333  cytochrome C oxidase assembly protein  63.03 
 
 		 195 aa  227  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.866958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1143  cytochrome C oxidase assembly protein  56.91 
 
 		 203 aa  225  4e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0617  cytochrome C oxidase assembly protein  65.64 
 
 		 192 aa  223  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3152  cytochrome C oxidase assembly protein  56.91 
 
 		 191 aa  216  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0585  cytochrome C oxidase assembly protein  53.98 
 
 		 203 aa  194  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0102907  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0471  cytochrome C oxidase assembly protein  53.98 
 
 		 201 aa  189  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.312234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0477  cytochrome C oxidase assembly protein  53.41 
 
 		 201 aa  187  5.999999999999999e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.372099  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0522  cytochrome C oxidase assembly protein  48.42 
 
 		 198 aa  187  5.999999999999999e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.443491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2230  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  52.35 
 
 		 188 aa  186  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0596282  hitchhiker  0.0054778 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0745  cytochrome C oxidase assembly protein  54.17 
 
 		 202 aa  174  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101336  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3879  cytochrome C oxidase assembly protein  46.45 
 
 		 192 aa  174  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.217294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0917  cytochrome C oxidase assembly protein  48.28 
 
 		 209 aa  174  7e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0526885  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0606  cytochrome C oxidase assembly protein  45.71 
 
 		 202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4584  cytochrome C oxidase assembly protein  51.4 
 
 		 208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0646  cytochrome C oxidase assembly protein  46.29 
 
 		 202 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.18748 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1884  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  50.6 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0172285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4502  cytochrome C oxidase assembly protein  45.86 
 
 		 229 aa  167  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550907  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1402  cytochrome C oxidase assembly protein  50.85 
 
 		 186 aa  167  8e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.510495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0818  cytochrome C oxidase assembly protein  49.71 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4791  cytochrome C oxidase assembly protein  51.14 
 
 		 206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0227  cytochrome C oxidase assembly protein  45.71 
 
 		 213 aa  158  4e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0765  cytochrome C oxidase assembly protein  45.71 
 
 		 213 aa  158  4e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0832  cytochrome C oxidase assembly protein  46.07 
 
 		 216 aa  158  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal  0.277813 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0903  cytochrome C oxidase assembly protein  45.51 
 
 		 208 aa  157  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169536  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1044  cytochrome C oxidase assembly protein  40.31 
 
 		 205 aa  157  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0259  cytochrome C oxidase assembly protein  45.95 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3459  cytochrome C oxidase assembly protein  45.95 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.788459  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0726  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  43.62 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0871467 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16147  predicted protein  43.35 
 
 		 200 aa  153  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.448823  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0949  cytochrome C oxidase assembly protein  42.86 
 
 		 178 aa  152  2.9999999999999998e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4644  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  44.37 
 
 		 203 aa  152  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.106976  normal  0.107264 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0848  cytochrome C oxidase assembly protein  41.52 
 
 		 174 aa  149  2e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3455  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  40.86 
 
 		 202 aa  149  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.919622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3583  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  42.02 
 
 		 202 aa  149  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3259  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  42.02 
 
 		 202 aa  149  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0258  cytochrome C oxidase assembly protein  43.75 
 
 		 181 aa  148  5e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.623764  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1241  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  40.68 
 
 		 201 aa  148  6e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.72167 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0264  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  42.77 
 
 		 203 aa  147  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_7271  cox 11/CtaG family of cytochrome oxidase assembly protein-like protein  40.57 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.044375  normal  0.225015 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0029  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  38.74 
 
 		 203 aa  144  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.310353  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0651  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  39.88 
 
 		 308 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2345  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  41.04 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.608732 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1055  cytochrome C oxidase assembly protein  42.86 
 
 		 175 aa  138  6e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.22643  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82827  Cytochrome oxidase assembly factor COX11  40.85 
 
 		 246 aa  132  3e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.143485  normal  0.307671 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04840  aerobic respiration-related protein, putative  38.18 
 
 		 296 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06297  cytochrome c oxidase assembly protein Cox11, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12260)  37.91 
 
 		 250 aa  128  5.0000000000000004e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0313  cytochrome C oxidase assembly protein  42.46 
 
 		 196 aa  121  7e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0575051 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3045  cytochrome C oxidase assembly protein  41.76 
 
 		 210 aa  121  8e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01000  cytochrome C oxidase assembly protein  41.1 
 
 		 184 aa  120  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0077  cytochrome C oxidase assembly protein  37.72 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01310  cytochrome C oxidase assembly protein  37.85 
 
 		 184 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.782313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0182  cytochrome C oxidase assembly protein  37.85 
 
 		 184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0144  cytochrome C oxidase assembly protein  41.26 
 
 		 182 aa  115  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04022  cytochrome C oxidase assembly protein  40.48 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0234  cytochrome C oxidase assembly protein  37.65 
 
 		 189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0119  cytochrome C oxidase assembly protein  35.83 
 
 		 188 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553473  normal  0.0134076 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0105  cytochrome C oxidase assembly protein  35.83 
 
 		 188 aa  110  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257574  normal  0.281788 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0121  cytochrome C oxidase assembly protein  35.83 
 
 		 188 aa  110  9e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0064  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  35.09 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1040  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  40.38 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1382  cytochrome C oxidase assembly protein  35.57 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1247  cytochrome C oxidase assembly protein  35.42 
 
 		 202 aa  108  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.403228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0547  cytochrome C oxidase assembly protein  36.41 
 
 		 212 aa  108  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4389  cytochrome C oxidase assembly protein  34.63 
 
 		 208 aa  108  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3534  cytochrome C oxidase assembly protein  35.5 
 
 		 206 aa  107  9.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.713357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2857  cytochrome C oxidase assembly protein  35.5 
 
 		 206 aa  107  9.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.459013  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0365  cytochrome C oxidase assembly protein  35.33 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3195  cytochrome C oxidase assembly protein  38.29 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0675  cytochrome C oxidase assembly protein  38.07 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.155472  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0240  cytochrome C oxidase assembly protein  36.02 
 
 		 202 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0144291 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0880  cytochrome C oxidase assembly protein  35.59 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0167  cytochrome C oxidase assembly protein  38.07 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1425  cytochrome C oxidase assembly protein  38.07 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0492  cytochrome C oxidase assembly protein  38.07 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0510  cytochrome C oxidase assembly protein  38.07 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2852  cytochrome C oxidase assembly protein  38.07 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0263  cytochrome C oxidase assembly protein  36.46 
 
 		 198 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1468  cytochrome C oxidase assembly protein  34.04 
 
 		 203 aa  105  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.867504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3179  cytochrome C oxidase assembly protein  36.57 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000976115  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0428  cytochrome C oxidase assembly protein  38.07 
 
 		 201 aa  105  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0185  cytochrome C oxidase assembly protein  34.52 
 
 		 185 aa  104  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001447  cytochrome oxidase biogenesis protein Cox11-CtaG copper delivery to Cox1  31.82 
 
 		 179 aa  105  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0221  cytochrome C oxidase assembly protein  36.16 
 
 		 202 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.761807 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4169  cytochrome C oxidase assembly protein  37.35 
 
 		 204 aa  104  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.985179 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0124  cytochrome C oxidase assembly protein  34.88 
 
 		 188 aa  104  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4608  cytochrome C oxidase assembly protein  32.75 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0316  cytochrome C oxidase assembly protein  34.74 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.677222  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2900  cytochrome C oxidase assembly protein  35.05 
 
 		 202 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2761  cytochrome C oxidase assembly protein  35.05 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6174  cytochrome C oxidase assembly protein  34.69 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0279  cytochrome C oxidase assembly protein  38.65 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0295  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  37.35 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3905  cytochrome C oxidase assembly protein  35.75 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1938  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  35.91 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.233238  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1677  cytochrome C oxidase assembly protein  36.36 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0176  cytochrome C oxidase assembly protein  34.1 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2844  cytochrome C oxidase assembly protein  35.75 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.252567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>