132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0316 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0316  cytochrome C oxidase assembly protein  100 
 
 		 204 aa  424  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.677222  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0263  cytochrome C oxidase assembly protein  86.1 
 
 		 198 aa  341  4e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0365  cytochrome C oxidase assembly protein  70.68 
 
 		 202 aa  288  4e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0240  cytochrome C oxidase assembly protein  69.31 
 
 		 202 aa  278  4e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0144291 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0221  cytochrome C oxidase assembly protein  68.78 
 
 		 202 aa  278  5e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.761807 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2230  cytochrome C oxidase assembly protein  65.17 
 
 		 202 aa  264  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2844  cytochrome C oxidase assembly protein  65.17 
 
 		 202 aa  264  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.252567  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6174  cytochrome C oxidase assembly protein  65.17 
 
 		 202 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0675  cytochrome C oxidase assembly protein  65.9 
 
 		 201 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.155472  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0167  cytochrome C oxidase assembly protein  65.9 
 
 		 201 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1425  cytochrome C oxidase assembly protein  65.9 
 
 		 201 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0492  cytochrome C oxidase assembly protein  65.9 
 
 		 201 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0510  cytochrome C oxidase assembly protein  65.9 
 
 		 201 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2852  cytochrome C oxidase assembly protein  65.9 
 
 		 201 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0279  cytochrome C oxidase assembly protein  63.59 
 
 		 203 aa  262  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2855  cytochrome C oxidase assembly protein  64.61 
 
 		 202 aa  261  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.237501  normal  0.641869 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2761  cytochrome C oxidase assembly protein  64.25 
 
 		 202 aa  259  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2900  cytochrome C oxidase assembly protein  64.25 
 
 		 202 aa  259  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0428  cytochrome C oxidase assembly protein  62.71 
 
 		 201 aa  256  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0547  cytochrome C oxidase assembly protein  62.15 
 
 		 212 aa  256  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0459  cytochrome C oxidase assembly protein  66.08 
 
 		 203 aa  255  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.51439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4169  cytochrome C oxidase assembly protein  62.15 
 
 		 204 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.985179 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3195  cytochrome C oxidase assembly protein  66.27 
 
 		 186 aa  252  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1643  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  63.07 
 
 		 194 aa  238  5e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0653382  normal  0.894689 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1938  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  62.09 
 
 		 193 aa  238  5e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.233238  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3179  cytochrome C oxidase assembly protein  58.42 
 
 		 210 aa  226  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000976115  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1382  cytochrome C oxidase assembly protein  54.45 
 
 		 224 aa  224  8e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0880  cytochrome C oxidase assembly protein  60.44 
 
 		 192 aa  221  8e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1682  cytochrome C oxidase assembly protein  57.45 
 
 		 190 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.912645  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1247  cytochrome C oxidase assembly protein  58.79 
 
 		 202 aa  218  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.403228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3905  cytochrome C oxidase assembly protein  56.68 
 
 		 205 aa  218  5e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3821  cytochrome C oxidase assembly protein  56.38 
 
 		 214 aa  216  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.171251 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1677  cytochrome C oxidase assembly protein  56.52 
 
 		 197 aa  215  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2857  cytochrome C oxidase assembly protein  52.04 
 
 		 206 aa  213  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.459013  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3534  cytochrome C oxidase assembly protein  52.04 
 
 		 206 aa  213  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.713357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4389  cytochrome C oxidase assembly protein  56.38 
 
 		 208 aa  209  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0185  cytochrome C oxidase assembly protein  50.6 
 
 		 185 aa  193  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0328  cytochrome C oxidase assembly protein  49.44 
 
 		 182 aa  178  4e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.378424  normal  0.0110245 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3045  cytochrome C oxidase assembly protein  45.71 
 
 		 210 aa  158  6e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04011  cytochrome C oxidase assembly protein  43.68 
 
 		 195 aa  155  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0064  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  45.88 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0234  cytochrome C oxidase assembly protein  41.4 
 
 		 189 aa  152  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4001  cytochrome C oxidase assembly protein  42.61 
 
 		 191 aa  152  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3793  cytochrome C oxidase assembly protein  40.78 
 
 		 193 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0295  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  43.71 
 
 		 180 aa  149  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3866  cytochrome C oxidase assembly protein  40.22 
 
 		 193 aa  148  7e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0152  cytochrome C oxidase assembly protein  40.22 
 
 		 193 aa  148  7e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4114  cytochrome C oxidase assembly protein  40.22 
 
 		 193 aa  148  7e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4313  cytochrome C oxidase assembly protein  40.22 
 
 		 193 aa  148  7e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0256  cytochrome C oxidase assembly protein  42.86 
 
 		 187 aa  147  8e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0882  cytochrome C oxidase assembly protein  42.94 
 
 		 182 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3993  cytochrome C oxidase assembly protein  40.22 
 
 		 193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4182  cytochrome C oxidase assembly protein  39.66 
 
 		 193 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01310  cytochrome C oxidase assembly protein  42.35 
 
 		 184 aa  144  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.782313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06270  cytochrome C oxidase assembly protein  40.72 
 
 		 196 aa  145  6e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1468  cytochrome C oxidase assembly protein  41.44 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.867504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0182  cytochrome C oxidase assembly protein  41.76 
 
 		 184 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001447  cytochrome oxidase biogenesis protein Cox11-CtaG copper delivery to Cox1  40.94 
 
 		 179 aa  142  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4608  cytochrome C oxidase assembly protein  41.07 
 
 		 193 aa  142  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0176  cytochrome C oxidase assembly protein  41.07 
 
 		 187 aa  141  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4244  cytochrome C oxidase assembly protein  41.44 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.770426  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01000  cytochrome C oxidase assembly protein  45.78 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3485  cytochrome C oxidase assembly protein  39.88 
 
 		 188 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.117347 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0196  cytochrome C oxidase assembly protein  41.07 
 
 		 189 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3784  cytochrome C oxidase assembly protein  40.57 
 
 		 188 aa  139  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0123  cytochrome C oxidase assembly protein  41.42 
 
 		 189 aa  136  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0124  cytochrome C oxidase assembly protein  41.9 
 
 		 188 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0077  cytochrome C oxidase assembly protein  40.88 
 
 		 183 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5258  cytochrome c oxidase assembly protein  41.67 
 
 		 162 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2960  cytochrome C oxidase assembly protein  42.21 
 
 		 180 aa  134  9e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2809  cytochrome C oxidase assembly protein  42.21 
 
 		 180 aa  134  9e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0119  cytochrome C oxidase assembly protein  41.71 
 
 		 188 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553473  normal  0.0134076 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0105  cytochrome C oxidase assembly protein  41.71 
 
 		 188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257574  normal  0.281788 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0121  cytochrome C oxidase assembly protein  41.71 
 
 		 188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3519  cytochrome C oxidase assembly protein  38.73 
 
 		 187 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0038  cytochrome C oxidase assembly protein  39.31 
 
 		 207 aa  128  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.379373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0313  cytochrome C oxidase assembly protein  43.21 
 
 		 196 aa  128  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0575051 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4791  cytochrome C oxidase assembly protein  40.74 
 
 		 206 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0818  cytochrome C oxidase assembly protein  41.44 
 
 		 206 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04022  cytochrome C oxidase assembly protein  39.76 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1040  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  37.35 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0144  cytochrome C oxidase assembly protein  42.77 
 
 		 182 aa  122  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3008  cytochrome c oxidase assembly protein  37.65 
 
 		 182 aa  122  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.732509  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0726  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  40.34 
 
 		 208 aa  121  6e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0871467 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2230  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  42.77 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0596282  hitchhiker  0.0054778 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0832  cytochrome C oxidase assembly protein  40 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal  0.277813 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0477  cytochrome C oxidase assembly protein  40.43 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.372099  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0471  cytochrome C oxidase assembly protein  38.83 
 
 		 201 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.312234  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0903  cytochrome C oxidase assembly protein  38.89 
 
 		 208 aa  118  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169536  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4584  cytochrome C oxidase assembly protein  39.34 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0285  cytochrome C oxidase assembly protein  38.95 
 
 		 163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0585  cytochrome C oxidase assembly protein  37.14 
 
 		 203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0102907  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06297  cytochrome c oxidase assembly protein Cox11, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12260)  38.46 
 
 		 250 aa  113  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0227  cytochrome C oxidase assembly protein  37.02 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0765  cytochrome C oxidase assembly protein  37.02 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0745  cytochrome C oxidase assembly protein  36.76 
 
 		 202 aa  112  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101336  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4644  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  41.57 
 
 		 203 aa  112  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.106976  normal  0.107264 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0259  cytochrome C oxidase assembly protein  35.12 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3459  cytochrome C oxidase assembly protein  35.12 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.788459  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0522  cytochrome C oxidase assembly protein  36.6 
 
 		 198 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.443491  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>