132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5258 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5258  cytochrome c oxidase assembly protein  100 
 
 		 162 aa  338  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0285  cytochrome C oxidase assembly protein  71.17 
 
 		 163 aa  246  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0119  cytochrome C oxidase assembly protein  61.31 
 
 		 188 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553473  normal  0.0134076 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0105  cytochrome C oxidase assembly protein  60.71 
 
 		 188 aa  210  7e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257574  normal  0.281788 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0121  cytochrome C oxidase assembly protein  60.71 
 
 		 188 aa  210  7e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0077  cytochrome C oxidase assembly protein  58.14 
 
 		 183 aa  208  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0124  cytochrome C oxidase assembly protein  61.76 
 
 		 188 aa  208  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0182  cytochrome C oxidase assembly protein  56.8 
 
 		 184 aa  206  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01310  cytochrome C oxidase assembly protein  56.21 
 
 		 184 aa  205  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.782313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01000  cytochrome C oxidase assembly protein  57.89 
 
 		 184 aa  189  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0144  cytochrome C oxidase assembly protein  58.14 
 
 		 182 aa  185  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2960  cytochrome C oxidase assembly protein  44.87 
 
 		 180 aa  149  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2809  cytochrome C oxidase assembly protein  44.87 
 
 		 180 aa  149  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4244  cytochrome C oxidase assembly protein  41.86 
 
 		 200 aa  149  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.770426  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04011  cytochrome C oxidase assembly protein  40.23 
 
 		 195 aa  144  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0234  cytochrome C oxidase assembly protein  40.72 
 
 		 189 aa  144  6e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3045  cytochrome C oxidase assembly protein  40.48 
 
 		 210 aa  140  9e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4608  cytochrome C oxidase assembly protein  42.35 
 
 		 193 aa  138  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0038  cytochrome C oxidase assembly protein  45.06 
 
 		 207 aa  138  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.379373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0064  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  41.57 
 
 		 198 aa  137  8.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3793  cytochrome C oxidase assembly protein  41.76 
 
 		 193 aa  135  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3866  cytochrome C oxidase assembly protein  41.76 
 
 		 193 aa  135  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4389  cytochrome C oxidase assembly protein  39.66 
 
 		 208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0316  cytochrome C oxidase assembly protein  41.67 
 
 		 204 aa  134  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.677222  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0256  cytochrome C oxidase assembly protein  39.08 
 
 		 187 aa  134  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3993  cytochrome C oxidase assembly protein  41.76 
 
 		 193 aa  134  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4182  cytochrome C oxidase assembly protein  39.18 
 
 		 193 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0152  cytochrome C oxidase assembly protein  39.18 
 
 		 193 aa  134  8e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4114  cytochrome C oxidase assembly protein  39.18 
 
 		 193 aa  134  8e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4313  cytochrome C oxidase assembly protein  39.18 
 
 		 193 aa  134  8e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0882  cytochrome C oxidase assembly protein  39.39 
 
 		 182 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0263  cytochrome C oxidase assembly protein  41.42 
 
 		 198 aa  132  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0221  cytochrome C oxidase assembly protein  39.77 
 
 		 202 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.761807 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3784  cytochrome C oxidase assembly protein  39.66 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3519  cytochrome C oxidase assembly protein  37.93 
 
 		 187 aa  131  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3485  cytochrome C oxidase assembly protein  40.45 
 
 		 188 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.117347 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0240  cytochrome C oxidase assembly protein  39.18 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0144291 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0365  cytochrome C oxidase assembly protein  38.98 
 
 		 202 aa  128  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0279  cytochrome C oxidase assembly protein  40.12 
 
 		 203 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4001  cytochrome C oxidase assembly protein  37.5 
 
 		 191 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0123  cytochrome C oxidase assembly protein  36.63 
 
 		 189 aa  127  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1040  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  39.02 
 
 		 175 aa  127  7.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2230  cytochrome C oxidase assembly protein  38.01 
 
 		 202 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2844  cytochrome C oxidase assembly protein  38.01 
 
 		 202 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.252567  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6174  cytochrome C oxidase assembly protein  38.01 
 
 		 202 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0459  cytochrome C oxidase assembly protein  38.46 
 
 		 203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.51439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2855  cytochrome C oxidase assembly protein  37.43 
 
 		 202 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.237501  normal  0.641869 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2761  cytochrome C oxidase assembly protein  37.43 
 
 		 202 aa  124  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2900  cytochrome C oxidase assembly protein  37.43 
 
 		 202 aa  124  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2715  cytochrome C oxidase assembly protein  37.65 
 
 		 172 aa  124  7e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.253936 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1468  cytochrome C oxidase assembly protein  37.36 
 
 		 203 aa  123  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.867504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4169  cytochrome C oxidase assembly protein  38.69 
 
 		 204 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.985179 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06270  cytochrome C oxidase assembly protein  37.95 
 
 		 196 aa  122  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1247  cytochrome C oxidase assembly protein  40.35 
 
 		 202 aa  122  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.403228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0880  cytochrome C oxidase assembly protein  39.77 
 
 		 192 aa  122  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0547  cytochrome C oxidase assembly protein  37.43 
 
 		 212 aa  121  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3905  cytochrome C oxidase assembly protein  39.77 
 
 		 205 aa  121  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1938  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  36.78 
 
 		 193 aa  121  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.233238  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0196  cytochrome C oxidase assembly protein  36.9 
 
 		 189 aa  120  7e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0675  cytochrome C oxidase assembly protein  36.26 
 
 		 201 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.155472  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0167  cytochrome C oxidase assembly protein  36.26 
 
 		 201 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1382  cytochrome C oxidase assembly protein  37.99 
 
 		 224 aa  119  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1425  cytochrome C oxidase assembly protein  36.26 
 
 		 201 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0492  cytochrome C oxidase assembly protein  36.26 
 
 		 201 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0510  cytochrome C oxidase assembly protein  36.26 
 
 		 201 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2852  cytochrome C oxidase assembly protein  36.26 
 
 		 201 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001447  cytochrome oxidase biogenesis protein Cox11-CtaG copper delivery to Cox1  35.67 
 
 		 179 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0176  cytochrome C oxidase assembly protein  36.16 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3195  cytochrome C oxidase assembly protein  36.9 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0428  cytochrome C oxidase assembly protein  35.09 
 
 		 201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1643  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  35.63 
 
 		 194 aa  118  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0653382  normal  0.894689 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0185  cytochrome C oxidase assembly protein  33.73 
 
 		 185 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0313  cytochrome C oxidase assembly protein  37.97 
 
 		 196 aa  117  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0575051 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1682  cytochrome C oxidase assembly protein  38.24 
 
 		 190 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.912645  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0295  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  38.32 
 
 		 180 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04022  cytochrome C oxidase assembly protein  36.2 
 
 		 198 aa  113  8.999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3008  cytochrome c oxidase assembly protein  37.5 
 
 		 182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.732509  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3179  cytochrome C oxidase assembly protein  36.99 
 
 		 210 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000976115  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0328  cytochrome C oxidase assembly protein  33.54 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.378424  normal  0.0110245 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3534  cytochrome C oxidase assembly protein  36.93 
 
 		 206 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.713357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2857  cytochrome C oxidase assembly protein  36.93 
 
 		 206 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.459013  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1677  cytochrome C oxidase assembly protein  36.57 
 
 		 197 aa  111  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3821  cytochrome C oxidase assembly protein  35.63 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.171251 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1828  cytochrome C oxidase assembly protein  36.88 
 
 		 191 aa  103  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0477  cytochrome C oxidase assembly protein  36.88 
 
 		 191 aa  103  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0585  cytochrome C oxidase assembly protein  34.86 
 
 		 203 aa  103  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0102907  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4318  cytochrome C oxidase assembly protein  35.5 
 
 		 195 aa  100  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0420878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2230  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  37.01 
 
 		 188 aa  98.6  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0596282  hitchhiker  0.0054778 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1143  cytochrome C oxidase assembly protein  31.25 
 
 		 203 aa  95.9  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0617  cytochrome C oxidase assembly protein  41.67 
 
 		 192 aa  94.7  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2333  cytochrome C oxidase assembly protein  39.17 
 
 		 195 aa  92.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.866958  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0471  cytochrome C oxidase assembly protein  34.36 
 
 		 201 aa  92  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.312234  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0522  cytochrome C oxidase assembly protein  33.74 
 
 		 198 aa  92  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.443491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1402  cytochrome C oxidase assembly protein  35.58 
 
 		 186 aa  90.9  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.510495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0477  cytochrome C oxidase assembly protein  33.74 
 
 		 201 aa  90.5  9e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.372099  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04840  aerobic respiration-related protein, putative  33.78 
 
 		 296 aa  89.7  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0646  cytochrome C oxidase assembly protein  31.55 
 
 		 202 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.18748 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0606  cytochrome C oxidase assembly protein  31.55 
 
 		 202 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0227  cytochrome C oxidase assembly protein  34.38 
 
 		 213 aa  88.6  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0765  cytochrome C oxidase assembly protein  34.38 
 
 		 213 aa  88.6  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35129  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>