132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0038 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0038  cytochrome C oxidase assembly protein  100 
 
 		 207 aa  428  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.379373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0064  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  49.73 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0234  cytochrome C oxidase assembly protein  43.92 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3485  cytochrome C oxidase assembly protein  45.36 
 
 		 188 aa  165  5e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.117347 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0144  cytochrome C oxidase assembly protein  48.45 
 
 		 182 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0077  cytochrome C oxidase assembly protein  48.24 
 
 		 183 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4114  cytochrome C oxidase assembly protein  47.56 
 
 		 193 aa  161  6e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0152  cytochrome C oxidase assembly protein  47.56 
 
 		 193 aa  161  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4313  cytochrome C oxidase assembly protein  47.56 
 
 		 193 aa  161  6e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04011  cytochrome C oxidase assembly protein  44.2 
 
 		 195 aa  160  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4182  cytochrome C oxidase assembly protein  47.56 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4001  cytochrome C oxidase assembly protein  42.13 
 
 		 191 aa  160  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4608  cytochrome C oxidase assembly protein  47.56 
 
 		 193 aa  159  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01310  cytochrome C oxidase assembly protein  47.2 
 
 		 184 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.782313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0123  cytochrome C oxidase assembly protein  45.03 
 
 		 189 aa  158  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3993  cytochrome C oxidase assembly protein  45.14 
 
 		 193 aa  157  7e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0182  cytochrome C oxidase assembly protein  44.91 
 
 		 184 aa  157  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3793  cytochrome C oxidase assembly protein  44.57 
 
 		 193 aa  157  9e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3866  cytochrome C oxidase assembly protein  44.57 
 
 		 193 aa  157  9e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0119  cytochrome C oxidase assembly protein  42.7 
 
 		 188 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553473  normal  0.0134076 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0105  cytochrome C oxidase assembly protein  42.13 
 
 		 188 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257574  normal  0.281788 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01000  cytochrome C oxidase assembly protein  45.51 
 
 		 184 aa  156  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3784  cytochrome C oxidase assembly protein  47.56 
 
 		 188 aa  156  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0121  cytochrome C oxidase assembly protein  42.13 
 
 		 188 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3519  cytochrome C oxidase assembly protein  44.71 
 
 		 187 aa  155  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4244  cytochrome C oxidase assembly protein  44.25 
 
 		 200 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.770426  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0256  cytochrome C oxidase assembly protein  44.12 
 
 		 187 aa  154  9e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0882  cytochrome C oxidase assembly protein  40.88 
 
 		 182 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0176  cytochrome C oxidase assembly protein  42.11 
 
 		 187 aa  151  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0124  cytochrome C oxidase assembly protein  41.9 
 
 		 188 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0196  cytochrome C oxidase assembly protein  44.44 
 
 		 189 aa  149  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3045  cytochrome C oxidase assembly protein  41.92 
 
 		 210 aa  145  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2960  cytochrome C oxidase assembly protein  45.06 
 
 		 180 aa  145  5e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2809  cytochrome C oxidase assembly protein  45.06 
 
 		 180 aa  145  5e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001447  cytochrome oxidase biogenesis protein Cox11-CtaG copper delivery to Cox1  39.55 
 
 		 179 aa  141  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06270  cytochrome C oxidase assembly protein  36.63 
 
 		 196 aa  140  9e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5258  cytochrome c oxidase assembly protein  45.06 
 
 		 162 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0295  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  42.51 
 
 		 180 aa  137  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0328  cytochrome C oxidase assembly protein  43.98 
 
 		 182 aa  137  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.378424  normal  0.0110245 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0279  cytochrome C oxidase assembly protein  41.46 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4169  cytochrome C oxidase assembly protein  41.72 
 
 		 204 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.985179 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0547  cytochrome C oxidase assembly protein  41.1 
 
 		 212 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2230  cytochrome C oxidase assembly protein  39.57 
 
 		 202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2844  cytochrome C oxidase assembly protein  39.57 
 
 		 202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.252567  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3905  cytochrome C oxidase assembly protein  42.2 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0459  cytochrome C oxidase assembly protein  42.33 
 
 		 203 aa  132  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.51439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6174  cytochrome C oxidase assembly protein  42.33 
 
 		 202 aa  131  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0263  cytochrome C oxidase assembly protein  41.21 
 
 		 198 aa  131  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2855  cytochrome C oxidase assembly protein  39.04 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.237501  normal  0.641869 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3534  cytochrome C oxidase assembly protein  40.11 
 
 		 206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.713357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2857  cytochrome C oxidase assembly protein  40.11 
 
 		 206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.459013  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0675  cytochrome C oxidase assembly protein  39.23 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.155472  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0167  cytochrome C oxidase assembly protein  39.23 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1425  cytochrome C oxidase assembly protein  39.23 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0492  cytochrome C oxidase assembly protein  39.23 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0510  cytochrome C oxidase assembly protein  39.23 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2852  cytochrome C oxidase assembly protein  39.23 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1677  cytochrome C oxidase assembly protein  41.04 
 
 		 197 aa  129  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0316  cytochrome C oxidase assembly protein  39.31 
 
 		 204 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.677222  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0428  cytochrome C oxidase assembly protein  39.26 
 
 		 201 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2900  cytochrome C oxidase assembly protein  37.97 
 
 		 202 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3195  cytochrome C oxidase assembly protein  40.24 
 
 		 186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4389  cytochrome C oxidase assembly protein  40.11 
 
 		 208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2761  cytochrome C oxidase assembly protein  37.43 
 
 		 202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3821  cytochrome C oxidase assembly protein  39.08 
 
 		 214 aa  125  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.171251 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1382  cytochrome C oxidase assembly protein  39.88 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0285  cytochrome C oxidase assembly protein  41.18 
 
 		 163 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1468  cytochrome C oxidase assembly protein  35.75 
 
 		 203 aa  125  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.867504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3008  cytochrome c oxidase assembly protein  37.64 
 
 		 182 aa  125  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.732509  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1643  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  40 
 
 		 194 aa  125  6e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0653382  normal  0.894689 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1040  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  41.14 
 
 		 175 aa  123  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3179  cytochrome C oxidase assembly protein  40.24 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000976115  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1938  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  40 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.233238  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1682  cytochrome C oxidase assembly protein  41.07 
 
 		 190 aa  122  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.912645  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1247  cytochrome C oxidase assembly protein  39.29 
 
 		 202 aa  122  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.403228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0880  cytochrome C oxidase assembly protein  38.69 
 
 		 192 aa  121  8e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0240  cytochrome C oxidase assembly protein  37.42 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0144291 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0365  cytochrome C oxidase assembly protein  38.65 
 
 		 202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0221  cytochrome C oxidase assembly protein  37.42 
 
 		 202 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.761807 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2715  cytochrome C oxidase assembly protein  38.75 
 
 		 172 aa  118  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.253936 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0313  cytochrome C oxidase assembly protein  37.74 
 
 		 196 aa  117  9e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0575051 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0185  cytochrome C oxidase assembly protein  34.15 
 
 		 185 aa  115  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2333  cytochrome C oxidase assembly protein  40.52 
 
 		 195 aa  115  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.866958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04022  cytochrome C oxidase assembly protein  36.72 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2230  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  39.04 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0596282  hitchhiker  0.0054778 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0522  cytochrome C oxidase assembly protein  35.63 
 
 		 198 aa  105  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.443491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1884  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  33.73 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0172285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1143  cytochrome C oxidase assembly protein  35.12 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0606  cytochrome C oxidase assembly protein  37.13 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0477  cytochrome C oxidase assembly protein  35.62 
 
 		 191 aa  101  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0227  cytochrome C oxidase assembly protein  34.59 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0765  cytochrome C oxidase assembly protein  34.59 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0617  cytochrome C oxidase assembly protein  37.5 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184092  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06297  cytochrome c oxidase assembly protein Cox11, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12260)  28.87 
 
 		 250 aa  99.4  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1828  cytochrome C oxidase assembly protein  35 
 
 		 191 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0646  cytochrome C oxidase assembly protein  35.93 
 
 		 202 aa  99  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.18748 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0585  cytochrome C oxidase assembly protein  33.87 
 
 		 203 aa  98.6  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0102907  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4584  cytochrome C oxidase assembly protein  37.58 
 
 		 208 aa  98.2  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0818  cytochrome C oxidase assembly protein  35.76 
 
 		 206 aa  97.8  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0471  cytochrome C oxidase assembly protein  31.96 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.312234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>