132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1682 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1682  cytochrome C oxidase assembly protein  100 
 
 		 190 aa  394  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.912645  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0880  cytochrome C oxidase assembly protein  81.42 
 
 		 192 aa  317  7e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1247  cytochrome C oxidase assembly protein  79.78 
 
 		 202 aa  315  3e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.403228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1677  cytochrome C oxidase assembly protein  74.23 
 
 		 197 aa  305  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3534  cytochrome C oxidase assembly protein  75.14 
 
 		 206 aa  301  4.0000000000000003e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.713357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2857  cytochrome C oxidase assembly protein  75.14 
 
 		 206 aa  301  4.0000000000000003e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.459013  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1382  cytochrome C oxidase assembly protein  76.24 
 
 		 224 aa  301  5.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3905  cytochrome C oxidase assembly protein  75.14 
 
 		 205 aa  296  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4389  cytochrome C oxidase assembly protein  73.37 
 
 		 208 aa  289  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3179  cytochrome C oxidase assembly protein  73.86 
 
 		 210 aa  281  5.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000976115  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3821  cytochrome C oxidase assembly protein  71.51 
 
 		 214 aa  264  5e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.171251 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0547  cytochrome C oxidase assembly protein  63.43 
 
 		 212 aa  227  6e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0263  cytochrome C oxidase assembly protein  61.93 
 
 		 198 aa  227  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4169  cytochrome C oxidase assembly protein  63.91 
 
 		 204 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.985179 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0279  cytochrome C oxidase assembly protein  59.47 
 
 		 203 aa  221  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0316  cytochrome C oxidase assembly protein  57.45 
 
 		 204 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.677222  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0365  cytochrome C oxidase assembly protein  56.98 
 
 		 202 aa  214  5.9999999999999996e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0459  cytochrome C oxidase assembly protein  60.95 
 
 		 203 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.51439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0240  cytochrome C oxidase assembly protein  56.25 
 
 		 202 aa  211  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0144291 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0675  cytochrome C oxidase assembly protein  58.38 
 
 		 201 aa  210  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.155472  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2230  cytochrome C oxidase assembly protein  59.66 
 
 		 202 aa  209  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2844  cytochrome C oxidase assembly protein  59.66 
 
 		 202 aa  209  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.252567  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0167  cytochrome C oxidase assembly protein  58.38 
 
 		 201 aa  210  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1425  cytochrome C oxidase assembly protein  58.38 
 
 		 201 aa  210  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0492  cytochrome C oxidase assembly protein  58.38 
 
 		 201 aa  210  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0510  cytochrome C oxidase assembly protein  58.38 
 
 		 201 aa  210  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2852  cytochrome C oxidase assembly protein  58.38 
 
 		 201 aa  210  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3195  cytochrome C oxidase assembly protein  58.38 
 
 		 186 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6174  cytochrome C oxidase assembly protein  59.66 
 
 		 202 aa  209  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2855  cytochrome C oxidase assembly protein  59.66 
 
 		 202 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.237501  normal  0.641869 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0221  cytochrome C oxidase assembly protein  55.68 
 
 		 202 aa  209  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.761807 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2900  cytochrome C oxidase assembly protein  59.66 
 
 		 202 aa  208  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2761  cytochrome C oxidase assembly protein  59.66 
 
 		 202 aa  208  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0428  cytochrome C oxidase assembly protein  58.38 
 
 		 201 aa  205  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1643  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  58.29 
 
 		 194 aa  205  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0653382  normal  0.894689 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1938  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  57.8 
 
 		 193 aa  204  5e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.233238  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0185  cytochrome C oxidase assembly protein  50 
 
 		 185 aa  187  7e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0328  cytochrome C oxidase assembly protein  48.52 
 
 		 182 aa  173  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.378424  normal  0.0110245 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3045  cytochrome C oxidase assembly protein  43.93 
 
 		 210 aa  154  6e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0182  cytochrome C oxidase assembly protein  42.78 
 
 		 184 aa  153  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01310  cytochrome C oxidase assembly protein  42.22 
 
 		 184 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.782313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0064  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  44.51 
 
 		 198 aa  152  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1468  cytochrome C oxidase assembly protein  43.33 
 
 		 203 aa  151  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.867504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04011  cytochrome C oxidase assembly protein  40.46 
 
 		 195 aa  145  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3793  cytochrome C oxidase assembly protein  37.91 
 
 		 193 aa  144  6e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3866  cytochrome C oxidase assembly protein  37.91 
 
 		 193 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0077  cytochrome C oxidase assembly protein  40.76 
 
 		 183 aa  143  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0295  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  46.2 
 
 		 180 aa  142  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4608  cytochrome C oxidase assembly protein  37.78 
 
 		 193 aa  141  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3993  cytochrome C oxidase assembly protein  36.81 
 
 		 193 aa  141  7e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3784  cytochrome C oxidase assembly protein  39.01 
 
 		 188 aa  141  7e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01000  cytochrome C oxidase assembly protein  46.63 
 
 		 184 aa  140  8e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4114  cytochrome C oxidase assembly protein  36.81 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3485  cytochrome C oxidase assembly protein  40 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.117347 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0152  cytochrome C oxidase assembly protein  36.81 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0196  cytochrome C oxidase assembly protein  39.31 
 
 		 189 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4001  cytochrome C oxidase assembly protein  38.59 
 
 		 191 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4313  cytochrome C oxidase assembly protein  36.81 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0176  cytochrome C oxidase assembly protein  38.73 
 
 		 187 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0123  cytochrome C oxidase assembly protein  38.73 
 
 		 189 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4182  cytochrome C oxidase assembly protein  36.26 
 
 		 193 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001447  cytochrome oxidase biogenesis protein Cox11-CtaG copper delivery to Cox1  40.72 
 
 		 179 aa  137  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0313  cytochrome C oxidase assembly protein  42.77 
 
 		 196 aa  134  7.000000000000001e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0575051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0119  cytochrome C oxidase assembly protein  38.95 
 
 		 188 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553473  normal  0.0134076 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0105  cytochrome C oxidase assembly protein  38.95 
 
 		 188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257574  normal  0.281788 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0256  cytochrome C oxidase assembly protein  36.78 
 
 		 187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04022  cytochrome C oxidase assembly protein  38.38 
 
 		 198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0121  cytochrome C oxidase assembly protein  38.95 
 
 		 188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0234  cytochrome C oxidase assembly protein  40.46 
 
 		 189 aa  132  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06270  cytochrome C oxidase assembly protein  38.5 
 
 		 196 aa  132  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0124  cytochrome C oxidase assembly protein  37.89 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4244  cytochrome C oxidase assembly protein  38.24 
 
 		 200 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.770426  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0882  cytochrome C oxidase assembly protein  39.77 
 
 		 182 aa  131  6e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2960  cytochrome C oxidase assembly protein  41.46 
 
 		 180 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2809  cytochrome C oxidase assembly protein  41.46 
 
 		 180 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1040  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  37.57 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3519  cytochrome C oxidase assembly protein  35.84 
 
 		 187 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2715  cytochrome C oxidase assembly protein  37.65 
 
 		 172 aa  125  4.0000000000000003e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.253936 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3008  cytochrome c oxidase assembly protein  37.29 
 
 		 182 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.732509  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0522  cytochrome C oxidase assembly protein  35.68 
 
 		 198 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.443491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0038  cytochrome C oxidase assembly protein  41.07 
 
 		 207 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.379373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0144  cytochrome C oxidase assembly protein  42.2 
 
 		 182 aa  121  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0471  cytochrome C oxidase assembly protein  40.94 
 
 		 201 aa  120  8e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.312234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0477  cytochrome C oxidase assembly protein  40.94 
 
 		 201 aa  121  8e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.372099  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0646  cytochrome C oxidase assembly protein  40.12 
 
 		 202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.18748 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0606  cytochrome C oxidase assembly protein  40.12 
 
 		 202 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0585  cytochrome C oxidase assembly protein  40.46 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0102907  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4502  cytochrome C oxidase assembly protein  39.11 
 
 		 229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550907  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0818  cytochrome C oxidase assembly protein  39.11 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2230  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  42.77 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0596282  hitchhiker  0.0054778 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5258  cytochrome c oxidase assembly protein  38.24 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0903  cytochrome C oxidase assembly protein  39.08 
 
 		 208 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169536  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0745  cytochrome C oxidase assembly protein  35.98 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101336  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4791  cytochrome C oxidase assembly protein  39.08 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0832  cytochrome C oxidase assembly protein  39.29 
 
 		 216 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal  0.277813 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0726  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  37.43 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0871467 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0285  cytochrome C oxidase assembly protein  38.24 
 
 		 163 aa  111  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0917  cytochrome C oxidase assembly protein  38.55 
 
 		 209 aa  111  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0526885  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0259  cytochrome C oxidase assembly protein  40.83 
 
 		 216 aa  111  7.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3459  cytochrome C oxidase assembly protein  40.83 
 
 		 216 aa  111  7.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.788459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>