132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1241 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1241  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  100 
 
 		 201 aa  410  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.72167 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0726  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  57.69 
 
 		 208 aa  239  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0871467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0832  cytochrome C oxidase assembly protein  44.56 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal  0.277813 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0818  cytochrome C oxidase assembly protein  44.28 
 
 		 206 aa  167  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0651  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  47.06 
 
 		 308 aa  167  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3879  cytochrome C oxidase assembly protein  48.89 
 
 		 192 aa  166  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.217294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0917  cytochrome C oxidase assembly protein  44.32 
 
 		 209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0526885  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0259  cytochrome C oxidase assembly protein  48.04 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3459  cytochrome C oxidase assembly protein  48.04 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.788459  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4644  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  45.74 
 
 		 203 aa  165  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.106976  normal  0.107264 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2230  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  46.47 
 
 		 188 aa  165  5e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0596282  hitchhiker  0.0054778 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4791  cytochrome C oxidase assembly protein  44.33 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0585  cytochrome C oxidase assembly protein  42.86 
 
 		 203 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0102907  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0227  cytochrome C oxidase assembly protein  49.12 
 
 		 213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0765  cytochrome C oxidase assembly protein  49.12 
 
 		 213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4584  cytochrome C oxidase assembly protein  42.57 
 
 		 208 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3259  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  42.86 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3583  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  42.86 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0029  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  42.35 
 
 		 203 aa  159  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.310353  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4502  cytochrome C oxidase assembly protein  44.05 
 
 		 229 aa  158  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550907  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0477  cytochrome C oxidase assembly protein  42.42 
 
 		 201 aa  158  7e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.372099  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0903  cytochrome C oxidase assembly protein  44.85 
 
 		 208 aa  157  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169536  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0471  cytochrome C oxidase assembly protein  41.92 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.312234  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3455  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  42.71 
 
 		 202 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.919622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0606  cytochrome C oxidase assembly protein  39.39 
 
 		 202 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1044  cytochrome C oxidase assembly protein  42.39 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0646  cytochrome C oxidase assembly protein  39.11 
 
 		 202 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.18748 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2345  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  43.45 
 
 		 206 aa  152  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.608732 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0745  cytochrome C oxidase assembly protein  42.94 
 
 		 202 aa  151  7e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101336  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4318  cytochrome C oxidase assembly protein  41.24 
 
 		 195 aa  151  7e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0420878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0264  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  41.86 
 
 		 203 aa  150  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_7271  cox 11/CtaG family of cytochrome oxidase assembly protein-like protein  39.64 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.044375  normal  0.225015 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0617  cytochrome C oxidase assembly protein  44.24 
 
 		 192 aa  148  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0522  cytochrome C oxidase assembly protein  39.78 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.443491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0848  cytochrome C oxidase assembly protein  40 
 
 		 174 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1884  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  42.53 
 
 		 216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0172285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1828  cytochrome C oxidase assembly protein  43.26 
 
 		 191 aa  143  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0477  cytochrome C oxidase assembly protein  43.26 
 
 		 191 aa  143  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16147  predicted protein  41.14 
 
 		 200 aa  143  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.448823  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1055  cytochrome C oxidase assembly protein  40.76 
 
 		 175 aa  140  9e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.22643  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2333  cytochrome C oxidase assembly protein  44.37 
 
 		 195 aa  140  9e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.866958  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04840  aerobic respiration-related protein, putative  40.62 
 
 		 296 aa  137  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1402  cytochrome C oxidase assembly protein  44.32 
 
 		 186 aa  135  5e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.510495  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0949  cytochrome C oxidase assembly protein  37.5 
 
 		 178 aa  134  9.999999999999999e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0258  cytochrome C oxidase assembly protein  40.52 
 
 		 181 aa  132  3e-30  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.623764  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1143  cytochrome C oxidase assembly protein  40.26 
 
 		 203 aa  132  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3152  cytochrome C oxidase assembly protein  33.53 
 
 		 191 aa  124  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0064  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  35.94 
 
 		 198 aa  122  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82827  Cytochrome oxidase assembly factor COX11  34.05 
 
 		 246 aa  119  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.143485  normal  0.307671 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06297  cytochrome c oxidase assembly protein Cox11, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12260)  33.54 
 
 		 250 aa  117  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4608  cytochrome C oxidase assembly protein  33.51 
 
 		 193 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3793  cytochrome C oxidase assembly protein  32.84 
 
 		 193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3866  cytochrome C oxidase assembly protein  32.84 
 
 		 193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0152  cytochrome C oxidase assembly protein  34.36 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4114  cytochrome C oxidase assembly protein  34.36 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4313  cytochrome C oxidase assembly protein  34.36 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1040  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  40.24 
 
 		 175 aa  112  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0279  cytochrome C oxidase assembly protein  33.82 
 
 		 203 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3993  cytochrome C oxidase assembly protein  33.51 
 
 		 193 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4182  cytochrome C oxidase assembly protein  34.36 
 
 		 193 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0547  cytochrome C oxidase assembly protein  34.41 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0256  cytochrome C oxidase assembly protein  34.5 
 
 		 187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0328  cytochrome C oxidase assembly protein  35 
 
 		 182 aa  108  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.378424  normal  0.0110245 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0459  cytochrome C oxidase assembly protein  38.22 
 
 		 203 aa  108  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.51439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3045  cytochrome C oxidase assembly protein  36.22 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001447  cytochrome oxidase biogenesis protein Cox11-CtaG copper delivery to Cox1  34.15 
 
 		 179 aa  108  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0365  cytochrome C oxidase assembly protein  35.08 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3784  cytochrome C oxidase assembly protein  32.98 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4169  cytochrome C oxidase assembly protein  33.87 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.985179 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3485  cytochrome C oxidase assembly protein  35.16 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.117347 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2900  cytochrome C oxidase assembly protein  37.34 
 
 		 202 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2761  cytochrome C oxidase assembly protein  37.34 
 
 		 202 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4001  cytochrome C oxidase assembly protein  32.09 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6174  cytochrome C oxidase assembly protein  37.58 
 
 		 202 aa  105  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0240  cytochrome C oxidase assembly protein  34.02 
 
 		 202 aa  104  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0144291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4389  cytochrome C oxidase assembly protein  34.72 
 
 		 208 aa  104  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2230  cytochrome C oxidase assembly protein  36.94 
 
 		 202 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0221  cytochrome C oxidase assembly protein  34.02 
 
 		 202 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.761807 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2844  cytochrome C oxidase assembly protein  36.94 
 
 		 202 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.252567  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0176  cytochrome C oxidase assembly protein  33.51 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2855  cytochrome C oxidase assembly protein  36.94 
 
 		 202 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.237501  normal  0.641869 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0675  cytochrome C oxidase assembly protein  38.36 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.155472  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0167  cytochrome C oxidase assembly protein  38.36 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3179  cytochrome C oxidase assembly protein  33.49 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000976115  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1425  cytochrome C oxidase assembly protein  38.36 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0492  cytochrome C oxidase assembly protein  38.36 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0510  cytochrome C oxidase assembly protein  38.36 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2852  cytochrome C oxidase assembly protein  38.36 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0196  cytochrome C oxidase assembly protein  32.26 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3195  cytochrome C oxidase assembly protein  38.36 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1382  cytochrome C oxidase assembly protein  35.91 
 
 		 224 aa  102  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06270  cytochrome C oxidase assembly protein  31.22 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0428  cytochrome C oxidase assembly protein  37.58 
 
 		 201 aa  101  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3519  cytochrome C oxidase assembly protein  32.16 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0880  cytochrome C oxidase assembly protein  36.96 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0316  cytochrome C oxidase assembly protein  35.23 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.677222  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2857  cytochrome C oxidase assembly protein  34.68 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.459013  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3534  cytochrome C oxidase assembly protein  34.68 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.713357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0123  cytochrome C oxidase assembly protein  32.57 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1677  cytochrome C oxidase assembly protein  33.16 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>