132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1884 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1884  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  100 
 
 
216 aa  446  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0172285  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4318  cytochrome C oxidase assembly protein  50.6 
 
 
195 aa  170  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0420878  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0471  cytochrome C oxidase assembly protein  47.28 
 
 
201 aa  168  7e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.312234  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0585  cytochrome C oxidase assembly protein  53.47 
 
 
203 aa  168  7e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0102907  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0651  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  46.24 
 
 
308 aa  166  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0477  cytochrome C oxidase assembly protein  50.6 
 
 
201 aa  167  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.372099  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0477  cytochrome C oxidase assembly protein  47.16 
 
 
191 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0617  cytochrome C oxidase assembly protein  50.31 
 
 
192 aa  164  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184092  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1828  cytochrome C oxidase assembly protein  46.59 
 
 
191 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0646  cytochrome C oxidase assembly protein  50.69 
 
 
202 aa  161  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.18748 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0606  cytochrome C oxidase assembly protein  50.69 
 
 
202 aa  161  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3879  cytochrome C oxidase assembly protein  44.83 
 
 
192 aa  158  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.217294  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0917  cytochrome C oxidase assembly protein  43.48 
 
 
209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0526885  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0726  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  47.02 
 
 
208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0871467 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0522  cytochrome C oxidase assembly protein  46.2 
 
 
198 aa  151  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.443491  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2333  cytochrome C oxidase assembly protein  46.85 
 
 
195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.866958  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0745  cytochrome C oxidase assembly protein  43.96 
 
 
202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101336  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1241  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  42.53 
 
 
201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.72167 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0259  cytochrome C oxidase assembly protein  43.96 
 
 
216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3459  cytochrome C oxidase assembly protein  43.96 
 
 
216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.788459  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0832  cytochrome C oxidase assembly protein  43.67 
 
 
216 aa  145  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal  0.277813 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2230  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  46.88 
 
 
188 aa  145  5e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0596282  hitchhiker  0.0054778 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4644  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  46.79 
 
 
203 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.106976  normal  0.107264 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16147  predicted protein  39.46 
 
 
200 aa  144  9e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.448823  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0818  cytochrome C oxidase assembly protein  46.88 
 
 
206 aa  144  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4584  cytochrome C oxidase assembly protein  41.53 
 
 
208 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1044  cytochrome C oxidase assembly protein  43.31 
 
 
205 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4502  cytochrome C oxidase assembly protein  42.77 
 
 
229 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550907  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1402  cytochrome C oxidase assembly protein  45.34 
 
 
186 aa  143  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.510495  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0903  cytochrome C oxidase assembly protein  45.68 
 
 
208 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169536  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3455  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  42.44 
 
 
202 aa  142  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.919622  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4791  cytochrome C oxidase assembly protein  43.72 
 
 
206 aa  141  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0949  cytochrome C oxidase assembly protein  43.64 
 
 
178 aa  141  8e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3583  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  41.28 
 
 
202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3259  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  41.28 
 
 
202 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0848  cytochrome C oxidase assembly protein  45.06 
 
 
174 aa  137  1e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1143  cytochrome C oxidase assembly protein  41.44 
 
 
203 aa  136  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0029  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  39.64 
 
 
203 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.310353  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0227  cytochrome C oxidase assembly protein  41.01 
 
 
213 aa  134  8e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0765  cytochrome C oxidase assembly protein  41.01 
 
 
213 aa  134  8e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35129  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1055  cytochrome C oxidase assembly protein  46.21 
 
 
175 aa  134  8e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.22643  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06297  cytochrome c oxidase assembly protein Cox11, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12260)  41.95 
 
 
250 aa  134  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_7271  cox 11/CtaG family of cytochrome oxidase assembly protein-like protein  38.46 
 
 
219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.044375  normal  0.225015 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0064  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  41.4 
 
 
198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82827  Cytochrome oxidase assembly factor COX11  39.11 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.143485  normal  0.307671 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0264  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  40 
 
 
203 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2345  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  40.48 
 
 
206 aa  126  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.608732 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04840  aerobic respiration-related protein, putative  40.13 
 
 
296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3152  cytochrome C oxidase assembly protein  38.99 
 
 
191 aa  119  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3045  cytochrome C oxidase assembly protein  37.22 
 
 
210 aa  115  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0258  cytochrome C oxidase assembly protein  40.48 
 
 
181 aa  114  8.999999999999998e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.623764  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0295  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  39.47 
 
 
180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1468  cytochrome C oxidase assembly protein  36.08 
 
 
203 aa  111  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.867504  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06270  cytochrome C oxidase assembly protein  34.32 
 
 
196 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3179  cytochrome C oxidase assembly protein  39.77 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000976115  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3485  cytochrome C oxidase assembly protein  39.73 
 
 
188 aa  107  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.117347 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001447  cytochrome oxidase biogenesis protein Cox11-CtaG copper delivery to Cox1  36.24 
 
 
179 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0152  cytochrome C oxidase assembly protein  37.16 
 
 
193 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4182  cytochrome C oxidase assembly protein  37.16 
 
 
193 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4114  cytochrome C oxidase assembly protein  37.16 
 
 
193 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4313  cytochrome C oxidase assembly protein  37.16 
 
 
193 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01000  cytochrome C oxidase assembly protein  37.97 
 
 
184 aa  106  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4608  cytochrome C oxidase assembly protein  36.49 
 
 
193 aa  105  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3793  cytochrome C oxidase assembly protein  35.14 
 
 
193 aa  105  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3866  cytochrome C oxidase assembly protein  35.14 
 
 
193 aa  105  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0038  cytochrome C oxidase assembly protein  33.73 
 
 
207 aa  104  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.379373  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01310  cytochrome C oxidase assembly protein  36.11 
 
 
184 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.782313  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1247  cytochrome C oxidase assembly protein  35.03 
 
 
202 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.403228  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3993  cytochrome C oxidase assembly protein  35.14 
 
 
193 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0176  cytochrome C oxidase assembly protein  36.24 
 
 
187 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4389  cytochrome C oxidase assembly protein  35.43 
 
 
208 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0182  cytochrome C oxidase assembly protein  35.42 
 
 
184 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3821  cytochrome C oxidase assembly protein  40.26 
 
 
214 aa  102  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.171251 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0880  cytochrome C oxidase assembly protein  37.57 
 
 
192 aa  102  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0185  cytochrome C oxidase assembly protein  34.44 
 
 
185 aa  102  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3784  cytochrome C oxidase assembly protein  36.49 
 
 
188 aa  101  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0547  cytochrome C oxidase assembly protein  36.73 
 
 
212 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0279  cytochrome C oxidase assembly protein  34.91 
 
 
203 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0328  cytochrome C oxidase assembly protein  36.36 
 
 
182 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.378424  normal  0.0110245 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3519  cytochrome C oxidase assembly protein  34.97 
 
 
187 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1677  cytochrome C oxidase assembly protein  35.32 
 
 
197 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0313  cytochrome C oxidase assembly protein  35.62 
 
 
196 aa  99  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0575051 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0196  cytochrome C oxidase assembly protein  36.54 
 
 
189 aa  99.4  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4169  cytochrome C oxidase assembly protein  35.4 
 
 
204 aa  99  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.985179 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2900  cytochrome C oxidase assembly protein  36.25 
 
 
202 aa  98.6  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2761  cytochrome C oxidase assembly protein  36.25 
 
 
202 aa  98.6  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29395  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1382  cytochrome C oxidase assembly protein  39.24 
 
 
224 aa  98.6  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167497  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0234  cytochrome C oxidase assembly protein  34.93 
 
 
189 aa  98.2  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1682  cytochrome C oxidase assembly protein  35.88 
 
 
190 aa  97.8  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.912645  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04011  cytochrome C oxidase assembly protein  34.46 
 
 
195 aa  97.4  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0263  cytochrome C oxidase assembly protein  37.25 
 
 
198 aa  96.3  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3534  cytochrome C oxidase assembly protein  34.83 
 
 
206 aa  96.3  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.713357  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2857  cytochrome C oxidase assembly protein  34.83 
 
 
206 aa  96.3  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.459013  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6174  cytochrome C oxidase assembly protein  36.73 
 
 
202 aa  95.5  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4244  cytochrome C oxidase assembly protein  35.14 
 
 
200 aa  95.1  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.770426  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0459  cytochrome C oxidase assembly protein  37.84 
 
 
203 aa  94.7  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.51439  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3195  cytochrome C oxidase assembly protein  34.12 
 
 
186 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04022  cytochrome C oxidase assembly protein  40 
 
 
198 aa  94  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2230  cytochrome C oxidase assembly protein  36.05 
 
 
202 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0256  cytochrome C oxidase assembly protein  32.48 
 
 
187 aa  94.7  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>