132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3879 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3879  cytochrome C oxidase assembly protein  100 
 
 		 192 aa  396  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.217294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0917  cytochrome C oxidase assembly protein  60.34 
 
 		 209 aa  226  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0526885  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1402  cytochrome C oxidase assembly protein  58.58 
 
 		 186 aa  205  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.510495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0585  cytochrome C oxidase assembly protein  48.6 
 
 		 203 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0102907  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4644  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  50.8 
 
 		 203 aa  180  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.106976  normal  0.107264 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2230  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  48.55 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0596282  hitchhiker  0.0054778 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4502  cytochrome C oxidase assembly protein  47.13 
 
 		 229 aa  178  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550907  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0477  cytochrome C oxidase assembly protein  47.15 
 
 		 201 aa  177  5.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.372099  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0471  cytochrome C oxidase assembly protein  47.15 
 
 		 201 aa  177  8e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.312234  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0522  cytochrome C oxidase assembly protein  49.15 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.443491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4318  cytochrome C oxidase assembly protein  46.45 
 
 		 195 aa  174  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0420878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0726  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  50.6 
 
 		 208 aa  173  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0871467 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16147  predicted protein  46.11 
 
 		 200 aa  170  9e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.448823  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0651  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  46.82 
 
 		 308 aa  169  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2345  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  47.67 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.608732 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0227  cytochrome C oxidase assembly protein  49.14 
 
 		 213 aa  168  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0765  cytochrome C oxidase assembly protein  49.14 
 
 		 213 aa  168  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0646  cytochrome C oxidase assembly protein  47.22 
 
 		 202 aa  168  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.18748 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0617  cytochrome C oxidase assembly protein  49.4 
 
 		 192 aa  167  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0832  cytochrome C oxidase assembly protein  48.07 
 
 		 216 aa  167  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal  0.277813 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0745  cytochrome C oxidase assembly protein  49.13 
 
 		 202 aa  167  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101336  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0264  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  47.16 
 
 		 203 aa  166  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0606  cytochrome C oxidase assembly protein  47.37 
 
 		 202 aa  166  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4584  cytochrome C oxidase assembly protein  48.54 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2333  cytochrome C oxidase assembly protein  50.98 
 
 		 195 aa  166  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.866958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3455  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  46.11 
 
 		 202 aa  166  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.919622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1143  cytochrome C oxidase assembly protein  47.59 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4791  cytochrome C oxidase assembly protein  48.35 
 
 		 206 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1828  cytochrome C oxidase assembly protein  44.68 
 
 		 191 aa  164  9e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0818  cytochrome C oxidase assembly protein  47.25 
 
 		 206 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0029  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  45.29 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.310353  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0477  cytochrome C oxidase assembly protein  44.68 
 
 		 191 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1241  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  47.22 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.72167 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3583  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  45 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0259  cytochrome C oxidase assembly protein  43.81 
 
 		 216 aa  159  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3459  cytochrome C oxidase assembly protein  43.81 
 
 		 216 aa  159  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.788459  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3259  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  45 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1884  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  44.83 
 
 		 216 aa  158  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0172285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3152  cytochrome C oxidase assembly protein  45.61 
 
 		 191 aa  156  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_7271  cox 11/CtaG family of cytochrome oxidase assembly protein-like protein  43.2 
 
 		 219 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.044375  normal  0.225015 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0848  cytochrome C oxidase assembly protein  45.09 
 
 		 174 aa  154  1e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1044  cytochrome C oxidase assembly protein  43.86 
 
 		 205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0903  cytochrome C oxidase assembly protein  43.98 
 
 		 208 aa  148  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169536  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0949  cytochrome C oxidase assembly protein  42.94 
 
 		 178 aa  148  5e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1055  cytochrome C oxidase assembly protein  45.28 
 
 		 175 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.22643  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06297  cytochrome c oxidase assembly protein Cox11, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12260)  38.67 
 
 		 250 aa  139  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82827  Cytochrome oxidase assembly factor COX11  37.5 
 
 		 246 aa  139  1.9999999999999998e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.143485  normal  0.307671 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04840  aerobic respiration-related protein, putative  38.75 
 
 		 296 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3045  cytochrome C oxidase assembly protein  38.82 
 
 		 210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0258  cytochrome C oxidase assembly protein  38.92 
 
 		 181 aa  124  6e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.623764  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0547  cytochrome C oxidase assembly protein  36.41 
 
 		 212 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0279  cytochrome C oxidase assembly protein  35.64 
 
 		 203 aa  115  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4169  cytochrome C oxidase assembly protein  37.5 
 
 		 204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.985179 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3008  cytochrome c oxidase assembly protein  35.88 
 
 		 182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.732509  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1040  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  38.71 
 
 		 175 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4001  cytochrome C oxidase assembly protein  36.9 
 
 		 191 aa  110  9e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0313  cytochrome C oxidase assembly protein  40 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0575051 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4389  cytochrome C oxidase assembly protein  36.81 
 
 		 208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0196  cytochrome C oxidase assembly protein  36.26 
 
 		 189 aa  109  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0234  cytochrome C oxidase assembly protein  38.36 
 
 		 189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0328  cytochrome C oxidase assembly protein  38.73 
 
 		 182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.378424  normal  0.0110245 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0256  cytochrome C oxidase assembly protein  33.16 
 
 		 187 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0882  cytochrome C oxidase assembly protein  36.25 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2761  cytochrome C oxidase assembly protein  36.99 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0185  cytochrome C oxidase assembly protein  34.13 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2230  cytochrome C oxidase assembly protein  36.42 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2900  cytochrome C oxidase assembly protein  36.99 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2844  cytochrome C oxidase assembly protein  36.42 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.252567  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0064  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  32.28 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6174  cytochrome C oxidase assembly protein  36.42 
 
 		 202 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2855  cytochrome C oxidase assembly protein  36.42 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.237501  normal  0.641869 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0459  cytochrome C oxidase assembly protein  36.99 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.51439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2715  cytochrome C oxidase assembly protein  32.48 
 
 		 172 aa  105  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.253936 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1382  cytochrome C oxidase assembly protein  35.47 
 
 		 224 aa  104  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01310  cytochrome C oxidase assembly protein  36.71 
 
 		 184 aa  104  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.782313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3179  cytochrome C oxidase assembly protein  33.33 
 
 		 210 aa  104  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000976115  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001447  cytochrome oxidase biogenesis protein Cox11-CtaG copper delivery to Cox1  34.27 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2857  cytochrome C oxidase assembly protein  33.7 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.459013  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3534  cytochrome C oxidase assembly protein  33.7 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.713357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0182  cytochrome C oxidase assembly protein  36.08 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4608  cytochrome C oxidase assembly protein  32.2 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0077  cytochrome C oxidase assembly protein  36.08 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01000  cytochrome C oxidase assembly protein  38.06 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04022  cytochrome C oxidase assembly protein  37.22 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0240  cytochrome C oxidase assembly protein  34.36 
 
 		 202 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0144291 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1677  cytochrome C oxidase assembly protein  34.1 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1468  cytochrome C oxidase assembly protein  35.29 
 
 		 203 aa  101  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.867504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4244  cytochrome C oxidase assembly protein  36.11 
 
 		 200 aa  101  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.770426  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0221  cytochrome C oxidase assembly protein  34.76 
 
 		 202 aa  101  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.761807 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0176  cytochrome C oxidase assembly protein  31.38 
 
 		 187 aa  101  9e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0263  cytochrome C oxidase assembly protein  34.59 
 
 		 198 aa  100  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3485  cytochrome C oxidase assembly protein  32.8 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.117347 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3905  cytochrome C oxidase assembly protein  31.72 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4182  cytochrome C oxidase assembly protein  29.83 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3519  cytochrome C oxidase assembly protein  35.16 
 
 		 187 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0152  cytochrome C oxidase assembly protein  29.83 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0123  cytochrome C oxidase assembly protein  32.97 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1938  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  33.52 
 
 		 193 aa  99.8  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.233238  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06270  cytochrome C oxidase assembly protein  33.7 
 
 		 196 aa  99.8  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4313  cytochrome C oxidase assembly protein  29.83 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>