132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0917 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0917  cytochrome C oxidase assembly protein  100 
 
 
209 aa  432  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0526885  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3879  cytochrome C oxidase assembly protein  60.34 
 
 
192 aa  227  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.217294  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1402  cytochrome C oxidase assembly protein  58.01 
 
 
186 aa  213  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.510495  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0471  cytochrome C oxidase assembly protein  51.18 
 
 
201 aa  194  9e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.312234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0477  cytochrome C oxidase assembly protein  51.18 
 
 
201 aa  194  9e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.372099  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0585  cytochrome C oxidase assembly protein  50 
 
 
203 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0102907  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0522  cytochrome C oxidase assembly protein  48.66 
 
 
198 aa  181  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.443491  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2230  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  50.29 
 
 
188 aa  179  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0596282  hitchhiker  0.0054778 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0745  cytochrome C oxidase assembly protein  51.04 
 
 
202 aa  177  9e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101336  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0477  cytochrome C oxidase assembly protein  50.3 
 
 
191 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4318  cytochrome C oxidase assembly protein  46.63 
 
 
195 aa  175  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0420878  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1828  cytochrome C oxidase assembly protein  50.3 
 
 
191 aa  174  6e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2333  cytochrome C oxidase assembly protein  53.21 
 
 
195 aa  174  7e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.866958  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0646  cytochrome C oxidase assembly protein  48.24 
 
 
202 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.18748 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0606  cytochrome C oxidase assembly protein  48.24 
 
 
202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4644  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  49.18 
 
 
203 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.106976  normal  0.107264 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0848  cytochrome C oxidase assembly protein  46.51 
 
 
174 aa  171  5.999999999999999e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0617  cytochrome C oxidase assembly protein  51.52 
 
 
192 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184092  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0726  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  45.7 
 
 
208 aa  170  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0871467 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1055  cytochrome C oxidase assembly protein  49.03 
 
 
175 aa  170  2e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.22643  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1143  cytochrome C oxidase assembly protein  42.56 
 
 
203 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4502  cytochrome C oxidase assembly protein  41.33 
 
 
229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550907  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_7271  cox 11/CtaG family of cytochrome oxidase assembly protein-like protein  46.71 
 
 
219 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.044375  normal  0.225015 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0029  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  43.01 
 
 
203 aa  164  8e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.310353  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1044  cytochrome C oxidase assembly protein  48.07 
 
 
205 aa  164  9e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0949  cytochrome C oxidase assembly protein  46.15 
 
 
178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0651  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  48.7 
 
 
308 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1241  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  43.59 
 
 
201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.72167 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16147  predicted protein  43.41 
 
 
200 aa  161  8.000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.448823  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3152  cytochrome C oxidase assembly protein  45.51 
 
 
191 aa  157  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1884  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  42.37 
 
 
216 aa  155  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0172285  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0227  cytochrome C oxidase assembly protein  47.09 
 
 
213 aa  154  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0765  cytochrome C oxidase assembly protein  47.09 
 
 
213 aa  154  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35129  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4791  cytochrome C oxidase assembly protein  48.05 
 
 
206 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0832  cytochrome C oxidase assembly protein  42.08 
 
 
216 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal  0.277813 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0818  cytochrome C oxidase assembly protein  40.91 
 
 
206 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0259  cytochrome C oxidase assembly protein  45.98 
 
 
216 aa  149  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3459  cytochrome C oxidase assembly protein  45.98 
 
 
216 aa  149  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.788459  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82827  Cytochrome oxidase assembly factor COX11  38.83 
 
 
246 aa  150  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.143485  normal  0.307671 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2345  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  40.21 
 
 
206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.608732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0264  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  41.85 
 
 
203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4584  cytochrome C oxidase assembly protein  40.29 
 
 
208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3455  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  39.56 
 
 
202 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.919622  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06297  cytochrome c oxidase assembly protein Cox11, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12260)  41.98 
 
 
250 aa  141  8e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04840  aerobic respiration-related protein, putative  38.12 
 
 
296 aa  140  9.999999999999999e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0903  cytochrome C oxidase assembly protein  44.16 
 
 
208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169536  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3583  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  38.46 
 
 
202 aa  139  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3259  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  38.46 
 
 
202 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06270  cytochrome C oxidase assembly protein  38.51 
 
 
196 aa  136  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001447  cytochrome oxidase biogenesis protein Cox11-CtaG copper delivery to Cox1  38.2 
 
 
179 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0258  cytochrome C oxidase assembly protein  40.12 
 
 
181 aa  135  5e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.623764  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0547  cytochrome C oxidase assembly protein  42.63 
 
 
212 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4169  cytochrome C oxidase assembly protein  43.24 
 
 
204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.985179 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0256  cytochrome C oxidase assembly protein  38.24 
 
 
187 aa  128  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0279  cytochrome C oxidase assembly protein  44.72 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3045  cytochrome C oxidase assembly protein  39.46 
 
 
210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2230  cytochrome C oxidase assembly protein  41.11 
 
 
202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2844  cytochrome C oxidase assembly protein  41.11 
 
 
202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.252567  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4001  cytochrome C oxidase assembly protein  38.25 
 
 
191 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4608  cytochrome C oxidase assembly protein  36.42 
 
 
193 aa  126  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2855  cytochrome C oxidase assembly protein  41.11 
 
 
202 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.237501  normal  0.641869 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6174  cytochrome C oxidase assembly protein  40.56 
 
 
202 aa  125  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3793  cytochrome C oxidase assembly protein  35.26 
 
 
193 aa  125  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3866  cytochrome C oxidase assembly protein  35.26 
 
 
193 aa  125  6e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3993  cytochrome C oxidase assembly protein  35.26 
 
 
193 aa  123  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4114  cytochrome C oxidase assembly protein  33.92 
 
 
193 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2900  cytochrome C oxidase assembly protein  40.33 
 
 
202 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0152  cytochrome C oxidase assembly protein  33.92 
 
 
193 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4313  cytochrome C oxidase assembly protein  33.92 
 
 
193 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0234  cytochrome C oxidase assembly protein  41.14 
 
 
189 aa  120  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2761  cytochrome C oxidase assembly protein  39.78 
 
 
202 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29395  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0459  cytochrome C oxidase assembly protein  40.12 
 
 
203 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.51439  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0176  cytochrome C oxidase assembly protein  35.88 
 
 
187 aa  119  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4182  cytochrome C oxidase assembly protein  33.33 
 
 
193 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0313  cytochrome C oxidase assembly protein  40.62 
 
 
196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0575051 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1468  cytochrome C oxidase assembly protein  34.9 
 
 
203 aa  118  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.867504  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0123  cytochrome C oxidase assembly protein  37.5 
 
 
189 aa  118  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0196  cytochrome C oxidase assembly protein  36.9 
 
 
189 aa  118  7e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0064  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  35.47 
 
 
198 aa  117  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4389  cytochrome C oxidase assembly protein  36.82 
 
 
208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0428  cytochrome C oxidase assembly protein  40.12 
 
 
201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3179  cytochrome C oxidase assembly protein  36.84 
 
 
210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000976115  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3485  cytochrome C oxidase assembly protein  36.63 
 
 
188 aa  115  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.117347 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3008  cytochrome c oxidase assembly protein  35.71 
 
 
182 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.732509  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3195  cytochrome C oxidase assembly protein  39.41 
 
 
186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0675  cytochrome C oxidase assembly protein  39.41 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.155472  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0167  cytochrome C oxidase assembly protein  39.41 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1425  cytochrome C oxidase assembly protein  39.41 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0492  cytochrome C oxidase assembly protein  39.41 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0510  cytochrome C oxidase assembly protein  39.41 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2852  cytochrome C oxidase assembly protein  39.41 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1247  cytochrome C oxidase assembly protein  37.06 
 
 
202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.403228  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04022  cytochrome C oxidase assembly protein  38.51 
 
 
198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1682  cytochrome C oxidase assembly protein  37.93 
 
 
190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.912645  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3519  cytochrome C oxidase assembly protein  35.29 
 
 
187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3784  cytochrome C oxidase assembly protein  34.71 
 
 
188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0240  cytochrome C oxidase assembly protein  35.68 
 
 
202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0144291 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0221  cytochrome C oxidase assembly protein  35.68 
 
 
202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.761807 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0185  cytochrome C oxidase assembly protein  37.13 
 
 
185 aa  111  6e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0263  cytochrome C oxidase assembly protein  36.92 
 
 
198 aa  111  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>