More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3932 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3932  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
422 aa  860    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4588  NADH dehydrogenase (quinone)  69.02 
 
 
414 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.31058  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4300  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I, chain F  68.14 
 
 
414 aa  531  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0070015 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1017  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  42.86 
 
 
425 aa  297  2e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  39.3 
 
 
614 aa  296  3e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1355  NADH dehydrogenase I, F subunit  41.61 
 
 
427 aa  293  3e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1686  NADH dehydrogenase (quinone)  38.44 
 
 
545 aa  292  7e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0272  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  43.04 
 
 
434 aa  292  1e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2708  NADH dehydrogenase I, F subunit  41.29 
 
 
488 aa  290  3e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5058  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  42.78 
 
 
439 aa  288  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2864  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.75 
 
 
454 aa  288  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  hitchhiker  0.00675695 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40 
 
 
421 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2828  NADH dehydrogenase I subunit F  42.64 
 
 
445 aa  286  2.9999999999999996e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.208712  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2577  NADH dehydrogenase I subunit F  41.9 
 
 
445 aa  285  8e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85076  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2660  NADH dehydrogenase I subunit F  41.9 
 
 
445 aa  285  8e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.142172  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1368  NADH dehydrogenase I subunit F  41.9 
 
 
445 aa  285  8e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.104051  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3423  NADH dehydrogenase I subunit F  41.9 
 
 
445 aa  285  8e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2433  NADH dehydrogenase I subunit F  41.9 
 
 
445 aa  285  8e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2508  NADH dehydrogenase I subunit F  41.9 
 
 
445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2552  NADH dehydrogenase I subunit F  41.9 
 
 
445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2563  NADH dehydrogenase I subunit F  41.9 
 
 
445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2463  NADH dehydrogenase I subunit F  41.9 
 
 
445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.560534  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2670  NADH dehydrogenase I subunit F  41.9 
 
 
445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.793863 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02209  NADH:ubiquinone oxidoreductase, chain F  41.65 
 
 
445 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1373  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  41.65 
 
 
445 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00215992  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2438  NADH dehydrogenase I subunit F  41.65 
 
 
445 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02169  hypothetical protein  41.65 
 
 
445 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1634  NADP-reducing hydrogenase chain C  36.95 
 
 
486 aa  283  5.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000096005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1844  NADP-reducing hydrogenase chain C  36.95 
 
 
486 aa  283  5.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1604  NADP-reducing hydrogenase chain C  36.7 
 
 
486 aa  281  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3304  NADH dehydrogenase I subunit F  41.69 
 
 
450 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0360562  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  39.05 
 
 
607 aa  280  3e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  39.05 
 
 
607 aa  280  3e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6089  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  41.6 
 
 
447 aa  280  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0248618 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2690  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.56 
 
 
438 aa  278  9e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1564  NADH dehydrogenase I subunit F  40.94 
 
 
461 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1812  NADH dehydrogenase I subunit F  40.94 
 
 
461 aa  278  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.848425 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1458  NADH dehydrogenase I subunit F  40.94 
 
 
461 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4413  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.56 
 
 
433 aa  278  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  36.59 
 
 
614 aa  277  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0332  NADH dehydrogenase (quinone)  38.36 
 
 
629 aa  277  3e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4067  NADH dehydrogenase (quinone)  41.41 
 
 
428 aa  275  8e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0902793  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  39.58 
 
 
597 aa  275  8e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  37.19 
 
 
602 aa  275  8e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2768  NADH dehydrogenase I subunit F  41.27 
 
 
449 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.261993  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4553  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.15 
 
 
442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1701  NADH dehydrogenase (quinone)  38.97 
 
 
604 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4654  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  38.61 
 
 
535 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0429  NADH dehydrogenase (quinone)  38.87 
 
 
624 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07430  NADH dehydrogenase subunit F  40.78 
 
 
449 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0432719 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1496  NADH dehydrogenase I subunit F  40.45 
 
 
449 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.376582  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0714  NADH dehydrogenase (quinone)  43.18 
 
 
428 aa  274  2.0000000000000002e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1044  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.26 
 
 
434 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1248  NADH dehydrogenase (quinone)  36.17 
 
 
604 aa  273  4.0000000000000004e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.600832  normal  0.0289049 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1123  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.75 
 
 
429 aa  273  5.000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0713  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.57 
 
 
426 aa  273  5.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03210  NADH dehydrogenase subunit F  39.13 
 
 
424 aa  273  6e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1887  NADH dehydrogenase (quinone)  40.1 
 
 
592 aa  273  6e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2560  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  42.63 
 
 
427 aa  272  1e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.652928  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  36.21 
 
 
597 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  39.44 
 
 
545 aa  272  1e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4458  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.38 
 
 
443 aa  271  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  40.43 
 
 
428 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232944  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3821  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.78 
 
 
426 aa  271  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.400637  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.74 
 
 
427 aa  271  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0720  NADH dehydrogenase (quinone)  38.26 
 
 
545 aa  271  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00999729  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.74 
 
 
427 aa  271  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  39.66 
 
 
572 aa  271  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3542  NADH dehydrogenase (quinone)  38.82 
 
 
537 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  39.52 
 
 
597 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0109  NADH dehydrogenase (quinone)  38.5 
 
 
656 aa  270  4e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3441  NADH dehydrogenase I, F subunit  41.13 
 
 
423 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0559  NADH dehydrogenase (quinone)  38.01 
 
 
624 aa  269  7e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.382532  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  35.71 
 
 
562 aa  269  7e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2238  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  37.89 
 
 
449 aa  269  8e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0286  NADH-quinone oxidoreductase subunit F  40.7 
 
 
428 aa  268  8.999999999999999e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0146  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  38.75 
 
 
417 aa  268  1e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.28536  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0208  NADH dehydrogenase I chain F  40.51 
 
 
425 aa  268  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0544  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.52 
 
 
448 aa  268  1e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.789941 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3391  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  37.98 
 
 
451 aa  268  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1545  NADH dehydrogenase (quinone)  37.53 
 
 
668 aa  267  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1279  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  39.54 
 
 
438 aa  268  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4199  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.69 
 
 
441 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  37.35 
 
 
594 aa  268  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0914  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40 
 
 
446 aa  267  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4354  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.69 
 
 
441 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168378  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4331  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.69 
 
 
441 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0397  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.82 
 
 
706 aa  266  4e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01800  NADH dehydrogenase I subunit F  38.69 
 
 
624 aa  266  5e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.235185  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_154  [Fe] hydrogenase, HymB subunit  38.25 
 
 
417 aa  266  5e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7686  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.6 
 
 
441 aa  266  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0724  NADH dehydrogenase (quinone)  36.25 
 
 
485 aa  266  5e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13171  NADH dehydrogenase I chain F nuoF (NADH-ubiquinone oxidoreductase chain F)  41.73 
 
 
445 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6677  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.29 
 
 
431 aa  266  5.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0991  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.28 
 
 
425 aa  266  5.999999999999999e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.315379  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4060  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.42 
 
 
443 aa  265  8e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.306589 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0225  NADH dehydrogenase (quinone)  38 
 
 
417 aa  266  8e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0822  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.05 
 
 
426 aa  265  8.999999999999999e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.76792  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0543  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.49 
 
 
443 aa  265  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.315884  normal  0.338133 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1365  NADH dehydrogenase (quinone)  37.71 
 
 
532 aa  265  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529964  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>