More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0714 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0714  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
428 aa  857    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1123  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  64.93 
 
 
429 aa  581  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1017  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  63.74 
 
 
425 aa  546  1e-154  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3821  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  59.39 
 
 
426 aa  531  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.400637  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1116  NADH dehydrogenase (quinone)  60.23 
 
 
434 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1355  NADH dehydrogenase I, F subunit  62.11 
 
 
427 aa  513  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2864  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  57.78 
 
 
454 aa  508  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  hitchhiker  0.00675695 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02209  NADH:ubiquinone oxidoreductase, chain F  54.94 
 
 
445 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1373  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.94 
 
 
445 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00215992  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2433  NADH dehydrogenase I subunit F  54.94 
 
 
445 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2828  NADH dehydrogenase I subunit F  54.7 
 
 
445 aa  465  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.208712  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2552  NADH dehydrogenase I subunit F  54.94 
 
 
445 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2577  NADH dehydrogenase I subunit F  54.94 
 
 
445 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85076  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3423  NADH dehydrogenase I subunit F  54.94 
 
 
445 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2670  NADH dehydrogenase I subunit F  54.94 
 
 
445 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.793863 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1368  NADH dehydrogenase I subunit F  54.94 
 
 
445 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.104051  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2463  NADH dehydrogenase I subunit F  54.94 
 
 
445 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.560534  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2438  NADH dehydrogenase I subunit F  54.94 
 
 
445 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2563  NADH dehydrogenase I subunit F  54.94 
 
 
445 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2660  NADH dehydrogenase I subunit F  54.94 
 
 
445 aa  468  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.142172  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02169  hypothetical protein  54.94 
 
 
445 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2508  NADH dehydrogenase I subunit F  54.94 
 
 
445 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3304  NADH dehydrogenase I subunit F  53.99 
 
 
450 aa  462  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0360562  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1496  NADH dehydrogenase I subunit F  55.05 
 
 
449 aa  460  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.376582  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3128  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  59.32 
 
 
446 aa  459  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2768  NADH dehydrogenase I subunit F  55.31 
 
 
449 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.261993  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1458  NADH dehydrogenase I subunit F  54.35 
 
 
461 aa  450  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1017  NADH dehydrogenase I subunit F  53.96 
 
 
461 aa  449  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1812  NADH dehydrogenase I subunit F  54.35 
 
 
461 aa  450  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.848425 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1564  NADH dehydrogenase I subunit F  54.35 
 
 
461 aa  450  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1742  NADH dehydrogenase I subunit F  54.11 
 
 
453 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00767478  normal  0.368262 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4123  NADH dehydrogenase I subunit F  54.11 
 
 
453 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3695  NADH dehydrogenase I subunit F  54.11 
 
 
454 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196409  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28480  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  55.64 
 
 
449 aa  447  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1869  NADH dehydrogenase I subunit F  53.62 
 
 
458 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.123144 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2546  NADH dehydrogenase I subunit F  55.64 
 
 
449 aa  443  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.698943  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2566  NADH dehydrogenase I subunit F  54.83 
 
 
448 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0377  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.35 
 
 
444 aa  443  1e-123  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.372414  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3607  NADH dehydrogenase I subunit F  54.91 
 
 
451 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1398  NADH dehydrogenase I subunit F  54.92 
 
 
449 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.940574  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1695  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.32 
 
 
537 aa  435  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.316564  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3369  NADH dehydrogenase I, F subunit  54.66 
 
 
452 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3201  NADH dehydrogenase I subunit F  54.41 
 
 
452 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103684  normal  0.0135586 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4067  NADH dehydrogenase (quinone)  54.19 
 
 
428 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0902793  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2416  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.11 
 
 
448 aa  434  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0718255  normal  0.148536 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0588  NADH dehydrogenase I, F subunit  53.83 
 
 
474 aa  428  1e-118  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0577  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.58 
 
 
474 aa  426  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0329  NADH dehydrogenase (quinone)  53.71 
 
 
433 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0158  NADH dehydrogenase (quinone)  54.21 
 
 
421 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.589974 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3441  NADH dehydrogenase I, F subunit  53.2 
 
 
423 aa  413  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0157  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  53.69 
 
 
422 aa  412  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0176  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  53.71 
 
 
421 aa  414  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0208  NADH dehydrogenase I chain F  53.69 
 
 
425 aa  410  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4739  NADH dehydrogenase (quinone)  53.4 
 
 
428 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.18 
 
 
421 aa  400  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1330  NADH dehydrogenase (quinone)  54.46 
 
 
428 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.220778  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1693  NADH dehydrogenase (quinone)  51.9 
 
 
416 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0681624  normal  0.883791 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1351  NADH dehydrogenase (quinone)  53.29 
 
 
428 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.169855 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.31 
 
 
427 aa  389  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.31 
 
 
427 aa  389  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0104  respiratory-chain NADH dehydrogenase, 51 kDa subunit  51.19 
 
 
416 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29970  NADH dehydrogenase I subunit F  50.47 
 
 
449 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1740  NADH dehydrogenase (quinone)  51.19 
 
 
416 aa  388  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4413  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.9 
 
 
433 aa  382  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1147  NADH-quinone oxidoreductase, chain F  48.54 
 
 
426 aa  376  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.450213  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1044  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.22 
 
 
434 aa  378  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1760  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.48 
 
 
426 aa  377  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0272  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.89 
 
 
434 aa  377  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1686  NADH dehydrogenase (quinone)  44.12 
 
 
545 aa  373  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0914  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.26 
 
 
446 aa  373  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13171  NADH dehydrogenase I chain F nuoF (NADH-ubiquinone oxidoreductase chain F)  47.9 
 
 
445 aa  366  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1872  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  46.71 
 
 
438 aa  365  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.901047  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0397  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.51 
 
 
706 aa  368  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1278  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.78 
 
 
444 aa  367  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.327335  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1096  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.79 
 
 
425 aa  364  1e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.763284  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0713  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.52 
 
 
426 aa  365  1e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1959  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.34 
 
 
429 aa  363  2e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00121653  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0543  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.24 
 
 
443 aa  364  2e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.315884  normal  0.338133 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6089  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.24 
 
 
447 aa  364  2e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0248618 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0633  NADH dehydrogenase (quinone)  46.56 
 
 
427 aa  364  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1628  NADH dehydrogenase (quinone)  46.56 
 
 
427 aa  364  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3188  NADH dehydrogenase (quinone)  46.56 
 
 
427 aa  364  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2690  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.48 
 
 
438 aa  363  4e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1886  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.02 
 
 
431 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415851  normal  0.35892 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2209  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.02 
 
 
431 aa  362  6e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0954  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.28 
 
 
442 aa  362  7.0000000000000005e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2560  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.19 
 
 
427 aa  361  1e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.652928  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  46.29 
 
 
428 aa  360  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232944  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0474  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.65 
 
 
448 aa  360  3e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4199  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.99 
 
 
441 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4331  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.99 
 
 
441 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4354  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.99 
 
 
441 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168378  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3391  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.67 
 
 
451 aa  359  5e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5058  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.44 
 
 
439 aa  359  6e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2057  NADH dehydrogenase I chain F  47.28 
 
 
431 aa  358  8e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728933  normal  0.0269366 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4553  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.12 
 
 
442 aa  358  9e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  44.02 
 
 
636 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  43.58 
 
 
602 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1498  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.08 
 
 
458 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275368  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0991  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.76 
 
 
425 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.315379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>