More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3441 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0329  NADH dehydrogenase (quinone)  83.05 
 
 		 433 aa  720    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3441  NADH dehydrogenase I, F subunit  100 
 
 		 423 aa  861    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0157  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  93.13 
 
 		 422 aa  817    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0158  NADH dehydrogenase (quinone)  74.22 
 
 		 421 aa  661    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.589974 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0176  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  72.79 
 
 		 421 aa  654    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0208  NADH dehydrogenase I chain F  59.19 
 
 		 425 aa  500  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1123  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.3 
 
 		 429 aa  462  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1017  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.9 
 
 		 425 aa  463  1e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3821  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.32 
 
 		 426 aa  461  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.400637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1955  NADH dehydrogenase (quinone)  58.75 
 
 		 421 aa  454  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0948172  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1355  NADH dehydrogenase I, F subunit  53.48 
 
 		 427 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1458  NADH dehydrogenase I subunit F  53.11 
 
 		 461 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1564  NADH dehydrogenase I subunit F  53.11 
 
 		 461 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1812  NADH dehydrogenase I subunit F  53.11 
 
 		 461 aa  437  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.848425 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1496  NADH dehydrogenase I subunit F  54.48 
 
 		 449 aa  434  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.376582  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2864  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.64 
 
 		 454 aa  432  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  hitchhiker  0.00675695 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2768  NADH dehydrogenase I subunit F  54.23 
 
 		 449 aa  431  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.261993  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2552  NADH dehydrogenase I subunit F  52.87 
 
 		 445 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02209  NADH:ubiquinone oxidoreductase, chain F  53.12 
 
 		 445 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1373  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.12 
 
 		 445 aa  427  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00215992  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3304  NADH dehydrogenase I subunit F  52.16 
 
 		 450 aa  427  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0360562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2438  NADH dehydrogenase I subunit F  53.12 
 
 		 445 aa  427  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2670  NADH dehydrogenase I subunit F  52.87 
 
 		 445 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.793863 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1368  NADH dehydrogenase I subunit F  53.12 
 
 		 445 aa  428  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.104051  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2563  NADH dehydrogenase I subunit F  52.87 
 
 		 445 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2828  NADH dehydrogenase I subunit F  52.18 
 
 		 445 aa  427  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.208712  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3423  NADH dehydrogenase I subunit F  53.12 
 
 		 445 aa  428  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2660  NADH dehydrogenase I subunit F  53.12 
 
 		 445 aa  428  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.142172  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2508  NADH dehydrogenase I subunit F  52.87 
 
 		 445 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2433  NADH dehydrogenase I subunit F  53.12 
 
 		 445 aa  428  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2463  NADH dehydrogenase I subunit F  52.87 
 
 		 445 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.560534  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2577  NADH dehydrogenase I subunit F  53.12 
 
 		 445 aa  428  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02169  hypothetical protein  53.12 
 
 		 445 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1116  NADH dehydrogenase (quinone)  51.18 
 
 		 434 aa  423  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1398  NADH dehydrogenase I subunit F  53.73 
 
 		 449 aa  413  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.940574  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4123  NADH dehydrogenase I subunit F  52.32 
 
 		 453 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1017  NADH dehydrogenase I subunit F  50.61 
 
 		 461 aa  410  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1742  NADH dehydrogenase I subunit F  52.32 
 
 		 453 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00767478  normal  0.368262 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4413  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.76 
 
 		 433 aa  409  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3695  NADH dehydrogenase I subunit F  52.32 
 
 		 454 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1869  NADH dehydrogenase I subunit F  52.32 
 
 		 458 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.123144 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2566  NADH dehydrogenase I subunit F  51.09 
 
 		 448 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2546  NADH dehydrogenase I subunit F  54.73 
 
 		 449 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.698943  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5058  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.21 
 
 		 439 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0588  NADH dehydrogenase I, F subunit  50.86 
 
 		 474 aa  403  1e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0577  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.24 
 
 		 474 aa  402  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1695  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.6 
 
 		 537 aa  403  1e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.316564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2416  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.1 
 
 		 448 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0718255  normal  0.148536 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.58 
 
 		 421 aa  400  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  49.87 
 
 		 428 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4067  NADH dehydrogenase (quinone)  50.7 
 
 		 428 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0902793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28480  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.37 
 
 		 449 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3369  NADH dehydrogenase I, F subunit  49.88 
 
 		 452 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3201  NADH dehydrogenase I subunit F  50.12 
 
 		 452 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103684  normal  0.0135586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3607  NADH dehydrogenase I subunit F  50.12 
 
 		 451 aa  395  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0474  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.25 
 
 		 448 aa  393  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0286  NADH-quinone oxidoreductase subunit F  48.33 
 
 		 428 aa  388  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2690  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.25 
 
 		 438 aa  390  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7686  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.15 
 
 		 441 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0377  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.5 
 
 		 444 aa  389  1e-107  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.372414  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0714  NADH dehydrogenase (quinone)  53.2 
 
 		 428 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4199  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.43 
 
 		 441 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4354  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.43 
 
 		 441 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168378  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4331  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.43 
 
 		 441 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0272  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.26 
 
 		 434 aa  384  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07430  NADH dehydrogenase subunit F  50 
 
 		 449 aa  381  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0432719 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2711  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.9 
 
 		 444 aa  381  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0544  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.25 
 
 		 448 aa  380  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.789941 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1044  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.45 
 
 		 434 aa  379  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.07 
 
 		 441 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.548898  normal  0.181766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6089  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.54 
 
 		 447 aa  377  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0248618 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1241  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.04 
 
 		 456 aa  375  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0525  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.55 
 
 		 440 aa  378  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.42 
 
 		 427 aa  373  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13171  NADH dehydrogenase I chain F nuoF (NADH-ubiquinone oxidoreductase chain F)  46.37 
 
 		 445 aa  372  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.42 
 
 		 427 aa  373  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0397  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.19 
 
 		 706 aa  369  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0713  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.61 
 
 		 426 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0822  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.97 
 
 		 426 aa  366  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.76792  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0543  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.55 
 
 		 443 aa  367  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.315884  normal  0.338133 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3128  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47 
 
 		 446 aa  367  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  44.39 
 
 		 602 aa  366  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2238  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.62 
 
 		 449 aa  368  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1965  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.67 
 
 		 425 aa  363  4e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.789602  normal  0.0852998 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1613  NADH dehydrogenase (ubiquinone), F subunit  45.43 
 
 		 422 aa  362  8e-99  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0550  NADH-quinone oxidoreductase chain F  45.43 
 
 		 422 aa  361  1e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.842517  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03210  NADH dehydrogenase subunit F  46.23 
 
 		 424 aa  360  2e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4553  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.88 
 
 		 442 aa  360  2e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3391  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.65 
 
 		 451 aa  360  2e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1377  NADH dehydrogenase I chain F  46.01 
 
 		 448 aa  360  3e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0721979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  44.58 
 
 		 597 aa  360  4e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1575  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.93 
 
 		 438 aa  359  5e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1599  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.93 
 
 		 438 aa  359  5e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  44.17 
 
 		 545 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3862  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.08 
 
 		 443 aa  357  1.9999999999999998e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1154  NADH dehydrogenase (quinone)  45.37 
 
 		 436 aa  357  1.9999999999999998e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0633  NADH dehydrogenase (quinone)  45.56 
 
 		 427 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1628  NADH dehydrogenase (quinone)  45.56 
 
 		 427 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3188  NADH dehydrogenase (quinone)  45.56 
 
 		 427 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1545  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.46 
 
 		 438 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.349481  normal  0.139293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>