118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0781 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0781  30S ribosomal protein S6  100 
 
 
257 aa  521  1e-147  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0213362  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0695  30S ribosomal protein S6  43 
 
 
109 aa  82.8  0.000000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.308714  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0308  30S ribosomal protein S6  42 
 
 
109 aa  82  0.000000000000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.389439  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0741  30S ribosomal protein S6  34.55 
 
 
145 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  0.125363 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0414  30S ribosomal protein S6  40 
 
 
160 aa  62.8  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3487  30S ribosomal protein S6  38.57 
 
 
158 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289777  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1520  30S ribosomal protein S6  38.96 
 
 
153 aa  61.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162884  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2464  30S ribosomal protein S6  34.29 
 
 
159 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2296  30S ribosomal protein S6  34.29 
 
 
168 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.220775  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1197  30S ribosomal protein S6  37.18 
 
 
155 aa  59.3  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.358566  normal  0.0253087 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3815  30S ribosomal protein S6  34.29 
 
 
153 aa  59.3  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.247483  normal  0.0901852 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1054  30S ribosomal protein S6  37.18 
 
 
155 aa  59.3  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1212  30S ribosomal protein S6  31.82 
 
 
117 aa  58.9  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.709191 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2985  30S ribosomal protein S6  34.29 
 
 
160 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.620365 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  29.36 
 
 
136 aa  57  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1691  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 
139 aa  56.6  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2512  30S ribosomal protein S6  30.3 
 
 
126 aa  55.8  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281012  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3038  30S ribosomal protein S6  30.38 
 
 
161 aa  55.8  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1512  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 
158 aa  55.5  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.589185  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1416  30S ribosomal protein S6  35.71 
 
 
120 aa  55.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1900  30S ribosomal protein S6  36.23 
 
 
122 aa  54.7  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1352  30S ribosomal protein S6  31 
 
 
132 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0105388  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  30 
 
 
156 aa  54.7  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2303  30S ribosomal protein S6  31.53 
 
 
151 aa  55.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  30 
 
 
148 aa  54.7  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0139  30S ribosomal protein S6  31.63 
 
 
132 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2355  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 
147 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22878  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1772  30S ribosomal protein S6  31.63 
 
 
135 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468472  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0569  30S ribosomal protein S6  30.56 
 
 
151 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0898  30S ribosomal protein S6  33.82 
 
 
146 aa  53.5  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0179425 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3118  30S ribosomal protein S6  32.47 
 
 
152 aa  52.8  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158791  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1818  30S ribosomal protein S6  33.66 
 
 
124 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195181  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2186  30S ribosomal protein S6  35.71 
 
 
117 aa  51.6  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4417  30S ribosomal protein S6  33.77 
 
 
151 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.316855 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1045  30S ribosomal protein S6  31.18 
 
 
117 aa  50.1  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.146697 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3942  30S ribosomal protein S6  32.47 
 
 
151 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.262713 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4310  30S ribosomal protein S6  32.47 
 
 
151 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4637  30S ribosomal protein S6  30.77 
 
 
134 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3216  30S ribosomal protein S6  33.66 
 
 
125 aa  49.3  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2569  30S ribosomal protein S6  33.66 
 
 
125 aa  49.3  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2590  30S ribosomal protein S6  30.77 
 
 
134 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  30.68 
 
 
95 aa  48.9  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2830  30S ribosomal protein S6  31.68 
 
 
121 aa  48.9  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1622  30S ribosomal protein S6  32.86 
 
 
117 aa  48.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541746  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0891  30S ribosomal protein S6  30.11 
 
 
131 aa  48.5  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0981  ribosomal protein S6  32.32 
 
 
141 aa  48.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  30.56 
 
 
155 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  33.9 
 
 
96 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  31.73 
 
 
124 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1228  30S ribosomal protein S6  32.67 
 
 
125 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  35.71 
 
 
96 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5229  30S ribosomal protein S6  32.67 
 
 
120 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  31.73 
 
 
124 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  33.9 
 
 
96 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  33.93 
 
 
96 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  33.93 
 
 
96 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl080  30S ribosomal protein S6  34.33 
 
 
290 aa  47  0.0003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  1.25992e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  33.93 
 
 
96 aa  47  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2105  30S ribosomal protein S6  30.53 
 
 
127 aa  47  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1999  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 
115 aa  47.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0575699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  33.93 
 
 
96 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  33.93 
 
 
96 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  33.93 
 
 
96 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 
124 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 
124 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5174  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 
124 aa  46.6  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 
124 aa  46.6  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  27.37 
 
 
131 aa  46.6  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 
124 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 
124 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 
124 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 
124 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 
124 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 
124 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  32.2 
 
 
96 aa  46.6  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1811  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 
124 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844657  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 
124 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1783  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 
124 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 
124 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6205  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 
124 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1874  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 
124 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1951  30S ribosomal protein S6  29.59 
 
 
125 aa  45.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.380092  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0024  30S ribosomal protein S6  36.36 
 
 
137 aa  44.7  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2193  30S ribosomal protein S6  31.68 
 
 
121 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0141741  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1916  30S ribosomal protein S6  28 
 
 
148 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5068  ribosomal protein S6  38.89 
 
 
95 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330379  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5421  30S ribosomal protein S6  30.67 
 
 
154 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0549173  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4877  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 
141 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4933  ribosomal protein S6  29.35 
 
 
141 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0581  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 
141 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0645  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 
140 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.793975  hitchhiker  0.000526957 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4758  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 
141 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0734543 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4934  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 
141 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000104766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4668  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 
141 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0417729 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0534  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 
142 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.587814  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2766  30S ribosomal protein S6  30.69 
 
 
126 aa  43.9  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.431916  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2844  30S ribosomal protein S6  32.2 
 
 
118 aa  43.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000534713  hitchhiker  0.0000000000000955305 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  29.87 
 
 
142 aa  43.1  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  35.71 
 
 
96 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07640  30S ribosomal protein S6  28.26 
 
 
136 aa  43.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>