More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0134 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0134  50S ribosomal protein L21  100 
 
 
100 aa  195  2.0000000000000003e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  55.1 
 
 
100 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0545  50S ribosomal protein L21  60.61 
 
 
102 aa  100  6e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  50.5 
 
 
103 aa  100  8e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 
102 aa  99.4  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  47.62 
 
 
105 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  47.62 
 
 
105 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 
104 aa  99  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 
104 aa  98.6  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0488  50S ribosomal protein L21  62.11 
 
 
102 aa  97.4  6e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  48.04 
 
 
103 aa  96.3  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  49.5 
 
 
149 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  46.53 
 
 
198 aa  95.9  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  51 
 
 
102 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  50.52 
 
 
188 aa  95.1  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 
103 aa  95.1  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  48.51 
 
 
223 aa  94.7  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  50.52 
 
 
142 aa  94.4  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  46.94 
 
 
221 aa  94.4  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0231  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 
104 aa  94  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  47.57 
 
 
104 aa  93.6  9e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 
146 aa  93.2  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
106 aa  92.8  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  44.66 
 
 
105 aa  92.4  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 
102 aa  92  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1050  50S ribosomal protein L21  49.48 
 
 
129 aa  91.7  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436024  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 
103 aa  91.3  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  47.12 
 
 
104 aa  90.1  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  44.12 
 
 
104 aa  90.1  8e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4884  ribosomal protein L21  44.55 
 
 
103 aa  90.1  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.125132  normal  0.112158 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0898  ribosomal protein L21  54.55 
 
 
99 aa  90.1  9e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.00000000443471  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 
102 aa  89.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  45.1 
 
 
102 aa  89.4  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0018  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
131 aa  89.7  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0793  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000236829  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4103  50S ribosomal protein L21  42.86 
 
 
140 aa  89  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  89.4  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 
103 aa  88.6  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  45.54 
 
 
103 aa  88.6  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 
136 aa  88.6  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 
131 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 
131 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  48.08 
 
 
105 aa  88.2  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 
104 aa  88.2  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0558  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 
103 aa  88.2  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000282146  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0473  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 
103 aa  88.2  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000637379  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 
103 aa  87.4  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
102 aa  87.4  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 
102 aa  87.4  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3479  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 
103 aa  87.4  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000647108  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 
104 aa  87.4  6e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  44.12 
 
 
104 aa  87  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 
103 aa  86.7  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.498603 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03051  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00856225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0521  ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111872  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3671  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000125607  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0514  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000928168  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3584  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  86.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.68689e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03002  hypothetical protein  41.18 
 
 
103 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00734484  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3379  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.03555e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3622  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  86.7  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000442245  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3482  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000216305  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4508  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000766256  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  44.12 
 
 
104 aa  86.3  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3352  50S ribosomal protein L21P  44.55 
 
 
101 aa  86.3  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000809209  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3601  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000243272  normal  0.724724 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 
124 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 
102 aa  85.5  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  42.16 
 
 
103 aa  85.5  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3494  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000360043  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 
103 aa  85.5  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 
103 aa  85.5  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3496  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 
103 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000280512  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3565  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  46.53 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  44.12 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 
102 aa  85.1  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  84.7  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  42.16 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  45.54 
 
 
132 aa  84.7  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 
102 aa  84.3  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  43.14 
 
 
103 aa  84.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  47.87 
 
 
103 aa  84.3  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  43.14 
 
 
103 aa  84.3  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  42.86 
 
 
115 aa  84.3  5e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  41 
 
 
102 aa  84.3  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  43.14 
 
 
131 aa  84.3  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 
103 aa  84.3  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3283  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
125 aa  84.3  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 
104 aa  84.3  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  84  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0507  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 
103 aa  83.6  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.527272 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>